MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae A026 genome

Total Repeats: 22531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022655	GAA	2	6	2447	2452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560057
2	NC_022655	TAT	2	6	2516	2521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560057
3	NC_022655	TTG	2	6	2629	2634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560057
4	NC_022655	GTT	3	9	2875	2883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560058
5	NC_022655	TGA	2	6	2901	2906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560058
6	NC_022655	GGT	2	6	2968	2973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560058
7	NC_022655	TTC	2	6	3043	3048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560058
8	NC_022655	AAC	2	6	3138	3143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560058
9	NC_022655	AAG	3	9	3212	3220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560058
10	NC_022655	GCT	2	6	3283	3288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560058
11	NC_022655	GAT	2	6	3412	3417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560058
12	NC_022655	GAA	2	6	3424	3429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560058
13	NC_022655	CAA	2	6	3445	3450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560058
14	NC_022655	ATG	2	6	3488	3493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560058
15	NC_022655	TCA	2	6	3580	3585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560058
16	NC_022655	TGG	2	6	3597	3602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560058
17	NC_022655	GTT	2	6	3705	3710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560058
18	NC_022655	TGA	2	6	3711	3716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560058
19	NC_022655	ACA	2	6	3757	3762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560058
20	NC_022655	GTC	2	6	3767	3772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560058
21	NC_022655	CGT	2	6	3775	3780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560058
22	NC_022655	CGT	2	6	3817	3822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560058
23	NC_022655	ACT	2	6	3926	3931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560058
24	NC_022655	AGA	2	6	3996	4001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560058
25	NC_022655	TCG	2	6	4056	4061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560058
26	NC_022655	TAT	2	6	4356	4361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560059
27	NC_022655	GAA	2	6	4368	4373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560059
28	NC_022655	AAG	2	6	4375	4380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560059
29	NC_022655	GCT	2	6	4689	4694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560059
30	NC_022655	ATC	2	6	4732	4737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560059
31	NC_022655	GTT	2	6	5118	5123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556561944
32	NC_022655	TTC	2	6	5204	5209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561944
33	NC_022655	AAG	2	6	5220	5225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561944
34	NC_022655	ATT	2	6	5266	5271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561944
35	NC_022655	GAA	2	6	5312	5317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561944
36	NC_022655	GTT	2	6	5334	5339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556561944
37	NC_022655	TGG	2	6	5423	5428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556561944
38	NC_022655	GCA	2	6	5559	5564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560060
39	NC_022655	AAT	2	6	5607	5612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560060
40	NC_022655	TCT	2	6	5617	5622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560060
41	NC_022655	TTA	2	6	5695	5700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560060
42	NC_022655	AGA	2	6	5749	5754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560060
43	NC_022655	GTT	2	6	5878	5883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560060
44	NC_022655	GGA	2	6	6202	6207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556560061
45	NC_022655	GAG	2	6	6350	6355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556560061
46	NC_022655	CAG	2	6	6362	6367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560061
47	NC_022655	ATT	2	6	6482	6487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560061
48	NC_022655	CAT	2	6	6502	6507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560061
49	NC_022655	AAG	2	6	6627	6632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560061
50	NC_022655	TGG	2	6	6666	6671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560061
51	NC_022655	CAC	2	6	6701	6706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556560061
52	NC_022655	GGC	2	6	6782	6787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556560061
53	NC_022655	AGA	2	6	6823	6828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560061
54	NC_022655	TCC	2	6	6851	6856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556560061
55	NC_022655	TAC	2	6	6943	6948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560061
56	NC_022655	CTG	2	6	7044	7049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560061
57	NC_022655	GTG	2	6	7050	7055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560061
58	NC_022655	AGG	2	6	7404	7409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556560062
59	NC_022655	GGT	2	6	7595	7600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560062
60	NC_022655	CAA	2	6	7643	7648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560062
61	NC_022655	CTT	2	6	7768	7773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560062
62	NC_022655	AGA	2	6	7789	7794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560062
63	NC_022655	GAA	2	6	7939	7944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560063
64	NC_022655	CTA	2	6	8005	8010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560063
65	NC_022655	AAG	2	6	8135	8140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560063
66	NC_022655	AGA	2	6	8290	8295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560063
67	NC_022655	ATT	2	6	8305	8310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560063
68	NC_022655	ATC	2	6	8477	8482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560063
69	NC_022655	GTA	2	6	8522	8527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560063
70	NC_022655	CTT	2	6	8617	8622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560063
71	NC_022655	TTG	2	6	8721	8726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560063
72	NC_022655	TGA	2	6	8742	8747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560063
73	NC_022655	TCT	2	6	8930	8935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560064
