MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Campylobacter coli 15-537360 plasmid pCC42yr

Total Repeats: 327

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022656	TTA	2	6	68	73	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022656	TTA	2	6	127	132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022656	TTC	2	6	228	233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561978
4	NC_022656	ATA	2	6	262	267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561978
5	NC_022656	TAA	2	6	344	349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561978
6	NC_022656	TAT	2	6	517	522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561978
7	NC_022656	TAT	2	6	706	711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022656	CTT	2	6	766	771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_022656	TTG	2	6	880	885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022656	AAG	2	6	887	892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022656	AAG	2	6	980	985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022656	CCA	2	6	1053	1058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_022656	CCA	2	6	1074	1079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_022656	GTG	2	6	1098	1103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556561979
15	NC_022656	ATT	2	6	1109	1114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561979
16	NC_022656	ATA	2	6	1200	1205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561979
17	NC_022656	TAG	2	6	1245	1250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561980
18	NC_022656	ATA	2	6	1305	1310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561980
19	NC_022656	TAC	2	6	1324	1329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561980
20	NC_022656	GAT	2	6	1367	1372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561980
21	NC_022656	TTA	2	6	1374	1379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561980
22	NC_022656	AGT	2	6	1438	1443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561980
23	NC_022656	ATG	2	6	1448	1453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561980
24	NC_022656	AAC	2	6	1602	1607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561980
25	NC_022656	AAG	2	6	1608	1613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561980
26	NC_022656	ATT	2	6	1806	1811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561980
27	NC_022656	ATT	2	6	1862	1867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561980
28	NC_022656	CTT	2	6	1926	1931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561980
29	NC_022656	AAG	2	6	1956	1961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561980
30	NC_022656	TGG	2	6	1984	1989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556561980
31	NC_022656	AAG	2	6	2064	2069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561980
32	NC_022656	GAA	2	6	2122	2127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561981
33	NC_022656	CAA	2	6	2143	2148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561981
34	NC_022656	ATT	2	6	2342	2347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561981
35	NC_022656	TGT	2	6	2410	2415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556561981
36	NC_022656	TCT	2	6	2693	2698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_022656	ATA	2	6	2778	2783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022656	TAA	2	6	2784	2789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022656	AAT	2	6	2880	2885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022656	CTT	2	6	3199	3204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561983
41	NC_022656	TGA	2	6	3345	3350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561983
42	NC_022656	GTT	2	6	3430	3435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556561983
43	NC_022656	ATT	2	6	3475	3480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561983
44	NC_022656	AAG	2	6	3665	3670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561983
45	NC_022656	GGA	2	6	3709	3714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556561983
46	NC_022656	GGA	2	6	3745	3750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556561983
47	NC_022656	CAA	2	6	3782	3787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561983
48	NC_022656	AGG	2	6	3851	3856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556561983
49	NC_022656	CAA	2	6	3992	3997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561984
50	NC_022656	TAT	2	6	4068	4073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561984
51	NC_022656	TTA	2	6	4136	4141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561984
52	NC_022656	TAG	2	6	4178	4183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561984
53	NC_022656	CAA	2	6	4211	4216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561984
54	NC_022656	GAA	2	6	4236	4241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561985
55	NC_022656	CAA	2	6	4271	4276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561985
56	NC_022656	TAT	2	6	4485	4490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561985
57	NC_022656	CAA	2	6	4613	4618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561986
58	NC_022656	TAT	2	6	4644	4649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561986
59	NC_022656	ATT	2	6	4846	4851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561986
60	NC_022656	TGA	2	6	4939	4944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561986
61	NC_022656	AGA	2	6	5018	5023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561986
62	NC_022656	ATA	2	6	5083	5088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561986
63	NC_022656	GAT	2	6	5103	5108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561986
64	NC_022656	TAC	2	6	5158	5163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561986
65	NC_022656	ATT	2	6	5253	5258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561986
66	NC_022656	GAC	2	6	5358	5363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561986
67	NC_022656	TAA	2	6	5384	5389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561986
68	NC_022656	CAA	2	6	5406	5411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561986
