MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae A026 genome

Total Repeats: 1198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022655	ATGGT	2	10	3074	3083	20 %	40 %	40 %	0 %	556560058
2	NC_022655	TATTT	2	10	7951	7960	20 %	80 %	0 %	0 %	556560063
3	NC_022655	TTTTA	2	10	7963	7972	20 %	80 %	0 %	0 %	556560063
4	NC_022655	AGCAG	2	10	11945	11954	40 %	0 %	40 %	20 %	556560066
5	NC_022655	TGAAG	2	10	15238	15247	40 %	20 %	40 %	0 %	556560069
6	NC_022655	CAGAT	2	10	21398	21407	40 %	20 %	20 %	20 %	556560077
7	NC_022655	TTTAC	2	10	22100	22109	20 %	60 %	0 %	20 %	556560077
8	NC_022655	GTGAC	2	10	25586	25595	20 %	20 %	40 %	20 %	556560080
9	NC_022655	GTGAT	2	10	26576	26585	20 %	40 %	40 %	0 %	556560080
10	NC_022655	GCTTG	2	10	27570	27579	0 %	40 %	40 %	20 %	556560080
11	NC_022655	TGGCT	2	10	29396	29405	0 %	40 %	40 %	20 %	556560081
12	NC_022655	AAATG	2	10	30002	30011	60 %	20 %	20 %	0 %	556560081
13	NC_022655	AGCTA	2	10	30896	30905	40 %	20 %	20 %	20 %	556560082
14	NC_022655	CCTTG	2	10	33786	33795	0 %	40 %	20 %	40 %	556560085
15	NC_022655	TCAAA	2	10	33980	33989	60 %	20 %	0 %	20 %	556560085
16	NC_022655	AGTGG	2	10	36347	36356	20 %	20 %	60 %	0 %	556560087
17	NC_022655	GGGTG	2	10	36385	36394	0 %	20 %	80 %	0 %	556560087
18	NC_022655	CTATT	2	10	37352	37361	20 %	60 %	0 %	20 %	556560088
19	NC_022655	GAAGC	2	10	37542	37551	40 %	0 %	40 %	20 %	556560088
20	NC_022655	GCTTG	2	10	37997	38006	0 %	40 %	40 %	20 %	556560090
21	NC_022655	GCTTT	2	10	39426	39435	0 %	60 %	20 %	20 %	556560091
22	NC_022655	TCTGG	2	10	40032	40041	0 %	40 %	40 %	20 %	556560091
23	NC_022655	AGCAT	2	10	40986	40995	40 %	20 %	20 %	20 %	556560091
24	NC_022655	TACCA	2	10	41684	41693	40 %	20 %	0 %	40 %	556560091
25	NC_022655	TTCCT	2	10	42701	42710	0 %	60 %	0 %	40 %	556560091
26	NC_022655	GCTCG	2	10	45469	45478	0 %	20 %	40 %	40 %	556560093
27	NC_022655	TTGGT	2	10	46656	46665	0 %	60 %	40 %	0 %	556560094
28	NC_022655	CTTCA	2	10	47711	47720	20 %	40 %	0 %	40 %	556560095
29	NC_022655	AATCA	2	10	47823	47832	60 %	20 %	0 %	20 %	556560096
30	NC_022655	AGCTC	2	10	50041	50050	20 %	20 %	20 %	40 %	556560098
31	NC_022655	GCTCC	2	10	54322	54331	0 %	20 %	20 %	60 %	556560105
32	NC_022655	GCTGT	2	10	54640	54649	0 %	40 %	40 %	20 %	556560105
33	NC_022655	TCTAT	2	10	55843	55852	20 %	60 %	0 %	20 %	556560106
34	NC_022655	AGAAA	2	10	56768	56777	80 %	0 %	20 %	0 %	556560106
35	NC_022655	TGACT	2	10	59815	59824	20 %	40 %	20 %	20 %	556560108
36	NC_022655	ATTCT	2	10	66329	66338	20 %	60 %	0 %	20 %	556560112
37	NC_022655	TTACT	2	10	70146	70155	20 %	60 %	0 %	20 %	556560114
38	NC_022655	TGGGA	2	10	70800	70809	20 %	20 %	60 %	0 %	556560114
39	NC_022655	CAACC	2	10	70856	70865	40 %	0 %	0 %	60 %	556560114
40	NC_022655	CTTAG	2	10	73403	73412	20 %	40 %	20 %	20 %	556560116
41	NC_022655	CTCTT	2	10	77625	77634	0 %	60 %	0 %	40 %	556560121
42	NC_022655	AGATA	2	10	79880	79889	60 %	20 %	20 %	0 %	556560124
43	NC_022655	GTTTG	2	10	80047	80056	0 %	60 %	40 %	0 %	556560124
44	NC_022655	TATTT	2	10	81996	82005	20 %	80 %	0 %	0 %	556560126
45	NC_022655	AAAGC	2	10	84951	84960	60 %	0 %	20 %	20 %	556560129
46	NC_022655	CACAA	2	10	86714	86723	60 %	0 %	0 %	40 %	556560131
47	NC_022655	GGAAT	2	10	88200	88209	40 %	20 %	40 %	0 %	556560132
