MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium kansasii ATCC 12478 plasmid pMK12478

Total Repeats: 144

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022654	CGCGG	2	10	1385	1394	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2	NC_022654	GTCCG	2	10	3072	3081	0 %	20 %	40 %	40 %	556559713
3	NC_022654	GCCGC	2	10	3095	3104	0 %	0 %	40 %	60 %	556559713
4	NC_022654	CACCC	2	10	4322	4331	20 %	0 %	0 %	80 %	556559714
5	NC_022654	GAATC	2	10	5490	5499	40 %	20 %	20 %	20 %	556559716
6	NC_022654	ACACC	2	10	6913	6922	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
7	NC_022654	ACTGT	2	10	7592	7601	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_022654	CGACC	2	10	8062	8071	20 %	0 %	20 %	60 %	556559719
9	NC_022654	CGGCG	2	10	9940	9949	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10	NC_022654	CAGGA	2	10	10427	10436	40 %	0 %	40 %	20 %	556559723
11	NC_022654	AGCTC	2	10	12703	12712	20 %	20 %	20 %	40 %	556559725
12	NC_022654	CGTCC	2	10	12911	12920	0 %	20 %	20 %	60 %	556559725
13	NC_022654	GCCAG	2	10	14954	14963	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_022654	TGCCA	2	10	17795	17804	20 %	20 %	20 %	40 %	556559731
15	NC_022654	GGCCA	2	10	18049	18058	20 %	0 %	40 %	40 %	556559846
16	NC_022654	CTTTG	2	10	18138	18147	0 %	60 %	20 %	20 %	556559846
17	NC_022654	TCCCG	2	10	19075	19084	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
18	NC_022654	CGCGC	2	10	19790	19799	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
19	NC_022654	GCAGC	2	10	20535	20544	20 %	0 %	40 %	40 %	556559849
20	NC_022654	TGCCG	2	10	22228	22237	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_022654	AGCCG	2	10	22264	22273	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_022654	GCAGG	2	10	22561	22570	20 %	0 %	60 %	20 %	556559734
23	NC_022654	TCCAC	2	10	23235	23244	20 %	20 %	0 %	60 %	556559735
24	NC_022654	CCGCG	2	10	24475	24484	0 %	0 %	40 %	60 %	556559736
25	NC_022654	TCCTT	2	10	24879	24888	0 %	60 %	0 %	40 %	556559737
26	NC_022654	CTGTC	2	10	25328	25337	0 %	40 %	20 %	40 %	556559737
27	NC_022654	CGAAC	2	10	25801	25810	40 %	0 %	20 %	40 %	556559851
28	NC_022654	CTGCG	2	10	26538	26547	0 %	20 %	40 %	40 %	556559852
29	NC_022654	CCGGC	2	10	29601	29610	0 %	0 %	40 %	60 %	556559740
30	NC_022654	AGCGC	2	10	31365	31374	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_022654	CGGCG	2	10	33034	33043	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
32	NC_022654	GCTGC	2	10	33157	33166	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_022654	ATGCA	2	10	34388	34397	40 %	20 %	20 %	20 %	556559855
34	NC_022654	CCGAG	2	10	34446	34455	20 %	0 %	40 %	40 %	556559855
35	NC_022654	GCATC	2	10	34958	34967	20 %	20 %	20 %	40 %	556559743
36	NC_022654	CCCAC	2	10	37320	37329	20 %	0 %	0 %	80 %	556559746
37	NC_022654	GCTCG	2	10	39481	39490	0 %	20 %	40 %	40 %	556559747
38	NC_022654	TCTGC	2	10	39714	39723	0 %	40 %	20 %	40 %	556559747
39	NC_022654	CGCGT	2	10	39800	39809	0 %	20 %	40 %	40 %	556559747
40	NC_022654	TGCCG	2	10	39985	39994	0 %	20 %	40 %	40 %	556559747
41	NC_022654	CCTGG	2	10	41887	41896	0 %	20 %	40 %	40 %	556559751
42	NC_022654	CCCAG	2	10	42969	42978	20 %	0 %	20 %	60 %	556559753
43	NC_022654	GCCGC	2	10	45302	45311	0 %	0 %	40 %	60 %	556559757
44	NC_022654	CCCGG	2	10	46601	46610	0 %	0 %	40 %	60 %	556559758
45	NC_022654	CCAGC	2	10	46942	46951	20 %	0 %	20 %	60 %	556559758
46	NC_022654	GGCCT	2	10	49327	49336	0 %	20 %	40 %	40 %	556559762
47	NC_022654	GGCCC	2	10	49402	49411	0 %	0 %	40 %	60 %	556559762