69	NC_022656	GAT	2	6	5463	5468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561986
70	NC_022656	TAT	2	6	5541	5546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561986
71	NC_022656	TCC	2	6	5804	5809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556561986
72	NC_022656	TCC	2	6	5906	5911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556561986
73	NC_022656	ATG	2	6	6043	6048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561986
74	NC_022656	ATT	2	6	6286	6291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561986
75	NC_022656	GGT	2	6	6309	6314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556561986
76	NC_022656	AGA	2	6	6374	6379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561986
77	NC_022656	TGA	2	6	6382	6387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561986
78	NC_022656	TCA	2	6	6472	6477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561986
79	NC_022656	TGA	2	6	6479	6484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561986
80	NC_022656	CTA	2	6	6640	6645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561986
81	NC_022656	AAT	2	6	6756	6761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561986
82	NC_022656	ATT	2	6	6781	6786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561986
83	NC_022656	CAA	2	6	6850	6855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561986
84	NC_022656	AGA	2	6	6932	6937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561986
85	NC_022656	TGA	2	6	7066	7071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561987
86	NC_022656	AGT	2	6	7121	7126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561987
87	NC_022656	TCT	2	6	7151	7156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561987
88	NC_022656	AAG	2	6	7210	7215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561987
89	NC_022656	AGA	2	6	7258	7263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561987
90	NC_022656	GAT	2	6	7286	7291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561987
91	NC_022656	ATT	2	6	7329	7334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561987
92	NC_022656	AAG	2	6	7357	7362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561987
93	NC_022656	CAA	2	6	7535	7540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561987
94	NC_022656	TAT	2	6	7613	7618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561987
95	NC_022656	AAG	2	6	7703	7708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561988
96	NC_022656	AAG	2	6	7976	7981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561988
97	NC_022656	ATT	2	6	8032	8037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561988
98	NC_022656	TAA	2	6	8070	8075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561988
99	NC_022656	ATT	2	6	8110	8115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561988
100	NC_022656	CAA	2	6	8343	8348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_022656	TAA	2	6	8361	8366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022656	TAT	3	9	8375	8383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022656	ATA	2	6	8386	8391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022656	TAA	2	6	8395	8400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022656	TAA	2	6	8674	8679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022656	TAT	3	9	8688	8696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022656	TAG	2	6	8700	8705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022656	TAA	2	6	8708	8713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022656	CTT	2	6	8746	8751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_022656	CAA	2	6	8878	8883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561989
111	NC_022656	TAA	2	6	8909	8914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561989
112	NC_022656	GGT	2	6	8925	8930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556561989
113	NC_022656	CAA	2	6	8991	8996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561989
114	NC_022656	AGA	2	6	9077	9082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561989
115	NC_022656	CAA	2	6	9229	9234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561989
116	NC_022656	CAA	2	6	9318	9323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561989
117	NC_022656	CCA	2	6	9424	9429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556561989
118	NC_022656	TGA	2	6	9452	9457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561989
119	NC_022656	TTA	2	6	9478	9483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561989
120	NC_022656	ATT	2	6	9508	9513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561989
121	NC_022656	AAT	2	6	9525	9530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561989
122	NC_022656	AGA	2	6	9569	9574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561989
123	NC_022656	ATG	2	6	9637	9642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022656	TGG	2	6	9700	9705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556561990
125	NC_022656	ATT	2	6	9768	9773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561990
126	NC_022656	CAA	2	6	9845	9850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561990
127	NC_022656	AGA	2	6	9886	9891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561990
128	NC_022656	ATA	2	6	10029	10034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561991
129	NC_022656	TTA	2	6	10063	10068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561991
130	NC_022656	TTA	2	6	10102	10107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561991
131	NC_022656	TTA	2	6	10177	10182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561991
132	NC_022656	ATT	2	6	10242	10247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561991
133	NC_022656	AAT	2	6	10281	10286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561991
134	NC_022656	ATT	2	6	10344	10349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561991
135	NC_022656	ATT	2	6	10407	10412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561991
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252	NC_022656	ATA	2	6	20637	20642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.