48	NC_022655	AGGAT	2	10	88765	88774	40 %	20 %	40 %	0 %	556560133
49	NC_022655	CTTTG	2	10	90074	90083	0 %	60 %	20 %	20 %	556560133
50	NC_022655	TCCTC	2	10	90200	90209	0 %	40 %	0 %	60 %	556560133
51	NC_022655	ATTTT	2	10	98336	98345	20 %	80 %	0 %	0 %	556560144
52	NC_022655	CAAAG	2	10	103587	103596	60 %	0 %	20 %	20 %	556561962
53	NC_022655	ACGCA	2	10	105934	105943	40 %	0 %	20 %	40 %	556560152
54	NC_022655	CGTGG	2	10	108554	108563	0 %	20 %	60 %	20 %	556560153
55	NC_022655	GTGAA	2	10	109556	109565	40 %	20 %	40 %	0 %	556560154
56	NC_022655	GTTTG	2	10	114492	114501	0 %	60 %	40 %	0 %	556560159
57	NC_022655	TTGGA	2	10	115514	115523	20 %	40 %	40 %	0 %	556560162
58	NC_022655	TTTTC	2	10	127870	127879	0 %	80 %	0 %	20 %	556560170
59	NC_022655	GAAAT	2	10	128680	128689	60 %	20 %	20 %	0 %	556560172
60	NC_022655	TATTT	2	10	128858	128867	20 %	80 %	0 %	0 %	556560172
61	NC_022655	TTAGT	2	10	129552	129561	20 %	60 %	20 %	0 %	556560173
62	NC_022655	CTTGC	2	10	129908	129917	0 %	40 %	20 %	40 %	556560173
63	NC_022655	GGCCT	2	10	130907	130916	0 %	20 %	40 %	40 %	556560175
64	NC_022655	CTGTT	2	10	131475	131484	0 %	60 %	20 %	20 %	556560175
65	NC_022655	AGAAA	2	10	133011	133020	80 %	0 %	20 %	0 %	556560178
66	NC_022655	TATAC	2	10	134972	134981	40 %	40 %	0 %	20 %	556560179
67	NC_022655	AGATC	2	10	135277	135286	40 %	20 %	20 %	20 %	556560180
68	NC_022655	TTTGT	2	10	137286	137295	0 %	80 %	20 %	0 %	556560182
69	NC_022655	ACTAT	2	10	141292	141301	40 %	40 %	0 %	20 %	556560185
70	NC_022655	TTGAG	2	10	143881	143890	20 %	40 %	40 %	0 %	556560188
71	NC_022655	GCCTT	2	10	145855	145864	0 %	40 %	20 %	40 %	556560191
72	NC_022655	AAGTA	2	10	148637	148646	60 %	20 %	20 %	0 %	556560193
73	NC_022655	TTGAT	2	10	149796	149805	20 %	60 %	20 %	0 %	556560194
74	NC_022655	TCACT	2	10	150171	150180	20 %	40 %	0 %	40 %	556560195
75	NC_022655	ATTTT	2	10	150494	150503	20 %	80 %	0 %	0 %	556560195
76	NC_022655	TTAAG	2	10	150846	150855	40 %	40 %	20 %	0 %	556560195
77	NC_022655	TCAGG	2	10	151761	151770	20 %	20 %	40 %	20 %	556560196
78	NC_022655	GCCTT	2	10	153375	153384	0 %	40 %	20 %	40 %	556560198
79	NC_022655	AAATG	2	10	153488	153497	60 %	20 %	20 %	0 %	556560198
80	NC_022655	TTCCC	2	10	153931	153940	0 %	40 %	0 %	60 %	556560199
81	NC_022655	TTTAT	2	10	158837	158846	20 %	80 %	0 %	0 %	556560202
82	NC_022655	TGAAT	2	10	161915	161924	40 %	40 %	20 %	0 %	556560206
83	NC_022655	GCAAT	2	10	162192	162201	40 %	20 %	20 %	20 %	556560206
84	NC_022655	GATTT	2	10	163586	163595	20 %	60 %	20 %	0 %	556560212
85	NC_022655	GTTCT	2	10	168942	168951	0 %	60 %	20 %	20 %	556560217
86	NC_022655	TCTCT	2	10	170361	170370	0 %	60 %	0 %	40 %	556560218
87	NC_022655	GAAAG	2	10	172377	172386	60 %	0 %	40 %	0 %	556560218
88	NC_022655	AGTTA	2	10	173657	173666	40 %	40 %	20 %	0 %	556560220
89	NC_022655	TGGAG	2	10	174347	174356	20 %	20 %	60 %	0 %	556560221
90	NC_022655	AAATC	2	10	174889	174898	60 %	20 %	0 %	20 %	556560222
91	NC_022655	GCAGA	2	10	176506	176515	40 %	0 %	40 %	20 %	556560225
92	NC_022655	ATGAT	2	10	179542	179551	40 %	40 %	20 %	0 %	556560228
93	NC_022655	GTAGA	2	10	179713	179722	40 %	20 %	40 %	0 %	556560229
94	NC_022655	TTTAG	2	10	180198	180207	20 %	60 %	20 %	0 %	556560229
