MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae A026 genome

Total Repeats: 146

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022655	GAAGTG	2	12	595	606	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022655	ACTAAT	2	12	625	636	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_022655	TCTTGT	2	12	1281	1292	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_022655	AGTTGA	2	12	1945	1956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022655	AGGTTG	2	12	6087	6098	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022655	TAAAAA	2	12	19836	19847	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022655	TTCTAT	2	12	43419	43430	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_022655	TCCCAT	2	12	49268	49279	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_022655	TAAAAT	2	12	51645	51656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022655	TAAAAA	2	12	68352	68363	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022655	TTTTGA	2	12	71718	71729	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022655	AAGCAG	2	12	72246	72257	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_022655	TTATGT	2	12	75512	75523	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022655	AAGCAG	2	12	76303	76314	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_022655	ATAAAA	2	12	105125	105136	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022655	ATAAAA	2	12	114715	114726	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022655	GAAGCA	2	12	125967	125978	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_022655	ATCTAT	2	12	157076	157087	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_022655	CACTAA	2	12	161426	161437	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_022655	ATTTTG	2	12	168257	168268	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022655	TTTTAC	2	12	177801	177812	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_022655	AGATAA	2	12	204355	204366	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022655	CATAAT	2	12	206422	206433	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_022655	TCTTAA	2	12	222930	222941	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_022655	GGTTGC	2	12	239738	239749	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_022655	TCTTGT	2	12	274269	274280	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_022655	GAAAAA	2	12	308929	308940	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022655	ACAAGA	2	12	315603	315614	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_022655	TCTATC	2	12	316249	316260	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_022655	GCAGTT	2	12	349741	349752	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_022655	AGAAAT	2	12	397747	397758	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022655	ATGAAG	2	12	408576	408587	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022655	AGTTGA	2	12	433951	433962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022655	GCTTGC	2	12	452699	452710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_022655	GTTTTT	2	12	472242	472253	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022655	TTTTTC	2	12	473047	473058	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_022655	CTTGAA	2	12	494370	494381	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_022655	AGTGGA	2	12	496354	496365	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022655	TAAAAA	2	12	499394	499405	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022655	TGCTTT	2	12	503502	503513	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_022655	ATTAAT	2	12	518905	518916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022655	AAAATG	2	12	522890	522901	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022655	TCTTTT	2	12	533961	533972	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_022655	AAAGTT	2	12	583917	583928	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022655	ACTTCT	2	12	600659	600670	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_022655	GAGATG	2	12	603117	603128	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022655	CATCTC	2	12	742549	742560	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_022655	AGTTGA	2	12	742668	742679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022655	AAAGGA	2	12	755876	755887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022655	CTAATA	2	12	764158	764169	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_022655	ACCATC	2	12	772588	772599	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_022655	TTTCAA	2	12	801328	801339	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_022655	TACCTA	2	12	812304	812315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_022655	ATTTTT	2	12	837297	837308	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022655	TGATTG	2	12	868351	868362	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022655	AAATAA	2	12	868483	868494	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022655	AACAAA	2	12	932756	932767	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_022655	AAACAA	2	12	941936	941947	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_022655	CATTAC	2	12	948889	948900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_022655	TCACTA	2	12	951256	951267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_022655	TAAAAA	2	12	981603	981614	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022655	TTAAAA	2	12	986136	986147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022655	TGTCAA	2	12	992642	992653	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_022655	AAGAAA	2	12	993948	993959	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022655	AAAGTA	2	12	994728	994739	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022655	ATTCGA	2	12	998947	998958	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_022655	AGCCTT	2	12	1000221	1000232	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_022655	CCAGAT	2	12	1000297	1000308	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_022655	AGATAA	2	12	1002155	1002166	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022655	CATCTC	2	12	1019093	1019104	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_022655	AGTTGA	2	12	1019212	1019223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022655	CATCTC	2	12	1038554	1038565	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_022655	AGTTGA	2	12	1038673	1038684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022655	AGTTGA	2	12	1067856	1067867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022655	TCTATC	2	12	1068937	1068948	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_022655	ATAGCC	2	12	1096119	1096130	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_022655	ACCAGC	2	12	1096424	1096435	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
