MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium kansasii ATCC 12478 plasmid pMK12478

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022654	GCAG	2	8	239	246	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_022654	GCCG	2	8	492	499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_022654	CCGG	2	8	902	909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_022654	CCGG	2	8	1625	1632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_022654	CGGT	2	8	1843	1850	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_022654	AGCC	3	12	1984	1995	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_022654	GCTC	2	8	2094	2101	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_022654	CGCC	2	8	2145	2152	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9	NC_022654	GAGC	2	8	2280	2287	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_022654	TCGG	2	8	2350	2357	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_022654	CCAA	3	12	5450	5461	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_022654	CCAA	2	8	5468	5475	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_022654	GGCG	2	8	15183	15190	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14	NC_022654	GATA	2	8	18918	18925	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022654	GTTC	2	8	19955	19962	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_022654	ATCC	2	8	20848	20855	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_022654	CCCG	2	8	22878	22885	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18	NC_022654	CGCC	2	8	22915	22922	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19	NC_022654	CGAT	2	8	26418	26425	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_022654	GCCA	2	8	32743	32750	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_022654	CTCA	2	8	38481	38488	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_022654	GGCC	2	8	38489	38496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_022654	CGGT	2	8	38714	38721	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_022654	TGGT	2	8	43312	43319	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022654	TGGC	2	8	64947	64954	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_022654	CGGC	2	8	66762	66769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_022654	CGCC	2	8	76058	76065	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
28	NC_022654	CACC	2	8	76404	76411	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
29	NC_022654	AGTG	2	8	79940	79947	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022654	GGCA	2	8	85747	85754	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_022654	GCGG	2	8	85937	85944	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_022654	TCGC	2	8	87219	87226	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_022654	CACG	2	8	88529	88536	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_022654	CTGT	2	8	90190	90197	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_022654	CGAA	2	8	92195	92202	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_022654	CACC	2	8	93316	93323	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
37	NC_022654	GCGT	2	8	95291	95298	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_022654	TCGG	2	8	99981	99988	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_022654	GCGG	2	8	103461	103468	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_022654	CGGG	2	8	105796	105803	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
41	NC_022654	GCCG	2	8	105832	105839	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_022654	GCCA	2	8	105876	105883	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_022654	GCCG	2	8	107746	107753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_022654	CGGT	2	8	109716	109723	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_022654	TGTT	2	8	110299	110306	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022654	CGCT	2	8	110404	110411	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_022654	TCGC	2	8	110412	110419	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_022654	ACCC	2	8	110522	110529	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
49	NC_022654	CCGG	2	8	112354	112361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_022654	CGCT	2	8	112430	112437	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_022654	TGAA	2	8	112596	112603	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022654	TGTA	2	8	112691	112698	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022654	TTTC	2	8	112863	112870	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_022654	CCTG	2	8	112981	112988	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_022654	CTGC	2	8	113031	113038	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_022654	GGGC	2	8	117755	117762	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
57	NC_022654	GCCT	2	8	117796	117803	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_022654	CAGT	2	8	117947	117954	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_022654	GTCC	2	8	118009	118016	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_022654	ATAA	2	8	118136	118143	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022654	GGCC	2	8	118285	118292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_022654	CCAC	2	8	121081	121088	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
63	NC_022654	CCAC	2	8	123289	123296	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
64	NC_022654	GCCG	2	8	123922	123929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_022654	CCAC	2	8	126438	126445	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
66	NC_022654	CGGG	2	8	128873	128880	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
67	NC_022654	GGTC	2	8	129010	129017	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_022654	CGGG	2	8	130264	130271	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
69	NC_022654	GCCC	2	8	130273	130280	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
70	NC_022654	TTGC	2	8	131638	131645	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_022654	AACG	2	8	133205	133212	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_022654	GCCG	2	8	143005	143012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_022654	CCGC	2	8	143117	143124	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
74	NC_022654	CGTC	2	8	143135	143142	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_022654	GTTG	2	8	143923	143930	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022654	CGGT	2	8	143969	143976	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_022654	GGCT	2	8	144084	144091	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_022654	CGCA	2	8	144299	144306	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_022654	ACGA	2	8	144314	144321	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_022654	GCCA	2	8	144407	144414	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_022654	CCGG	2	8	144537	144544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.