MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus pneumoniae A026 genome

Total Repeats: 26949

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022655	CCT	2	6	15	20	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_022655	GGT	2	6	151	156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022655	TCG	2	6	266	271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_022655	CGT	2	6	346	351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_022655	AGT	2	6	804	809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022655	GTA	2	6	871	876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022655	ATG	2	6	894	899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022655	TAA	3	9	965	973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022655	CTA	2	6	1085	1090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_022655	TAT	2	6	1091	1096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022655	TCC	2	6	1172	1177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_022655	GAA	2	6	1352	1357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022655	TGA	2	6	1446	1451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022655	ATT	2	6	1453	1458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022655	GTG	2	6	1587	1592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022655	TTA	2	6	1636	1641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022655	TTG	2	6	1701	1706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022655	GAT	2	6	1754	1759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022655	TGA	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022655	TGA	2	6	2025	2030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022655	TGA	2	6	2042	2047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022655	TTC	2	6	2048	2053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_022655	AAG	2	6	2119	2124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022655	ATA	2	6	2165	2170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022655	TTG	2	6	2301	2306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022655	GAA	2	6	2447	2452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560057
27	NC_022655	TAT	2	6	2516	2521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560057
28	NC_022655	TTG	2	6	2629	2634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560057
29	NC_022655	ATA	2	6	2682	2687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022655	TCT	2	6	2754	2759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_022655	TAA	2	6	2784	2789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022655	GTT	3	9	2875	2883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560058
33	NC_022655	TGA	2	6	2901	2906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560058
34	NC_022655	GGT	2	6	2968	2973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560058
35	NC_022655	TTC	2	6	3043	3048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560058
36	NC_022655	AAC	2	6	3138	3143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560058
37	NC_022655	AAG	3	9	3212	3220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560058
38	NC_022655	GCT	2	6	3283	3288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560058
39	NC_022655	GAT	2	6	3412	3417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560058
40	NC_022655	GAA	2	6	3424	3429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560058
41	NC_022655	CAA	2	6	3445	3450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560058
42	NC_022655	ATG	2	6	3488	3493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560058
43	NC_022655	TCA	2	6	3580	3585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560058
44	NC_022655	TGG	2	6	3597	3602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560058
45	NC_022655	GTT	2	6	3705	3710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560058
46	NC_022655	TGA	2	6	3711	3716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560058
47	NC_022655	ACA	2	6	3757	3762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560058
48	NC_022655	GTC	2	6	3767	3772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560058
49	NC_022655	CGT	2	6	3775	3780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560058
50	NC_022655	CGT	2	6	3817	3822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560058
51	NC_022655	ACT	2	6	3926	3931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560058
52	NC_022655	AGA	2	6	3996	4001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560058
53	NC_022655	TCG	2	6	4056	4061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560058
54	NC_022655	AAG	2	6	4204	4209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022655	CCT	2	6	4211	4216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_022655	TTG	2	6	4220	4225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022655	ATA	2	6	4254	4259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022655	CTT	2	6	4290	4295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_022655	ATA	3	9	4315	4323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022655	TAT	2	6	4356	4361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560059
61	NC_022655	GAA	2	6	4368	4373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560059
62	NC_022655	AAG	2	6	4375	4380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560059
63	NC_022655	GCT	2	6	4689	4694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560059
64	NC_022655	ATC	2	6	4732	4737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560059
65	NC_022655	ATA	2	6	4851	4856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022655	GGA	2	6	4894	4899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022655	CAG	2	6	4903	4908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_022655	AAT	2	6	4969	4974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022655	ATA	2	6	4987	4992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022655	GTT	2	6	5118	5123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556561944
71	NC_022655	TTC	2	6	5204	5209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561944
72	NC_022655	AAG	2	6	5220	5225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561944
73	NC_022655	ATT	2	6	5266	5271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561944
74	NC_022655	GAA	2	6	5312	5317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561944
75	NC_022655	GTT	2	6	5334	5339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556561944
76	NC_022655	TGG	2	6	5423	5428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556561944
