MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Campylobacter coli 15-537360 plasmid pCC42yr

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022656	AGCAA	2	10	302	311	60 %	0 %	20 %	20 %	556561978
2	NC_022656	AATTA	2	10	2765	2774	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022656	ATTTT	2	10	3049	3058	20 %	80 %	0 %	0 %	556561983
4	NC_022656	GATAT	2	10	3133	3142	40 %	40 %	20 %	0 %	556561983
5	NC_022656	CAAAA	2	10	3377	3386	80 %	0 %	0 %	20 %	556561983
6	NC_022656	ATTTT	2	10	3952	3961	20 %	80 %	0 %	0 %	556561984
7	NC_022656	AAGCA	2	10	4547	4556	60 %	0 %	20 %	20 %	556561986
8	NC_022656	ACTTA	2	10	5732	5741	40 %	40 %	0 %	20 %	556561986
9	NC_022656	CAAAA	2	10	6172	6181	80 %	0 %	0 %	20 %	556561986
10	NC_022656	ATTTT	2	10	6993	7002	20 %	80 %	0 %	0 %	556561987
11	NC_022656	ATGCA	2	10	8977	8986	40 %	20 %	20 %	20 %	556561989
12	NC_022656	ATTTT	2	10	9690	9699	20 %	80 %	0 %	0 %	556561990
13	NC_022656	CAAAT	2	10	10990	10999	60 %	20 %	0 %	20 %	556561991
14	NC_022656	CAAAT	2	10	12546	12555	60 %	20 %	0 %	20 %	556561993
15	NC_022656	ATTTT	2	10	13006	13015	20 %	80 %	0 %	0 %	556561994
16	NC_022656	TTAAT	2	10	15977	15986	40 %	60 %	0 %	0 %	556561999
17	NC_022656	ACTTT	2	10	18162	18171	20 %	60 %	0 %	20 %	556562000
18	NC_022656	TGTGG	2	10	20304	20313	0 %	40 %	60 %	0 %	556562001
19	NC_022656	TTAAT	2	10	20610	20619	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022656	CTTTT	2	10	21620	21629	0 %	80 %	0 %	20 %	556562004
21	NC_022656	AAAAT	2	10	22118	22127	80 %	20 %	0 %	0 %	556562005
22	NC_022656	AAAGA	2	10	22423	22432	80 %	0 %	20 %	0 %	556562005
23	NC_022656	TGCTT	2	10	23690	23699	0 %	60 %	20 %	20 %	556562008
24	NC_022656	TTATT	2	10	24006	24015	20 %	80 %	0 %	0 %	556562009
25	NC_022656	TCTGA	2	10	24420	24429	20 %	40 %	20 %	20 %	556562009
26	NC_022656	CTTTT	2	10	25321	25330	0 %	80 %	0 %	20 %	556562009
27	NC_022656	ATATT	2	10	25364	25373	40 %	60 %	0 %	0 %	556562009
28	NC_022656	TTGTT	2	10	25684	25693	0 %	80 %	20 %	0 %	556562009
29	NC_022656	TGTTT	2	10	26253	26262	0 %	80 %	20 %	0 %	556562010

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.