74	NC_022655	GAA	2	6	9035	9040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560064
75	NC_022655	TGT	2	6	9160	9165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560064
76	NC_022655	TGC	2	6	9292	9297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560064
77	NC_022655	CTC	2	6	9345	9350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556560064
78	NC_022655	ATT	2	6	9360	9365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560064
79	NC_022655	CGT	2	6	9371	9376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560064
80	NC_022655	TAT	2	6	9472	9477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560064
81	NC_022655	CAT	2	6	9526	9531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560064
82	NC_022655	GTT	2	6	9716	9721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560064
83	NC_022655	AGA	2	6	9742	9747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560064
84	NC_022655	ACA	2	6	10410	10415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560065
85	NC_022655	AGA	2	6	10472	10477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560065
86	NC_022655	TTC	2	6	10612	10617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560065
87	NC_022655	TCC	2	6	10649	10654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556560065
88	NC_022655	CAG	2	6	10675	10680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560065
89	NC_022655	TTG	2	6	10727	10732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560065
90	NC_022655	TTA	2	6	11586	11591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560066
91	NC_022655	TCT	2	6	11604	11609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560066
92	NC_022655	CAG	2	6	11640	11645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560066
93	NC_022655	TTG	2	6	11718	11723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560066
94	NC_022655	TGG	2	6	11749	11754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560066
95	NC_022655	GAC	2	6	11771	11776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560066
96	NC_022655	GGT	2	6	11808	11813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560066
97	NC_022655	TGA	2	6	11828	11833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560066
98	NC_022655	CAT	2	6	11921	11926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560066
99	NC_022655	GGT	2	6	12020	12025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560066
100	NC_022655	GAA	2	6	12084	12089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560066
101	NC_022655	ATA	2	6	12148	12153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560066
102	NC_022655	TCA	2	6	12274	12279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560066
103	NC_022655	GTC	2	6	12446	12451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560066
104	NC_022655	TTG	2	6	12484	12489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560066
105	NC_022655	AAG	2	6	12690	12695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560066
106	NC_022655	CCT	2	6	12767	12772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556560066
107	NC_022655	GGA	2	6	12782	12787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556560066
108	NC_022655	TGA	3	9	12836	12844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560066
109	NC_022655	CTT	2	6	12984	12989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560066
110	NC_022655	GAG	2	6	13137	13142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556560066
111	NC_022655	CAG	2	6	13240	13245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560066
112	NC_022655	GGA	2	6	13502	13507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556560066
113	NC_022655	TGA	2	6	13655	13660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560066
114	NC_022655	TAA	2	6	13739	13744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560066
115	NC_022655	GTG	2	6	13830	13835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560066
116	NC_022655	GCA	2	6	13971	13976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560066
117	NC_022655	GGT	2	6	14025	14030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560066
118	NC_022655	GAA	2	6	14130	14135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560066
119	NC_022655	TGG	2	6	14362	14367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560067
120	NC_022655	GAA	2	6	14382	14387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560067
121	NC_022655	ATC	2	6	14436	14441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560067
122	NC_022655	GGC	2	6	14456	14461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556560067
123	NC_022655	TCG	2	6	14540	14545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560067
124	NC_022655	TGG	2	6	14654	14659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560067
125	NC_022655	TGA	2	6	14663	14668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560067
126	NC_022655	TGA	2	6	14674	14679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560067
127	NC_022655	GCT	2	6	14804	14809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560068
128	NC_022655	GAT	2	6	15041	15046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560069
129	NC_022655	CAG	2	6	15054	15059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560069
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253	NC_022655	CTC	2	6	26203	26208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556560080
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256	NC_022655	CAA	2	6	26395	26400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560080
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285	NC_022655	TGT	2	6	28149	28154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560080
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330	NC_022655	GAA	2	6	31628	31633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560083
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376	NC_022655	GGT	2	6	35081	35086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560086
377	NC_022655	GTC	2	6	35187	35192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560086
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379	NC_022655	CTA	2	6	35476	35481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560086
380	NC_022655	CAG	2	6	35556	35561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560086
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394	NC_022655	GTC	2	6	36535	36540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560087
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499	NC_022655	GAT	2	6	44625	44630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560093
500	NC_022655	TCC	2	6	44690	44695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556560093

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