78	NC_022655	AATTTT	2	12	1101463	1101474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022655	GTAATG	2	12	1104513	1104524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022655	TTATGA	2	12	1104655	1104666	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022655	AAGAAA	2	12	1107828	1107839	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022655	TCTATC	2	12	1110732	1110743	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_022655	TCAACT	2	12	1111587	1111598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_022655	GAGATG	2	12	1111706	1111717	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022655	CTTTTT	2	12	1119588	1119599	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_022655	GAAATA	2	12	1119636	1119647	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022655	TAAAAA	2	12	1131122	1131133	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022655	CTTGGT	2	12	1150404	1150415	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_022655	CTTTTT	2	12	1151267	1151278	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_022655	TTTATA	2	12	1200709	1200720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022655	TTTTAA	2	12	1204191	1204202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022655	TATCTA	2	12	1210790	1210801	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_022655	ATAAAA	2	12	1228269	1228280	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022655	CCCGAA	2	12	1241254	1241265	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_022655	GTTTTT	2	12	1264445	1264456	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022655	TCTATC	2	12	1277543	1277554	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_022655	TCTTTT	2	12	1282501	1282512	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_022655	TGAAAA	2	12	1292378	1292389	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022655	ATCCTT	2	12	1314045	1314056	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_022655	TGTATT	2	12	1321096	1321107	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022655	ACTAAA	2	12	1322862	1322873	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_022655	AAATTT	2	12	1339331	1339342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022655	CTTTCT	2	12	1443334	1443345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_022655	CCGTTT	2	12	1449919	1449930	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_022655	AAAAAC	2	12	1450085	1450096	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_022655	GATTGC	2	12	1458403	1458414	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_022655	TTAAAA	2	12	1506415	1506426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022655	CTAGAG	2	12	1519112	1519123	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_022655	CCTAAG	2	12	1541548	1541559	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_022655	AACTTG	2	12	1541671	1541682	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_022655	ATTTGA	2	12	1564324	1564335	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022655	TAATCA	2	12	1572294	1572305	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_022655	CACTTC	2	12	1590039	1590050	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_022655	AAAAAT	2	12	1601308	1601319	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022655	GAACAT	2	12	1613596	1613607	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_022655	CTTTCT	2	12	1635497	1635508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_022655	TAGGCT	2	12	1636428	1636439	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_022655	TCATTA	2	12	1646883	1646894	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_022655	TAATCA	2	12	1665682	1665693	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_022655	TCAACT	2	12	1671499	1671510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_022655	GAGATG	2	12	1671618	1671629	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022655	TATTAG	2	12	1693574	1693585	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022655	CACTTC	2	12	1693605	1693616	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_022655	TCCTTA	2	12	1696693	1696704	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_022655	TGGGCT	2	12	1703971	1703982	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_022655	AATTGA	2	12	1719937	1719948	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022655	AAAAAC	2	12	1729348	1729359	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_022655	AAAGTC	2	12	1731307	1731318	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_022655	CCAGAA	2	12	1734461	1734472	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_022655	ATTCCA	2	12	1787200	1787211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_022655	AAAAAT	2	12	1808633	1808644	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022655	TATTAG	2	12	1822470	1822481	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022655	CACTTC	2	12	1822501	1822512	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_022655	TCCTTA	2	12	1825589	1825600	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_022655	TCTATC	2	12	1835238	1835249	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_022655	ATGATT	2	12	1838584	1838595	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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138	NC_022655	TATTAG	2	12	1884525	1884536	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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140	NC_022655	TCCTTA	2	12	1887644	1887655	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.