48	NC_022654	ACCGC	2	10	49424	49433	20 %	0 %	20 %	60 %	556559762
49	NC_022654	CCTCC	2	10	50502	50511	0 %	20 %	0 %	80 %	556559764
50	NC_022654	TGGGC	2	10	50880	50889	0 %	20 %	60 %	20 %	556559765
51	NC_022654	CAAAC	2	10	52662	52671	60 %	0 %	0 %	40 %	556559766
52	NC_022654	ACCCA	2	10	52728	52737	40 %	0 %	0 %	60 %	556559766
53	NC_022654	CACCC	2	10	54943	54952	20 %	0 %	0 %	80 %	556559767
54	NC_022654	CAACC	2	10	55877	55886	40 %	0 %	0 %	60 %	556559767
55	NC_022654	CGCTG	2	10	56606	56615	0 %	20 %	40 %	40 %	556559769
56	NC_022654	TGAGC	2	10	56617	56626	20 %	20 %	40 %	20 %	556559769
57	NC_022654	GCCCG	2	10	59203	59212	0 %	0 %	40 %	60 %	556559771
58	NC_022654	CGGCG	2	10	59326	59335	0 %	0 %	60 %	40 %	556559771
59	NC_022654	TCGAC	2	10	59851	59860	20 %	20 %	20 %	40 %	556559771
60	NC_022654	CGCCA	2	10	60030	60039	20 %	0 %	20 %	60 %	556559771
61	NC_022654	GCCCC	2	10	61653	61662	0 %	0 %	20 %	80 %	556559772
62	NC_022654	GCCCA	2	10	62955	62964	20 %	0 %	20 %	60 %	556559773
63	NC_022654	GCTCA	2	10	63077	63086	20 %	20 %	20 %	40 %	556559773
64	NC_022654	CGAGT	2	10	63286	63295	20 %	20 %	40 %	20 %	556559773
65	NC_022654	TCAGC	2	10	63885	63894	20 %	20 %	20 %	40 %	556559774
66	NC_022654	TCGGG	2	10	64515	64524	0 %	20 %	60 %	20 %	556559774
67	NC_022654	GAATT	2	10	67218	67227	40 %	40 %	20 %	0 %	556559778
68	NC_022654	CCCGG	2	10	67670	67679	0 %	0 %	40 %	60 %	556559778
69	NC_022654	GCGAG	2	10	69735	69744	20 %	0 %	60 %	20 %	556559780
70	NC_022654	CCGGC	2	10	72704	72713	0 %	0 %	40 %	60 %	556559781
71	NC_022654	CACCG	2	10	73176	73185	20 %	0 %	20 %	60 %	556559781
72	NC_022654	CCGGC	2	10	73187	73196	0 %	0 %	40 %	60 %	556559781
73	NC_022654	ACAGC	2	10	73943	73952	40 %	0 %	20 %	40 %	556559781
74	NC_022654	CCGGC	2	10	73992	74001	0 %	0 %	40 %	60 %	556559781
75	NC_022654	GAAGC	2	10	74551	74560	40 %	0 %	40 %	20 %	556559782
76	NC_022654	CCGCA	2	10	77674	77683	20 %	0 %	20 %	60 %	556559784
77	NC_022654	CGGCG	2	10	78689	78698	0 %	0 %	60 %	40 %	556559786
78	NC_022654	TGCGC	2	10	81380	81389	0 %	20 %	40 %	40 %	556559788
79	NC_022654	CGGCA	2	10	81834	81843	20 %	0 %	40 %	40 %	556559788
80	NC_022654	CAATC	2	10	84029	84038	40 %	20 %	0 %	40 %	556559790
81	NC_022654	GCGCC	2	10	85142	85151	0 %	0 %	40 %	60 %	556559790
82	NC_022654	CGTCG	2	10	85909	85918	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
83	NC_022654	TGCGG	2	10	87808	87817	0 %	20 %	60 %	20 %	556559793
84	NC_022654	CGAAT	2	10	90105	90114	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_022654	CCGCA	2	10	91382	91391	20 %	0 %	20 %	60 %	556559798
86	NC_022654	GCCGA	2	10	91394	91403	20 %	0 %	40 %	40 %	556559798
87	NC_022654	GCCCA	2	10	91988	91997	20 %	0 %	20 %	60 %	556559799
88	NC_022654	GCAGC	2	10	93692	93701	20 %	0 %	40 %	40 %	556559801
89	NC_022654	CGCGC	2	10	94346	94355	0 %	0 %	40 %	60 %	556559801
90	NC_022654	GCCGC	2	10	94770	94779	0 %	0 %	40 %	60 %	556559801
91	NC_022654	CGCGG	2	10	96215	96224	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
92	NC_022654	CGTGC	2	10	96351	96360	0 %	20 %	40 %	40 %	556559803
93	NC_022654	CACCT	2	10	96798	96807	20 %	20 %	0 %	60 %	556559803
94	NC_022654	CCTGG	2	10	97104	97113	0 %	20 %	40 %	40 %	556559803
95	NC_022654	GCGCC	2	10	97194	97203	0 %	0 %	40 %	60 %	556559803
96	NC_022654	CCGGC	2	10	98328	98337	0 %	0 %	40 %	60 %	556559805
97	NC_022654	CCGGC	2	10	99146	99155	0 %	0 %	40 %	60 %	556559805
98	NC_022654	ATCCG	2	10	100143	100152	20 %	20 %	20 %	40 %	556559807
