MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptococcus pneumoniae A026 genome

Total Repeats: 6043

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022655	CTTT	2	8	1388	1395	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_022655	ATGT	2	8	2824	2831	25 %	50 %	25 %	0 %	556560058
3	NC_022655	GATA	2	8	3465	3472	50 %	25 %	25 %	0 %	556560058
4	NC_022655	CAAG	2	8	3629	3636	50 %	0 %	25 %	25 %	556560058
5	NC_022655	GGTT	2	8	3784	3791	0 %	50 %	50 %	0 %	556560058
6	NC_022655	CTTT	2	8	3841	3848	0 %	75 %	0 %	25 %	556560058
7	NC_022655	CTAT	2	8	3968	3975	25 %	50 %	0 %	25 %	556560058
8	NC_022655	TTGG	2	8	4072	4079	0 %	50 %	50 %	0 %	556560058
9	NC_022655	AACA	2	8	4118	4125	75 %	0 %	0 %	25 %	556560058
10	NC_022655	GAGG	2	8	4388	4395	25 %	0 %	75 %	0 %	556560059
11	NC_022655	AGCG	2	8	4507	4514	25 %	0 %	50 %	25 %	556560059
12	NC_022655	ATGC	2	8	4518	4525	25 %	25 %	25 %	25 %	556560059
13	NC_022655	AATA	2	8	4955	4962	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022655	TTAA	2	8	5235	5242	50 %	50 %	0 %	0 %	556561944
15	NC_022655	ATGT	2	8	5841	5848	25 %	50 %	25 %	0 %	556560060
16	NC_022655	GATT	2	8	5925	5932	25 %	50 %	25 %	0 %	556560060
17	NC_022655	CCAG	2	8	6466	6473	25 %	0 %	25 %	50 %	556560061
18	NC_022655	TCCA	2	8	6491	6498	25 %	25 %	0 %	50 %	556560061
19	NC_022655	TTCG	2	8	7620	7627	0 %	50 %	25 %	25 %	556560062
20	NC_022655	AGAA	2	8	7924	7931	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022655	ACGG	2	8	8012	8019	25 %	0 %	50 %	25 %	556560063
22	NC_022655	GGGA	2	8	8161	8168	25 %	0 %	75 %	0 %	556560063
23	NC_022655	TTGA	2	8	8808	8815	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022655	TGGT	2	8	9381	9388	0 %	50 %	50 %	0 %	556560064
25	NC_022655	TTGA	2	8	9560	9567	25 %	50 %	25 %	0 %	556560064
26	NC_022655	TGAT	2	8	9573	9580	25 %	50 %	25 %	0 %	556560064
27	NC_022655	TTCT	2	8	9663	9670	0 %	75 %	0 %	25 %	556560064
28	NC_022655	ATCT	2	8	9731	9738	25 %	50 %	0 %	25 %	556560064
29	NC_022655	TGAT	2	8	9753	9760	25 %	50 %	25 %	0 %	556560064
30	NC_022655	CGTA	2	8	9805	9812	25 %	25 %	25 %	25 %	556560064
31	NC_022655	AATA	2	8	9911	9918	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022655	TTCT	2	8	10285	10292	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_022655	GCTG	2	8	10449	10456	0 %	25 %	50 %	25 %	556560065
34	NC_022655	CTTC	2	8	10523	10530	0 %	50 %	0 %	50 %	556560065
35	NC_022655	TGAT	2	8	11041	11048	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022655	AATT	2	8	11379	11386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022655	CTAT	2	8	11483	11490	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_022655	TTGA	2	8	11592	11599	25 %	50 %	25 %	0 %	556560066
39	NC_022655	TTGG	2	8	12570	12577	0 %	50 %	50 %	0 %	556560066
40	NC_022655	ACTT	2	8	12825	12832	25 %	50 %	0 %	25 %	556560066
41	NC_022655	AAGA	2	8	13053	13060	75 %	0 %	25 %	0 %	556560066
42	NC_022655	CTTG	2	8	13064	13071	0 %	50 %	25 %	25 %	556560066
43	NC_022655	GCTG	2	8	13127	13134	0 %	25 %	50 %	25 %	556560066
44	NC_022655	AAAC	2	8	14118	14125	75 %	0 %	0 %	25 %	556560066
45	NC_022655	TAAA	2	8	14198	14205	75 %	25 %	0 %	0 %	556560066
46	NC_022655	TTGA	2	8	14709	14716	25 %	50 %	25 %	0 %	556560067
