MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Campylobacter coli 15-537360 plasmid pCC42yr

Total Repeats: 139

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022656	A	6	6	384	389	100 %	0 %	0 %	0 %	556561978
2	NC_022656	A	7	7	467	473	100 %	0 %	0 %	0 %	556561978
3	NC_022656	A	6	6	605	610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022656	A	6	6	951	956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022656	T	6	6	957	962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022656	A	8	8	996	1003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022656	A	6	6	1120	1125	100 %	0 %	0 %	0 %	556561979
8	NC_022656	A	6	6	1148	1153	100 %	0 %	0 %	0 %	556561979
9	NC_022656	T	7	7	1158	1164	0 %	100 %	0 %	0 %	556561979
10	NC_022656	T	6	6	1181	1186	0 %	100 %	0 %	0 %	556561979
11	NC_022656	A	6	6	1190	1195	100 %	0 %	0 %	0 %	556561979
12	NC_022656	A	6	6	1220	1225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022656	A	6	6	1356	1361	100 %	0 %	0 %	0 %	556561980
14	NC_022656	A	7	7	1520	1526	100 %	0 %	0 %	0 %	556561980
15	NC_022656	A	6	6	1874	1879	100 %	0 %	0 %	0 %	556561980
16	NC_022656	T	7	7	2087	2093	0 %	100 %	0 %	0 %	556561981
17	NC_022656	T	6	6	2166	2171	0 %	100 %	0 %	0 %	556561981
18	NC_022656	T	6	6	2195	2200	0 %	100 %	0 %	0 %	556561981
19	NC_022656	A	6	6	2236	2241	100 %	0 %	0 %	0 %	556561981
20	NC_022656	A	6	6	2434	2439	100 %	0 %	0 %	0 %	556561981
21	NC_022656	A	7	7	2574	2580	100 %	0 %	0 %	0 %	556561982
22	NC_022656	A	6	6	2626	2631	100 %	0 %	0 %	0 %	556561982
23	NC_022656	A	8	8	2656	2663	100 %	0 %	0 %	0 %	556561982
24	NC_022656	T	6	6	2671	2676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022656	A	6	6	2679	2684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022656	A	6	6	2700	2705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022656	A	6	6	2752	2757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022656	T	6	6	2817	2822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022656	A	6	6	2826	2831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022656	A	8	8	2934	2941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022656	A	6	6	3023	3028	100 %	0 %	0 %	0 %	556561983
32	NC_022656	A	7	7	3318	3324	100 %	0 %	0 %	0 %	556561983
33	NC_022656	A	6	6	3940	3945	100 %	0 %	0 %	0 %	556561984
34	NC_022656	T	6	6	4205	4210	0 %	100 %	0 %	0 %	556561984
35	NC_022656	T	8	8	4392	4399	0 %	100 %	0 %	0 %	556561985
36	NC_022656	A	6	6	4476	4481	100 %	0 %	0 %	0 %	556561985
37	NC_022656	A	6	6	4958	4963	100 %	0 %	0 %	0 %	556561986
38	NC_022656	A	6	6	5149	5154	100 %	0 %	0 %	0 %	556561986
39	NC_022656	A	6	6	5397	5402	100 %	0 %	0 %	0 %	556561986
40	NC_022656	A	6	6	5410	5415	100 %	0 %	0 %	0 %	556561986
41	NC_022656	A	8	8	6178	6185	100 %	0 %	0 %	0 %	556561986
42	NC_022656	T	6	6	6314	6319	0 %	100 %	0 %	0 %	556561986
43	NC_022656	A	6	6	6675	6680	100 %	0 %	0 %	0 %	556561986
44	NC_022656	A	6	6	6769	6774	100 %	0 %	0 %	0 %	556561986
45	NC_022656	A	8	8	7009	7016	100 %	0 %	0 %	0 %	556561987
46	NC_022656	A	6	6	7184	7189	100 %	0 %	0 %	0 %	556561987
47	NC_022656	A	6	6	7620	7625	100 %	0 %	0 %	0 %	556561987
48	NC_022656	T	6	6	7736	7741	0 %	100 %	0 %	0 %	556561988
49	NC_022656	A	6	6	8061	8066	100 %	0 %	0 %	0 %	556561988
50	NC_022656	A	6	6	8219	8224	100 %	0 %	0 %	0 %	556561988
51	NC_022656	A	7	7	8541	8547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022656	A	6	6	8844	8849	100 %	0 %	0 %	0 %	556561989
53	NC_022656	A	7	7	8864	8870	100 %	0 %	0 %	0 %	556561989
54	NC_022656	A	6	6	9589	9594	100 %	0 %	0 %	0 %	556561989
55	NC_022656	T	6	6	9730	9735	0 %	100 %	0 %	0 %	556561990