99	NC_022654	CCCCT	2	10	100208	100217	0 %	20 %	0 %	80 %	556559807
100	NC_022654	TGCGG	2	10	102754	102763	0 %	20 %	60 %	20 %	556559809
101	NC_022654	CTGGC	2	10	103690	103699	0 %	20 %	40 %	40 %	556559810
102	NC_022654	TCCCA	2	10	103862	103871	20 %	20 %	0 %	60 %	556559810
103	NC_022654	AGCCG	2	10	104558	104567	20 %	0 %	40 %	40 %	556559859
104	NC_022654	GCCTG	2	10	105849	105858	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
105	NC_022654	CCAGC	2	10	107280	107289	20 %	0 %	20 %	60 %	556559814
106	NC_022654	CGCGG	2	10	107462	107471	0 %	0 %	60 %	40 %	556559814
107	NC_022654	AACGA	3	15	107541	107555	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_022654	ACGAA	2	10	107560	107569	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_022654	TGCGC	2	10	108763	108772	0 %	20 %	40 %	40 %	556559816
110	NC_022654	GCTTC	2	10	110365	110374	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_022654	GTGCA	2	10	112990	112999	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_022654	ACAGC	2	10	114269	114278	40 %	0 %	20 %	40 %	556559820
113	NC_022654	CCGGC	2	10	114577	114586	0 %	0 %	40 %	60 %	556559820
114	NC_022654	CCGAT	2	10	116432	116441	20 %	20 %	20 %	40 %	556559820
115	NC_022654	GCGGT	2	10	118820	118829	0 %	20 %	60 %	20 %	556559824
116	NC_022654	GCCGG	2	10	119975	119984	0 %	0 %	60 %	40 %	556559860
117	NC_022654	AAGCG	2	10	120365	120374	40 %	0 %	40 %	20 %	556559825
118	NC_022654	CCGCG	2	10	121715	121724	0 %	0 %	40 %	60 %	556559862
119	NC_022654	CTCGA	2	10	122999	123008	20 %	20 %	20 %	40 %	556559827
120	NC_022654	CAACC	2	10	124140	124149	40 %	0 %	0 %	60 %	556559828
121	NC_022654	CGTCG	2	10	124611	124620	0 %	20 %	40 %	40 %	556559828
122	NC_022654	CGGCC	2	10	125890	125899	0 %	0 %	40 %	60 %	556559830
123	NC_022654	ACCTG	2	10	126738	126747	20 %	20 %	20 %	40 %	556559831
124	NC_022654	GGGCC	2	10	128737	128746	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
125	NC_022654	CAGGA	2	10	129752	129761	40 %	0 %	40 %	20 %	556559834
126	NC_022654	CCTCA	2	10	130224	130233	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
127	NC_022654	CGGGC	2	10	130295	130304	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
128	NC_022654	CCCGG	2	10	130396	130405	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
129	NC_022654	GCCGC	3	15	131760	131774	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
130	NC_022654	GCCAC	2	10	131861	131870	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
131	NC_022654	GTCGG	2	10	131917	131926	0 %	20 %	60 %	20 %	556559836
132	NC_022654	CATCC	2	10	131960	131969	20 %	20 %	0 %	60 %	556559836
133	NC_022654	GCGCC	2	10	132765	132774	0 %	0 %	40 %	60 %	556559837
134	NC_022654	CGCGC	2	10	132956	132965	0 %	0 %	40 %	60 %	556559837
135	NC_022654	GACCC	2	10	133082	133091	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
136	NC_022654	CCGCA	2	10	133775	133784	20 %	0 %	20 %	60 %	556559838
137	NC_022654	GCCAA	2	10	134509	134518	40 %	0 %	20 %	40 %	556559838
138	NC_022654	CGCAC	2	10	135933	135942	20 %	0 %	20 %	60 %	556559838
139	NC_022654	CCGCA	2	10	136257	136266	20 %	0 %	20 %	60 %	556559838
140	NC_022654	CGCTG	2	10	136693	136702	0 %	20 %	40 %	40 %	556559838
141	NC_022654	GCCCA	2	10	140384	140393	20 %	0 %	20 %	60 %	556559841
142	NC_022654	GGTCG	2	10	140975	140984	0 %	20 %	60 %	20 %	556559842
143	NC_022654	CAGCG	2	10	142642	142651	20 %	0 %	40 %	40 %	556559844
144	NC_022654	GCAGG	2	10	143503	143512	20 %	0 %	60 %	20 %	556559845

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.