77	NC_022655	GCA	2	6	5559	5564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560060
78	NC_022655	AAT	2	6	5607	5612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560060
79	NC_022655	TCT	2	6	5617	5622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560060
80	NC_022655	TTA	2	6	5695	5700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560060
81	NC_022655	AGA	2	6	5749	5754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560060
82	NC_022655	GTT	2	6	5878	5883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560060
83	NC_022655	TCT	2	6	6071	6076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_022655	GGA	2	6	6202	6207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556560061
85	NC_022655	GAG	2	6	6350	6355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556560061
86	NC_022655	CAG	2	6	6362	6367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560061
87	NC_022655	ATT	2	6	6482	6487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560061
88	NC_022655	CAT	2	6	6502	6507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560061
89	NC_022655	AAG	2	6	6627	6632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560061
90	NC_022655	TGG	2	6	6666	6671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560061
91	NC_022655	CAC	2	6	6701	6706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556560061
92	NC_022655	GGC	2	6	6782	6787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556560061
93	NC_022655	AGA	2	6	6823	6828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560061
94	NC_022655	TCC	2	6	6851	6856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556560061
95	NC_022655	TAC	2	6	6943	6948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560061
96	NC_022655	CTG	2	6	7044	7049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560061
97	NC_022655	GTG	2	6	7050	7055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560061
98	NC_022655	AGG	2	6	7404	7409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556560062
99	NC_022655	GGT	2	6	7595	7600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560062
100	NC_022655	CAA	2	6	7643	7648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560062
101	NC_022655	CTT	2	6	7768	7773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560062
102	NC_022655	AGA	2	6	7789	7794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560062
103	NC_022655	GAA	2	6	7939	7944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560063
104	NC_022655	CTA	2	6	8005	8010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560063
105	NC_022655	AAG	2	6	8135	8140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560063
106	NC_022655	AGA	2	6	8290	8295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560063
107	NC_022655	ATT	2	6	8305	8310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560063
108	NC_022655	ATC	2	6	8477	8482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560063
109	NC_022655	GTA	2	6	8522	8527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560063
110	NC_022655	CTT	2	6	8617	8622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560063
111	NC_022655	TTG	2	6	8721	8726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560063
112	NC_022655	TGA	2	6	8742	8747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560063
113	NC_022655	ATG	2	6	8769	8774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022655	CTT	2	6	8796	8801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_022655	GGA	2	6	8887	8892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022655	TCT	2	6	8930	8935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560064
117	NC_022655	GAA	2	6	9035	9040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560064
118	NC_022655	TGT	2	6	9160	9165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560064
119	NC_022655	TGC	2	6	9292	9297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560064
120	NC_022655	CTC	2	6	9345	9350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556560064
121	NC_022655	ATT	2	6	9360	9365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560064
122	NC_022655	CGT	2	6	9371	9376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560064
123	NC_022655	TAT	2	6	9472	9477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560064
124	NC_022655	CAT	2	6	9526	9531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560064
125	NC_022655	GTT	2	6	9716	9721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560064
126	NC_022655	AGA	2	6	9742	9747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560064
127	NC_022655	GAT	2	6	9879	9884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022655	TAG	2	6	9921	9926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022655	ATA	2	6	9963	9968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022655	TCA	2	6	9994	9999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_022655	CAT	2	6	10014	10019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_022655	TAG	2	6	10067	10072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022655	TTC	2	6	10126	10131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_022655	CGT	2	6	10163	10168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_022655	GAT	2	6	10182	10187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022655	TGA	2	6	10208	10213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022655	GTT	2	6	10298	10303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022655	ATA	2	6	10361	10366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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146	NC_022655	TGT	2	6	10860	10865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_022655	AAT	2	6	11079	11084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022655	TCC	2	6	11315	11320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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259	NC_022655	ATT	2	6	20251	20256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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261	NC_022655	GTT	2	6	20617	20622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
262	NC_022655	AGC	2	6	20737	20742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_022655	CTA	2	6	20886	20891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560077
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265	NC_022655	GAC	2	6	20934	20939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560077
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500	NC_022655	AAG	2	6	37911	37916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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