MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Campylobacter coli 15-537360 plasmid pCC42yr

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022656	AATC	2	8	408	415	50 %	25 %	0 %	25 %	556561978
2	NC_022656	AGCC	2	8	566	573	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_022656	TTTA	2	8	687	694	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022656	AAAT	2	8	1136	1143	75 %	25 %	0 %	0 %	556561979
5	NC_022656	GAAA	2	8	1237	1244	75 %	0 %	25 %	0 %	556561980
6	NC_022656	ATTA	2	8	1397	1404	50 %	50 %	0 %	0 %	556561980
7	NC_022656	ACAA	2	8	1699	1706	75 %	0 %	0 %	25 %	556561980
8	NC_022656	ATTT	2	8	2161	2168	25 %	75 %	0 %	0 %	556561981
9	NC_022656	CAAG	2	8	3007	3014	50 %	0 %	25 %	25 %	556561983
10	NC_022656	AATT	2	8	3803	3810	50 %	50 %	0 %	0 %	556561983
11	NC_022656	GAAA	2	8	4683	4690	75 %	0 %	25 %	0 %	556561986
12	NC_022656	ATTG	2	8	4752	4759	25 %	50 %	25 %	0 %	556561986
13	NC_022656	GAAA	2	8	4836	4843	75 %	0 %	25 %	0 %	556561986
14	NC_022656	ATAA	2	8	4920	4927	75 %	25 %	0 %	0 %	556561986
15	NC_022656	CAAT	2	8	5653	5660	50 %	25 %	0 %	25 %	556561986
16	NC_022656	CTTG	2	8	5949	5956	0 %	50 %	25 %	25 %	556561986
17	NC_022656	TCAT	2	8	6059	6066	25 %	50 %	0 %	25 %	556561986
18	NC_022656	AAGT	2	8	6865	6872	50 %	25 %	25 %	0 %	556561986
19	NC_022656	ATTA	2	8	7042	7049	50 %	50 %	0 %	0 %	556561987
20	NC_022656	CGAG	2	8	7137	7144	25 %	0 %	50 %	25 %	556561987
21	NC_022656	AATC	2	8	7393	7400	50 %	25 %	0 %	25 %	556561987
22	NC_022656	TTCA	2	8	7866	7873	25 %	50 %	0 %	25 %	556561988
23	NC_022656	AGAA	2	8	7905	7912	75 %	0 %	25 %	0 %	556561988
24	NC_022656	AAAG	2	8	8296	8303	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022656	AGGT	2	8	8322	8329	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022656	CTAA	2	8	8501	8508	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_022656	AATC	2	8	8566	8573	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_022656	ATAA	2	8	8605	8612	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022656	AAAG	2	8	8652	8659	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022656	GATA	2	8	9264	9271	50 %	25 %	25 %	0 %	556561989
31	NC_022656	AAAC	2	8	9286	9293	75 %	0 %	0 %	25 %	556561989
32	NC_022656	ATGA	2	8	9833	9840	50 %	25 %	25 %	0 %	556561990
33	NC_022656	TCTT	2	8	9973	9980	0 %	75 %	0 %	25 %	556561991
34	NC_022656	TTTA	2	8	10214	10221	25 %	75 %	0 %	0 %	556561991
35	NC_022656	AATG	2	8	10472	10479	50 %	25 %	25 %	0 %	556561991
36	NC_022656	AGGT	2	8	10561	10568	25 %	25 %	50 %	0 %	556561991
37	NC_022656	GATA	2	8	10616	10623	50 %	25 %	25 %	0 %	556561991
38	NC_022656	CAAT	2	8	10624	10631	50 %	25 %	0 %	25 %	556561991
39	NC_022656	ATCA	2	8	11089	11096	50 %	25 %	0 %	25 %	556561991
40	NC_022656	TATT	2	8	11463	11470	25 %	75 %	0 %	0 %	556561992