47	NC_022655	TAGA	2	8	14831	14838	50 %	25 %	25 %	0 %	556560068
48	NC_022655	CAAG	2	8	15790	15797	50 %	0 %	25 %	25 %	556560069
49	NC_022655	AGCG	2	8	16315	16322	25 %	0 %	50 %	25 %	556560070
50	NC_022655	CAGC	2	8	17263	17270	25 %	0 %	25 %	50 %	556560070
51	NC_022655	TTTC	2	8	17817	17824	0 %	75 %	0 %	25 %	556560071
52	NC_022655	TCAA	2	8	17907	17914	50 %	25 %	0 %	25 %	556560071
53	NC_022655	CAAG	2	8	17968	17975	50 %	0 %	25 %	25 %	556560071
54	NC_022655	TCAA	2	8	18155	18162	50 %	25 %	0 %	25 %	556560072
55	NC_022655	GATT	2	8	18273	18280	25 %	50 %	25 %	0 %	556560072
56	NC_022655	TTCT	2	8	18564	18571	0 %	75 %	0 %	25 %	556560072
57	NC_022655	GCTT	2	8	18611	18618	0 %	50 %	25 %	25 %	556560072
58	NC_022655	GAAT	2	8	19612	19619	50 %	25 %	25 %	0 %	556560074
59	NC_022655	TGCT	2	8	19907	19914	0 %	50 %	25 %	25 %	556560075
60	NC_022655	ATTT	2	8	20437	20444	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022655	GGGA	2	8	20554	20561	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022655	GAAG	2	8	20577	20584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022655	TGAC	2	8	20691	20698	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_022655	ATGG	2	8	20941	20948	25 %	25 %	50 %	0 %	556560077
65	NC_022655	AAGG	2	8	21073	21080	50 %	0 %	50 %	0 %	556560077
66	NC_022655	CTTG	2	8	21492	21499	0 %	50 %	25 %	25 %	556560077
67	NC_022655	ATGG	2	8	22048	22055	25 %	25 %	50 %	0 %	556560077
68	NC_022655	CAGA	2	8	22639	22646	50 %	0 %	25 %	25 %	556560077
69	NC_022655	TTGC	2	8	22915	22922	0 %	50 %	25 %	25 %	556560077
70	NC_022655	CAGT	2	8	23280	23287	25 %	25 %	25 %	25 %	556560078
71	NC_022655	GCAG	2	8	23416	23423	25 %	0 %	50 %	25 %	556560078
72	NC_022655	GAAG	2	8	24940	24947	50 %	0 %	50 %	0 %	556560079
73	NC_022655	ATTG	2	8	25003	25010	25 %	50 %	25 %	0 %	556560079
74	NC_022655	CTTT	2	8	25499	25506	0 %	75 %	0 %	25 %	556560080
75	NC_022655	CTTT	2	8	25763	25770	0 %	75 %	0 %	25 %	556560080
76	NC_022655	GGTC	2	8	26044	26051	0 %	25 %	50 %	25 %	556560080
77	NC_022655	CAAG	2	8	27504	27511	50 %	0 %	25 %	25 %	556560080
78	NC_022655	GATT	2	8	27753	27760	25 %	50 %	25 %	0 %	556560080
79	NC_022655	AAGC	2	8	27794	27801	50 %	0 %	25 %	25 %	556560080
80	NC_022655	ACTG	2	8	28017	28024	25 %	25 %	25 %	25 %	556560080
81	NC_022655	TGAA	2	8	28289	28296	50 %	25 %	25 %	0 %	556560080
82	NC_022655	CCAA	2	8	28589	28596	50 %	0 %	0 %	50 %	556560080
83	NC_022655	ATAG	2	8	28998	29005	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022655	AAGA	2	8	29439	29446	75 %	0 %	25 %	0 %	556560081
85	NC_022655	TTGA	2	8	30369	30376	25 %	50 %	25 %	0 %	556560081
86	NC_022655	CGGT	2	8	31027	31034	0 %	25 %	50 %	25 %	556560082
87	NC_022655	AAGA	2	8	31542	31549	75 %	0 %	25 %	0 %	556560082
88	NC_022655	GTTT	2	8	32422	32429	0 %	75 %	25 %	0 %	556560084
89	NC_022655	TTGG	2	8	32807	32814	0 %	50 %	50 %	0 %	556560085
90	NC_022655	AAGC	2	8	33321	33328	50 %	0 %	25 %	25 %	556560085
91	NC_022655	TATC	2	8	33632	33639	25 %	50 %	0 %	25 %	556560085
92	NC_022655	AACC	2	8	34041	34048	50 %	0 %	0 %	50 %	556560085
93	NC_022655	TTTC	2	8	34305	34312	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_022655	ATTG	2	8	34564	34571	25 %	50 %	25 %	0 %	556560086
