MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium kansasii ATCC 12478 plasmid pMK12478

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022654	GGGGAA	2	12	10150	10161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556559723
2	NC_022654	CCGACG	2	12	14404	14415	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	556559728
3	NC_022654	TCGCCA	2	12	14581	14592	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	556559728
4	NC_022654	GTGACG	2	12	19644	19655	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	556559847
5	NC_022654	GCCGAC	2	12	22000	22011	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	556559733
6	NC_022654	CTCGCC	2	12	24278	24289	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	556559736
7	NC_022654	GAAGTC	2	12	24565	24576	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	556559850
8	NC_022654	CGCCTG	2	12	27261	27272	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	556559738
9	NC_022654	CGTTCC	2	12	29640	29651	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	556559740
10	NC_022654	TCGACC	2	12	31818	31829	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	556559742
11	NC_022654	CTGCAC	2	12	33365	33376	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	556559854
12	NC_022654	GTAGTT	2	12	33542	33553	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	556559854
13	NC_022654	TCGCCG	2	12	34526	34537	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	556559855
14	NC_022654	CGGCTG	2	12	36420	36431	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	556559745
15	NC_022654	CCGGCG	2	12	36784	36795	0 %	0 %	50 %	50 %	556559745
16	NC_022654	GCGACA	2	12	37665	37676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556559746
17	NC_022654	TCGACG	2	12	37752	37763	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	556559746
18	NC_022654	CGCCGA	2	12	37831	37842	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	556559746
19	NC_022654	CGCTGC	2	12	41796	41807	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	556559751
20	NC_022654	CGATGG	2	12	44890	44901	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	556559756
21	NC_022654	TTGCCG	2	12	46062	46073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556559757
22	NC_022654	CGCCGG	2	12	47866	47877	0 %	0 %	50 %	50 %	556559760
23	NC_022654	CGGCCC	2	12	48263	48274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559761
24	NC_022654	CACCGC	2	12	49476	49487	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	556559762
25	NC_022654	CGGCGC	2	12	49758	49769	0 %	0 %	50 %	50 %	556559762
26	NC_022654	CCGGCG	2	12	49856	49867	0 %	0 %	50 %	50 %	556559762
27	NC_022654	CGTGTA	2	12	50272	50283	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	556559763
28	NC_022654	CCCGCA	2	12	51685	51696	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	556559766
29	NC_022654	CGCAAC	2	12	52875	52886	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	556559766
30	NC_022654	TGCCCG	2	12	53392	53403	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	556559766
31	NC_022654	CAAGCC	2	12	54416	54427	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	556559767
32	NC_022654	GTCGAC	2	12	56072	56083	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	556559767
33	NC_022654	GCCGGC	2	12	61208	61219	0 %	0 %	50 %	50 %	556559772
34	NC_022654	GGAGGC	2	12	61370	61381	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	556559772
35	NC_022654	AACGCC	2	12	62974	62985	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	556559773
36	NC_022654	CACTGA	2	12	63326	63337	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	556559773
37	NC_022654	GCACCC	2	12	64274	64285	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	556559774
38	NC_022654	TGAGCA	2	12	64676	64687	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	556559774
39	NC_022654	CATCGA	2	12	67784	67795	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	556559778
40	NC_022654	CTAGAC	2	12	67999	68010	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	556559779
41	NC_022654	GCCCCG	2	12	68961	68972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559780
42	NC_022654	GTCACC	2	12	73603	73614	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	556559781
43	NC_022654	CCGCGC	2	12	74101	74112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559781
44	NC_022654	CGCATC	2	12	74769	74780	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	556559782
45	NC_022654	GCCTGC	2	12	75021	75032	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	556559782
46	NC_022654	CCGGCA	2	12	75094	75105	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	556559782
47	NC_022654	CCGGTC	2	12	78601	78612	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	556559786
48	NC_022654	TCGATC	2	12	79501	79512	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	556559786
49	NC_022654	GAAACC	2	12	80639	80650	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	556559788
50	NC_022654	AACCCC	2	12	82187	82198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556559788
51	NC_022654	CAACGG	2	12	82236	82247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556559857
52	NC_022654	CGGTGC	2	12	84319	84330	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	556559790
53	NC_022654	GGCCTC	2	12	85072	85083	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	556559790
54	NC_022654	CACCGT	2	12	87063	87074	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	556559792
55	NC_022654	CAACGT	2	12	89465	89476	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	556559795
56	NC_022654	CAGCGG	2	12	89708	89719	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	556559795
57	NC_022654	CGGGCG	2	12	91041	91052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556559798
58	NC_022654	TCAGCT	2	12	91357	91368	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	556559798
59	NC_022654	CCGACG	2	12	92112	92123	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	556559799
60	NC_022654	CGGCGA	2	12	92558	92569	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	556559858
61	NC_022654	GGAACG	2	12	94152	94163	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	556559801
62	NC_022654	GCCGAC	2	12	96505	96516	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	556559803
63	NC_022654	GCCTGC	2	12	96602	96613	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	556559803
64	NC_022654	CACCCC	2	12	98190	98201	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	556559805
65	NC_022654	TCGACT	2	12	103718	103729	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	556559810
66	NC_022654	CGCGCC	2	12	104781	104792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559859
67	NC_022654	ACCCGC	2	12	108385	108396	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	556559815
68	NC_022654	CGAGCC	2	12	108564	108575	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	556559816
69	NC_022654	ACACCG	2	12	111607	111618	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	556559818
70	NC_022654	AACGCC	2	12	115091	115102	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	556559820
71	NC_022654	ACGCCG	2	12	116178	116189	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	556559820
72	NC_022654	GGCCGC	2	12	119592	119603	0 %	0 %	50 %	50 %	556559824
73	NC_022654	GTCGAC	2	12	124206	124217	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	556559828
74	NC_022654	CGGTGA	2	12	124537	124548	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	556559828
75	NC_022654	ACCGTC	2	12	125758	125769	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	556559829
76	NC_022654	TGCCGC	2	12	129195	129206	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	556559833
77	NC_022654	ACCCGC	2	12	135320	135331	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	556559838
78	NC_022654	AAGCCG	2	12	135592	135603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556559838
79	NC_022654	CCCCGA	2	12	138875	138886	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	556559838
80	NC_022654	GGCCTC	2	12	141841	141852	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	556559843

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.