41	NC_022656	TTCT	2	8	11711	11718	0 %	75 %	0 %	25 %	556561992
42	NC_022656	CTTT	2	8	12080	12087	0 %	75 %	0 %	25 %	556561993
43	NC_022656	TATT	2	8	12105	12112	25 %	75 %	0 %	0 %	556561993
44	NC_022656	ACAA	2	8	12448	12455	75 %	0 %	0 %	25 %	556561993
45	NC_022656	TTCA	2	8	12532	12539	25 %	50 %	0 %	25 %	556561993
46	NC_022656	CAAA	2	8	12927	12934	75 %	0 %	0 %	25 %	556561993
47	NC_022656	CTTT	2	8	13028	13035	0 %	75 %	0 %	25 %	556561994
48	NC_022656	AATT	2	8	13932	13939	50 %	50 %	0 %	0 %	556561995
49	NC_022656	CAAT	2	8	13979	13986	50 %	25 %	0 %	25 %	556561995
50	NC_022656	CAAA	2	8	14021	14028	75 %	0 %	0 %	25 %	556561995
51	NC_022656	TCAA	2	8	14292	14299	50 %	25 %	0 %	25 %	556561995
52	NC_022656	TGAT	2	8	14682	14689	25 %	50 %	25 %	0 %	556561995
53	NC_022656	TTAC	2	8	15183	15190	25 %	50 %	0 %	25 %	556561996
54	NC_022656	AACT	2	8	15540	15547	50 %	25 %	0 %	25 %	556561997
55	NC_022656	AGAT	2	8	15606	15613	50 %	25 %	25 %	0 %	556561997
56	NC_022656	ACAA	2	8	15637	15644	75 %	0 %	0 %	25 %	556561997
57	NC_022656	ACAA	2	8	15946	15953	75 %	0 %	0 %	25 %	556561999
58	NC_022656	CTTA	2	8	16015	16022	25 %	50 %	0 %	25 %	556561999
59	NC_022656	GAAA	2	8	16383	16390	75 %	0 %	25 %	0 %	556561999
60	NC_022656	TCTT	2	8	16689	16696	0 %	75 %	0 %	25 %	556561999
61	NC_022656	ACTT	2	8	16789	16796	25 %	50 %	0 %	25 %	556561999
62	NC_022656	ATCA	2	8	16916	16923	50 %	25 %	0 %	25 %	556561999
63	NC_022656	AAAT	2	8	17183	17190	75 %	25 %	0 %	0 %	556561999
64	NC_022656	AAAG	2	8	18384	18391	75 %	0 %	25 %	0 %	556562000
65	NC_022656	CAAA	2	8	19507	19514	75 %	0 %	0 %	25 %	556562000
66	NC_022656	TGAT	2	8	20907	20914	25 %	50 %	25 %	0 %	556562002
67	NC_022656	TAAA	2	8	21012	21019	75 %	25 %	0 %	0 %	556562003
68	NC_022656	AAAG	2	8	21020	21027	75 %	0 %	25 %	0 %	556562003
69	NC_022656	TTTC	2	8	21633	21640	0 %	75 %	0 %	25 %	556562004
70	NC_022656	AGAA	2	8	21778	21785	75 %	0 %	25 %	0 %	556562004
71	NC_022656	ATTA	2	8	22082	22089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022656	TGAA	2	8	22307	22314	50 %	25 %	25 %	0 %	556562005
73	NC_022656	TCAA	2	8	22765	22772	50 %	25 %	0 %	25 %	556562006
74	NC_022656	TAGA	2	8	23124	23131	50 %	25 %	25 %	0 %	556562006
75	NC_022656	TATT	2	8	23673	23680	25 %	75 %	0 %	0 %	556562008
76	NC_022656	AAAT	2	8	24025	24032	75 %	25 %	0 %	0 %	556562009
77	NC_022656	GTTT	2	8	24077	24084	0 %	75 %	25 %	0 %	556562009
78	NC_022656	TTCA	2	8	24091	24098	25 %	50 %	0 %	25 %	556562009
79	NC_022656	ATGT	2	8	25525	25532	25 %	50 %	25 %	0 %	556562009
80	NC_022656	TTTG	2	8	26012	26019	0 %	75 %	25 %	0 %	556562010
81	NC_022656	AACC	2	8	26048	26055	50 %	0 %	0 %	50 %	556562010
82	NC_022656	AGTC	2	8	26234	26241	25 %	25 %	25 %	25 %	556562010

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.