56	NC_022656	A	7	7	9818	9824	100 %	0 %	0 %	0 %	556561990
57	NC_022656	A	6	6	9906	9911	100 %	0 %	0 %	0 %	556561990
58	NC_022656	A	6	6	10182	10187	100 %	0 %	0 %	0 %	556561991
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60	NC_022656	A	7	7	11122	11128	100 %	0 %	0 %	0 %	556561991
61	NC_022656	A	7	7	11134	11140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022656	A	6	6	11424	11429	100 %	0 %	0 %	0 %	556561992
63	NC_022656	A	7	7	11582	11588	100 %	0 %	0 %	0 %	556561992
64	NC_022656	A	6	6	11784	11789	100 %	0 %	0 %	0 %	556561992
65	NC_022656	A	6	6	12052	12057	100 %	0 %	0 %	0 %	556561993
66	NC_022656	A	6	6	12074	12079	100 %	0 %	0 %	0 %	556561993
67	NC_022656	A	8	8	12174	12181	100 %	0 %	0 %	0 %	556561993
68	NC_022656	A	6	6	12748	12753	100 %	0 %	0 %	0 %	556561993
69	NC_022656	A	6	6	12903	12908	100 %	0 %	0 %	0 %	556561993
70	NC_022656	T	6	6	13174	13179	0 %	100 %	0 %	0 %	556561994
71	NC_022656	A	7	7	13236	13242	100 %	0 %	0 %	0 %	556561994
72	NC_022656	A	6	6	13270	13275	100 %	0 %	0 %	0 %	556561994
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74	NC_022656	A	6	6	13846	13851	100 %	0 %	0 %	0 %	556561995
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91	NC_022656	A	6	6	16828	16833	100 %	0 %	0 %	0 %	556561999
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104	NC_022656	A	7	7	18867	18873	100 %	0 %	0 %	0 %	556562000
105	NC_022656	T	7	7	19223	19229	0 %	100 %	0 %	0 %	556562000
106	NC_022656	A	6	6	19566	19571	100 %	0 %	0 %	0 %	556562000
107	NC_022656	A	6	6	19689	19694	100 %	0 %	0 %	0 %	556562000
108	NC_022656	T	6	6	19938	19943	0 %	100 %	0 %	0 %	556562001
109	NC_022656	A	7	7	20099	20105	100 %	0 %	0 %	0 %	556562001
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111	NC_022656	T	6	6	20651	20656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022656	A	6	6	20725	20730	100 %	0 %	0 %	0 %	556562002
113	NC_022656	A	6	6	20855	20860	100 %	0 %	0 %	0 %	556562002
114	NC_022656	A	6	6	20887	20892	100 %	0 %	0 %	0 %	556562002
115	NC_022656	A	6	6	21050	21055	100 %	0 %	0 %	0 %	556562003
116	NC_022656	A	6	6	21454	21459	100 %	0 %	0 %	0 %	556562003
117	NC_022656	T	6	6	21658	21663	0 %	100 %	0 %	0 %	556562004
118	NC_022656	A	6	6	21794	21799	100 %	0 %	0 %	0 %	556562004
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120	NC_022656	A	7	7	22031	22037	100 %	0 %	0 %	0 %	556562004
121	NC_022656	A	6	6	22132	22137	100 %	0 %	0 %	0 %	556562005
122	NC_022656	A	7	7	22158	22164	100 %	0 %	0 %	0 %	556562005
123	NC_022656	T	6	6	22236	22241	0 %	100 %	0 %	0 %	556562005
124	NC_022656	A	8	8	22242	22249	100 %	0 %	0 %	0 %	556562005
125	NC_022656	A	6	6	22406	22411	100 %	0 %	0 %	0 %	556562005
126	NC_022656	T	6	6	22746	22751	0 %	100 %	0 %	0 %	556562006
127	NC_022656	T	6	6	23059	23064	0 %	100 %	0 %	0 %	556562006
128	NC_022656	A	6	6	23108	23113	100 %	0 %	0 %	0 %	556562006
129	NC_022656	A	6	6	23311	23316	100 %	0 %	0 %	0 %	556562007
130	NC_022656	A	6	6	23334	23339	100 %	0 %	0 %	0 %	556562007
131	NC_022656	T	7	7	23698	23704	0 %	100 %	0 %	0 %	556562008
132	NC_022656	T	7	7	23848	23854	0 %	100 %	0 %	0 %	556562009
133	NC_022656	T	6	6	24205	24210	0 %	100 %	0 %	0 %	556562009
134	NC_022656	T	7	7	24249	24255	0 %	100 %	0 %	0 %	556562009
135	NC_022656	T	6	6	24350	24355	0 %	100 %	0 %	0 %	556562009
136	NC_022656	A	6	6	24794	24799	100 %	0 %	0 %	0 %	556562009
137	NC_022656	T	6	6	24976	24981	0 %	100 %	0 %	0 %	556562009
138	NC_022656	T	6	6	25281	25286	0 %	100 %	0 %	0 %	556562009
139	NC_022656	T	7	7	26260	26266	0 %	100 %	0 %	0 %	556562010

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.