95	NC_022655	GGAC	2	8	35367	35374	25 %	0 %	50 %	25 %	556560086
96	NC_022655	GCCA	2	8	35446	35453	25 %	0 %	25 %	50 %	556560086
97	NC_022655	GATT	2	8	37622	37629	25 %	50 %	25 %	0 %	556560088
98	NC_022655	CTAT	2	8	37786	37793	25 %	50 %	0 %	25 %	556560089
99	NC_022655	AATA	2	8	37985	37992	75 %	25 %	0 %	0 %	556560090
100	NC_022655	TCCT	2	8	38571	38578	0 %	50 %	0 %	50 %	556560090
101	NC_022655	TTGA	2	8	38888	38895	25 %	50 %	25 %	0 %	556560090
102	NC_022655	ATTG	2	8	39013	39020	25 %	50 %	25 %	0 %	556560090
103	NC_022655	ATTA	2	8	39228	39235	50 %	50 %	0 %	0 %	556560090
104	NC_022655	TCTT	2	8	39984	39991	0 %	75 %	0 %	25 %	556560091
105	NC_022655	CTTT	2	8	40215	40222	0 %	75 %	0 %	25 %	556560091
106	NC_022655	TTGA	2	8	40436	40443	25 %	50 %	25 %	0 %	556560091
107	NC_022655	TGCT	2	8	40558	40565	0 %	50 %	25 %	25 %	556560091
108	NC_022655	CTTT	2	8	40701	40708	0 %	75 %	0 %	25 %	556560091
109	NC_022655	TGCT	2	8	41561	41568	0 %	50 %	25 %	25 %	556560091
110	NC_022655	CGAG	2	8	42018	42025	25 %	0 %	50 %	25 %	556560091
111	NC_022655	AACT	2	8	42916	42923	50 %	25 %	0 %	25 %	556560091
112	NC_022655	ATGG	2	8	43079	43086	25 %	25 %	50 %	0 %	556560091
113	NC_022655	GGTT	2	8	43089	43096	0 %	50 %	50 %	0 %	556560091
114	NC_022655	TAGA	2	8	43787	43794	50 %	25 %	25 %	0 %	556560092
115	NC_022655	TAAT	2	8	44549	44556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022655	CATT	2	8	44672	44679	25 %	50 %	0 %	25 %	556560093
117	NC_022655	CGTC	2	8	44871	44878	0 %	25 %	25 %	50 %	556560093
118	NC_022655	TGGT	2	8	45326	45333	0 %	50 %	50 %	0 %	556560093
119	NC_022655	TTTG	2	8	45671	45678	0 %	75 %	25 %	0 %	556560093
120	NC_022655	CTAC	2	8	45755	45762	25 %	25 %	0 %	50 %	556560093
121	NC_022655	AAAC	2	8	45775	45782	75 %	0 %	0 %	25 %	556560093
122	NC_022655	CAGA	2	8	45873	45880	50 %	0 %	25 %	25 %	556560093
123	NC_022655	AAAG	2	8	45911	45918	75 %	0 %	25 %	0 %	556560093
124	NC_022655	AAGG	2	8	46281	46288	50 %	0 %	50 %	0 %	556560093
125	NC_022655	GTTC	2	8	47062	47069	0 %	50 %	25 %	25 %	556560095
126	NC_022655	ACTT	2	8	47210	47217	25 %	50 %	0 %	25 %	556560095
127	NC_022655	GAAA	2	8	47954	47961	75 %	0 %	25 %	0 %	556560096
128	NC_022655	TTGA	2	8	48318	48325	25 %	50 %	25 %	0 %	556560096
129	NC_022655	ATCT	2	8	50000	50007	25 %	50 %	0 %	25 %	556560098
130	NC_022655	CTTT	2	8	50019	50026	0 %	75 %	0 %	25 %	556560098
131	NC_022655	GTTT	2	8	50548	50555	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022655	CCAA	2	8	51105	51112	50 %	0 %	0 %	50 %	556560099
133	NC_022655	ATTT	2	8	51854	51861	25 %	75 %	0 %	0 %	556560100
134	NC_022655	CCAG	2	8	52374	52381	25 %	0 %	25 %	50 %	556560100
135	NC_022655	ATCA	2	8	53011	53018	50 %	25 %	0 %	25 %	556560101
136	NC_022655	AAAT	2	8	53086	53093	75 %	25 %	0 %	0 %	556560101
137	NC_022655	TCCA	2	8	53424	53431	25 %	25 %	0 %	50 %	556560102
138	NC_022655	TGCT	2	8	53916	53923	0 %	50 %	25 %	25 %	556560104
139	NC_022655	GTCT	2	8	54297	54304	0 %	50 %	25 %	25 %	556560105
140	NC_022655	AGCA	2	8	55758	55765	50 %	0 %	25 %	25 %	556560106
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142	NC_022655	GATT	2	8	56560	56567	25 %	50 %	25 %	0 %	556560106
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