95	NC_022655	CTTTT	2	10	180672	180681	0 %	80 %	0 %	20 %	556560229
96	NC_022655	GTCTG	2	10	181149	181158	0 %	40 %	40 %	20 %	556560229
97	NC_022655	AGCAG	2	10	184350	184359	40 %	0 %	40 %	20 %	556560232
98	NC_022655	GGGAG	2	10	184689	184698	20 %	0 %	80 %	0 %	556560233
99	NC_022655	ACGAT	2	10	184863	184872	40 %	20 %	20 %	20 %	556560233
100	NC_022655	CCTTG	2	10	185291	185300	0 %	40 %	20 %	40 %	556560234
101	NC_022655	ACTTA	2	10	185631	185640	40 %	40 %	0 %	20 %	556560234
102	NC_022655	TACAC	2	10	188295	188304	40 %	20 %	0 %	40 %	556560239
103	NC_022655	TTTGG	2	10	189440	189449	0 %	60 %	40 %	0 %	556560241
104	NC_022655	TTCAC	2	10	189796	189805	20 %	40 %	0 %	40 %	556560242
105	NC_022655	GACAA	2	10	190967	190976	60 %	0 %	20 %	20 %	556560245
106	NC_022655	TCCAA	2	10	196691	196700	40 %	20 %	0 %	40 %	556560255
107	NC_022655	ACAGA	2	10	197257	197266	60 %	0 %	20 %	20 %	556560255
108	NC_022655	GAGAT	2	10	201609	201618	40 %	20 %	40 %	0 %	556560263
109	NC_022655	ATTCC	2	10	201627	201636	20 %	40 %	0 %	40 %	556560263
110	NC_022655	TGGTG	2	10	201883	201892	0 %	40 %	60 %	0 %	556560263
111	NC_022655	TCTGT	2	10	202302	202311	0 %	60 %	20 %	20 %	556560263
112	NC_022655	TGGAT	2	10	202312	202321	20 %	40 %	40 %	0 %	556560263
113	NC_022655	TTTTA	2	10	202769	202778	20 %	80 %	0 %	0 %	556560264
114	NC_022655	AAGTC	2	10	209509	209518	40 %	20 %	20 %	20 %	556560268
115	NC_022655	TTAAT	2	10	211061	211070	40 %	60 %	0 %	0 %	556560270
116	NC_022655	GTTTG	2	10	211883	211892	0 %	60 %	40 %	0 %	556560272
117	NC_022655	GCCAT	2	10	215981	215990	20 %	20 %	20 %	40 %	556560274
118	NC_022655	CAACA	2	10	217993	218002	60 %	0 %	0 %	40 %	556560276
119	NC_022655	GCAAC	2	10	218275	218284	40 %	0 %	20 %	40 %	556560276
120	NC_022655	TATTT	2	10	220703	220712	20 %	80 %	0 %	0 %	556560277
121	NC_022655	ATTAT	2	10	220752	220761	40 %	60 %	0 %	0 %	556560277
122	NC_022655	ACAGT	2	10	226453	226462	40 %	20 %	20 %	20 %	556560283
123	NC_022655	TTTTG	2	10	230364	230373	0 %	80 %	20 %	0 %	556560286
124	NC_022655	ACTTG	2	10	232201	232210	20 %	40 %	20 %	20 %	556560287
125	NC_022655	CATCT	2	10	232459	232468	20 %	40 %	0 %	40 %	556560287
126	NC_022655	GAAGC	2	10	234076	234085	40 %	0 %	40 %	20 %	556560288
127	NC_022655	TAGTT	2	10	234563	234572	20 %	60 %	20 %	0 %	556560289
128	NC_022655	AAATT	2	10	235138	235147	60 %	40 %	0 %	0 %	556560289
129	NC_022655	AAGAC	2	10	236489	236498	60 %	0 %	20 %	20 %	556560289
130	NC_022655	TGAAG	2	10	236610	236619	40 %	20 %	40 %	0 %	556560289
131	NC_022655	AAGTC	2	10	236684	236693	40 %	20 %	20 %	20 %	556560289
132	NC_022655	CGTAT	2	10	240496	240505	20 %	40 %	20 %	20 %	556560292
133	NC_022655	CCAAT	2	10	240589	240598	40 %	20 %	0 %	40 %	556560292
134	NC_022655	CAAGA	2	10	241363	241372	60 %	0 %	20 %	20 %	556560292
135	NC_022655	GTCTG	2	10	245857	245866	0 %	40 %	40 %	20 %	556560293
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253	NC_022655	TTTTG	2	10	438294	438303	0 %	80 %	20 %	0 %	556561948
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259	NC_022655	GTTTA	2	10	443531	443540	20 %	60 %	20 %	0 %	556560468
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261	NC_022655	GGAAT	2	10	444525	444534	40 %	20 %	40 %	0 %	556560468
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