MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae A026 genome

Total Repeats: 1186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022655	CTTT	2	8	1388	1395	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_022655	AATA	2	8	4955	4962	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022655	AGAA	2	8	7924	7931	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022655	TTGA	2	8	8808	8815	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022655	AATA	2	8	9911	9918	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022655	TTCT	2	8	10285	10292	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_022655	TGAT	2	8	11041	11048	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022655	AATT	2	8	11379	11386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022655	CTAT	2	8	11483	11490	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_022655	ATTT	2	8	20437	20444	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022655	GGGA	2	8	20554	20561	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022655	GAAG	2	8	20577	20584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022655	TGAC	2	8	20691	20698	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_022655	ATAG	2	8	28998	29005	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022655	TTTC	2	8	34305	34312	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_022655	TAAT	2	8	44549	44556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022655	GTTT	2	8	50548	50555	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022655	AGAA	2	8	57602	57609	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022655	TAGC	2	8	58004	58011	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_022655	AAAT	2	8	58047	58054	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022655	AAGG	2	8	58231	58238	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022655	TAAT	2	8	58863	58870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022655	AAAG	2	8	58960	58967	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022655	AAAT	2	8	62025	62032	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022655	CTTT	2	8	62086	62093	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_022655	AATT	2	8	65126	65133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022655	TGAT	2	8	65886	65893	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022655	TTTG	2	8	66082	66089	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022655	GTTC	2	8	69211	69218	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_022655	GCTT	2	8	69255	69262	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_022655	TGGA	2	8	69529	69536	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022655	AAGA	2	8	69602	69609	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022655	ATTC	2	8	69875	69882	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_022655	AAAT	2	8	70033	70040	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022655	ATAA	2	8	70076	70083	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022655	GTTT	2	8	71319	71326	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022655	TGTA	2	8	71355	71362	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022655	AGAC	2	8	71639	71646	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_022655	CAAG	2	8	71740	71747	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_022655	GTGC	2	8	71881	71888	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_022655	ACAA	2	8	72849	72856	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_022655	TTAT	2	8	75694	75701	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022655	TTAG	2	8	77455	77462	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022655	ACAT	2	8	79363	79370	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_022655	AAAG	2	8	79381	79388	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022655	AGAA	2	8	86544	86551	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022655	TAGA	2	8	87440	87447	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022655	GAAG	2	8	87859	87866	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022655	AAAT	2	8	87943	87950	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022655	TCCC	2	8	88236	88243	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
51	NC_022655	TTCA	2	8	91029	91036	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_022655	GTAG	2	8	93360	93367	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022655	GTAT	2	8	93418	93425	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022655	AGGA	2	8	93751	93758	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022655	TTAT	2	8	94258	94265	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022655	TTTG	2	8	94364	94371	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022655	AAAT	2	8	95569	95576	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022655	GTAT	2	8	95686	95693	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022655	GATA	2	8	96754	96761	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022655	TATT	2	8	96806	96813	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022655	TCTA	2	8	97228	97235	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_022655	TGAA	2	8	97320	97327	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022655	TTTA	2	8	97341	97348	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022655	AAGC	2	8	97426	97433	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_022655	AAAT	2	8	97529	97536	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022655	TTAT	2	8	99470	99477	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022655	ATAA	2	8	99504	99511	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022655	ATTT	2	8	103901	103908	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022655	AATT	2	8	104495	104502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022655	AAGA	2	8	104792	104799	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022655	CAAA	2	8	104926	104933	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_022655	GAAA	2	8	105243	105250	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022655	GAAG	2	8	105353	105360	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022655	TTAT	2	8	107908	107915	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022655	TGAA	2	8	107926	107933	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022655	AAAG	2	8	112068	112075	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022655	TCAA	2	8	117774	117781	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_022655	GGAT	2	8	118296	118303	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022655	TAGG	2	8	119283	119290	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022655	GTAG	2	8	119381	119388	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022655	AAGC	2	8	119402	119409	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_022655	AAAT	2	8	120119	120126	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022655	ATGG	2	8	120521	120528	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022655	AATA	2	8	120667	120674	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022655	GAAA	2	8	120895	120902	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022655	GAAG	2	8	121126	121133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022655	GGGA	2	8	123854	123861	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022655	GTTA	2	8	125163	125170	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022655	ATAA	2	8	125487	125494	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022655	CAAA	2	8	125755	125762	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_022655	GAAG	2	8	125880	125887	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022655	GTTT	2	8	126086	126093	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022655	AAAT	2	8	126192	126199	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022655	TAAT	2	8	126354	126361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022655	ATTG	2	8	126367	126374	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022655	GGCT	2	8	126861	126868	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_022655	AATT	2	8	130480	130487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022655	GAAA	2	8	130840	130847	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022655	GCAG	2	8	130867	130874	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_022655	AGAT	2	8	131874	131881	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022655	CAAA	2	8	132883	132890	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_022655	TGAT	2	8	144207	144214	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022655	TTTC	2	8	144278	144285	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_022655	TTCT	2	8	145491	145498	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_022655	TAAT	2	8	145519	145526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022655	AGCT	2	8	154820	154827	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_022655	ATGA	2	8	156974	156981	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022655	GTTT	2	8	157437	157444	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022655	CTTT	2	8	157791	157798	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_022655	CAAT	2	8	159489	159496	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_022655	TTAG	2	8	159539	159546	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022655	TCGG	2	8	161653	161660	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_022655	TTAA	2	8	167552	167559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022655	GGAA	2	8	168225	168232	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022655	AGAA	2	8	169557	169564	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022655	GGTA	2	8	173578	173585	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022655	AGAA	2	8	174036	174043	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022655	AAAT	2	8	174628	174635	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022655	ATTG	2	8	175945	175952	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022655	AGAA	2	8	179497	179504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022655	AGAA	2	8	181328	181335	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022655	CAAG	2	8	183633	183640	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_022655	AGAA	2	8	183736	183743	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022655	AGAA	2	8	185677	185684	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022655	GTTT	2	8	193539	193546	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022655	ACAA	2	8	193547	193554	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_022655	ACAA	2	8	198516	198523	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_022655	TAAA	2	8	202630	202637	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022655	TTTA	2	8	202704	202711	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022655	CTTG	2	8	203520	203527	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_022655	GAAG	2	8	204056	204063	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022655	TAGG	2	8	204161	204168	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022655	AGCT	2	8	204257	204264	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_022655	TGGA	2	8	204428	204435	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022655	CAAG	2	8	204640	204647	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_022655	CATA	2	8	204993	205000	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_022655	AAAG	2	8	205105	205112	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022655	AAGA	2	8	205204	205211	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022655	AGTG	2	8	206438	206445	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022655	AATT	2	8	207601	207608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022655	GAAA	2	8	208779	208786	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022655	ACGA	2	8	208794	208801	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_022655	GAAA	2	8	212894	212901	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022655	GAAA	2	8	212915	212922	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022655	AATT	2	8	217269	217276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022655	TATT	2	8	217368	217375	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022655	ATTA	2	8	217384	217391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022655	TAAA	2	8	222337	222344	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022655	TTTA	2	8	222356	222363	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022655	TTTA	2	8	222544	222551	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022655	AGTA	2	8	224651	224658	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022655	TGAA	2	8	224691	224698	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
153	NC_022655	AATA	2	8	225025	225032	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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