MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae A026 genome

Total Repeats: 388

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022655	AGGGA	2	10	484	493	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022655	TTGAA	2	10	688	697	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022655	CTTTT	2	10	4242	4251	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_022655	AAAAG	2	10	9969	9978	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022655	AATCA	2	10	11274	11283	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_022655	AGAGG	2	10	22962	22971	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022655	TTTAT	2	10	43281	43290	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022655	ATTCA	2	10	49197	49206	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_022655	TTATC	2	10	51719	51728	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_022655	TATCA	2	10	54964	54973	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_022655	GAAAG	2	10	56820	56829	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022655	GCGGT	2	10	58061	58070	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
13	NC_022655	ATAAA	2	10	66056	66065	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022655	TAACC	2	10	66154	66163	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_022655	TGCTT	2	10	71673	71682	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_022655	TGGCT	2	10	71856	71865	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_022655	GGTAT	2	10	72438	72447	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022655	ATTAT	2	10	75414	75423	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022655	CTATT	2	10	75430	75439	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_022655	TTATT	2	10	75542	75551	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022655	GGCTT	2	10	86375	86384	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_022655	AAATG	2	10	87844	87853	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022655	AAACT	2	10	95848	95857	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_022655	AAATT	2	10	96857	96866	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022655	AGGAT	2	10	96888	96897	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022655	GCTTT	2	10	98201	98210	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_022655	TATTG	2	10	98238	98247	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022655	TAAAA	2	10	104063	104072	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022655	ATTAA	2	10	107729	107738	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022655	ACATG	2	10	114637	114646	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_022655	GAAAA	2	10	115229	115238	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022655	ATGTT	2	10	125944	125953	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022655	ACAAA	2	10	126458	126467	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_022655	TATAA	2	10	141330	141339	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022655	TGAAA	2	10	142702	142711	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022655	ATTTC	2	10	144228	144237	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_022655	CCCTG	2	10	151478	151487	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
38	NC_022655	GCTTT	2	10	157347	157356	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_022655	ACAAA	2	10	167487	167496	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_022655	AAGGA	2	10	191956	191965	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022655	GTTCA	2	10	193590	193599	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_022655	ATCGA	2	10	198145	198154	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_022655	AAGAT	2	10	203815	203824	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022655	ATTCT	2	10	207539	207548	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_022655	CTATC	2	10	208761	208770	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_022655	CTTTT	2	10	222565	222574	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_022655	CTTAA	2	10	224922	224931	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_022655	AAGCC	2	10	238522	238531	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_022655	AATAG	2	10	240068	240077	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022655	TGATA	2	10	249200	249209	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022655	TATAA	2	10	258320	258329	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022655	AGAAT	2	10	268062	268071	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022655	GTTAA	2	10	272103	272112	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022655	TTTAA	2	10	273662	273671	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022655	TTTAT	2	10	276750	276759	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022655	TAAAG	2	10	281724	281733	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022655	CTTTT	2	10	285406	285415	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_022655	AGAAC	2	10	289629	289638	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_022655	AAATA	2	10	302099	302108	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022655	TGCTT	2	10	315475	315484	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_022655	ATAAA	2	10	347576	347585	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022655	TTTTC	2	10	361448	361457	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_022655	TTCTG	2	10	367781	367790	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_022655	TAAAA	2	10	379734	379743	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022655	TATCT	2	10	391133	391142	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_022655	GACTG	2	10	406793	406802	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_022655	TGATT	2	10	408850	408859	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022655	CTGAC	2	10	414479	414488	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_022655	TCCAG	2	10	414504	414513	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_022655	ATATA	2	10	415453	415462	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022655	AAATA	2	10	417740	417749	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022655	AGAAA	2	10	417761	417770	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022655	TTGTC	2	10	423374	423383	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_022655	ATACT	3	15	423598	423612	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_022655	CTGGT	2	10	430110	430119	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_022655	GAAAG	2	10	432905	432914	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022655	AAGCT	2	10	432966	432975	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_022655	TCTTT	2	10	433222	433231	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_022655	TTTAT	2	10	437560	437569	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022655	ATTTA	2	10	437673	437682	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022655	ATTGG	2	10	438169	438178	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022655	AAGAG	2	10	449413	449422	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022655	CAGGG	2	10	452741	452750	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
84	NC_022655	TGAAA	2	10	458073	458082	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022655	CTATT	2	10	460143	460152	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_022655	AATAA	2	10	465396	465405	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022655	CTTTT	2	10	466664	466673	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_022655	TAAAA	2	10	466677	466686	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022655	TGTTT	2	10	469549	469558	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022655	GCATA	2	10	472323	472332	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_022655	CTTTC	2	10	474637	474646	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
92	NC_022655	ATAAA	2	10	477017	477026	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022655	AGCGA	2	10	480153	480162	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_022655	TTGCC	2	10	483892	483901	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
95	NC_022655	ATTCA	2	10	484482	484491	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_022655	TACTG	2	10	485255	485264	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_022655	ATATA	2	10	485272	485281	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022655	TTCTT	2	10	487836	487845	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_022655	CTAAG	2	10	491990	491999	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_022655	GATAA	2	10	492220	492229	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022655	AAATG	2	10	497505	497514	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022655	AAAAG	2	10	498278	498287	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022655	GTATA	3	15	498347	498361	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022655	GTCCT	2	10	503783	503792	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_022655	TATAA	2	10	510735	510744	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022655	CTTTT	2	10	513551	513560	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_022655	TTTTA	2	10	513632	513641	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022655	GCAGA	2	10	513744	513753	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_022655	GGGTT	2	10	517954	517963	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022655	GATTA	2	10	518367	518376	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022655	GATGG	2	10	518460	518469	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022655	CAAAT	2	10	519273	519282	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_022655	AGATG	2	10	522693	522702	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022655	TTTTA	2	10	523039	523048	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022655	TTTAT	2	10	527280	527289	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022655	AGGAA	2	10	529359	529368	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022655	ATAAA	2	10	537345	537354	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022655	TTAGT	2	10	541723	541732	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022655	ATATA	2	10	549315	549324	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022655	TAGTA	2	10	552545	552554	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022655	ATAAC	2	10	552611	552620	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_022655	TAAAA	2	10	562417	562426	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022655	ATTAT	2	10	572583	572592	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022655	ACTTC	2	10	590504	590513	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_022655	AAACA	2	10	590920	590929	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_022655	ATATA	2	10	593751	593760	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022655	ATTTC	2	10	600723	600732	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_022655	GAAAA	2	10	631976	631985	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022655	GTTAT	2	10	632015	632024	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022655	CGTAG	2	10	647211	647220	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
131	NC_022655	CTTAG	2	10	648442	648451	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_022655	CTTAG	2	10	653588	653597	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_022655	CTTTT	2	10	660184	660193	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_022655	ATTTT	2	10	672993	673002	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022655	AGGGG	2	10	676291	676300	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022655	CCCTG	2	10	676377	676386	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
137	NC_022655	TTCAC	2	10	677391	677400	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_022655	ATGGA	2	10	698077	698086	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022655	TTATT	2	10	700372	700381	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022655	CTAAG	2	10	708919	708928	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_022655	TCAAA	2	10	709063	709072	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_022655	GACTC	2	10	709283	709292	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
143	NC_022655	AAAAT	2	10	709542	709551	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022655	AATTG	2	10	710130	710139	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022655	AAATG	2	10	712830	712839	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022655	TTAAG	2	10	724818	724827	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022655	TTCTG	2	10	724889	724898	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_022655	TTCAA	2	10	733594	733603	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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332	NC_022655	TACTA	2	10	1729302	1729311	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.