MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium kansasii ATCC 12478 plasmid pMK12478

Total Repeats: 318

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022654	GGCA	2	8	2364	2371	25 %	0 %	50 %	25 %	556559713
2	NC_022654	GTCG	2	8	2517	2524	0 %	25 %	50 %	25 %	556559713
3	NC_022654	CCGG	2	8	2740	2747	0 %	0 %	50 %	50 %	556559713
4	NC_022654	TTCC	2	8	3215	3222	0 %	50 %	0 %	50 %	556559713
5	NC_022654	GCCG	2	8	3292	3299	0 %	0 %	50 %	50 %	556559713
6	NC_022654	CCCG	2	8	3546	3553	0 %	0 %	25 %	75 %	556559714
7	NC_022654	CCGA	2	8	3782	3789	25 %	0 %	25 %	50 %	556559714
8	NC_022654	AGGA	2	8	4450	4457	50 %	0 %	50 %	0 %	556559715
9	NC_022654	GGCT	2	8	4786	4793	0 %	25 %	50 %	25 %	556559715
10	NC_022654	AGCA	2	8	5001	5008	50 %	0 %	25 %	25 %	556559715
11	NC_022654	GTGC	2	8	5959	5966	0 %	25 %	50 %	25 %	556559717
12	NC_022654	TGGC	2	8	6323	6330	0 %	25 %	50 %	25 %	556559717
13	NC_022654	CGGC	2	8	7321	7328	0 %	0 %	50 %	50 %	556559718
14	NC_022654	GGTC	2	8	8193	8200	0 %	25 %	50 %	25 %	556559719
15	NC_022654	CGAC	2	8	8298	8305	25 %	0 %	25 %	50 %	556559720
16	NC_022654	GGGC	2	8	9507	9514	0 %	0 %	75 %	25 %	556559721
17	NC_022654	CCGC	2	8	10227	10234	0 %	0 %	25 %	75 %	556559723
18	NC_022654	CAGG	2	8	10851	10858	25 %	0 %	50 %	25 %	556559723
19	NC_022654	CAGG	2	8	10893	10900	25 %	0 %	50 %	25 %	556559723
20	NC_022654	ACGG	2	8	10999	11006	25 %	0 %	50 %	25 %	556559723
21	NC_022654	CGTG	2	8	12042	12049	0 %	25 %	50 %	25 %	556559725
22	NC_022654	CACG	2	8	12178	12185	25 %	0 %	25 %	50 %	556559725
23	NC_022654	GTCA	2	8	13598	13605	25 %	25 %	25 %	25 %	556559726
24	NC_022654	TTGA	2	8	13665	13672	25 %	50 %	25 %	0 %	556559727
25	NC_022654	CTCG	2	8	13704	13711	0 %	25 %	25 %	50 %	556559727
26	NC_022654	TGCA	2	8	14130	14137	25 %	25 %	25 %	25 %	556559727
27	NC_022654	GGTC	2	8	15913	15920	0 %	25 %	50 %	25 %	556559729
28	NC_022654	GTGG	2	8	16301	16308	0 %	25 %	75 %	0 %	556559729
29	NC_022654	CGGG	2	8	16404	16411	0 %	0 %	75 %	25 %	556559730
30	NC_022654	CCGG	2	8	16851	16858	0 %	0 %	50 %	50 %	556559730
31	NC_022654	AACG	2	8	16896	16903	50 %	0 %	25 %	25 %	556559730
32	NC_022654	CCAC	2	8	16957	16964	25 %	0 %	0 %	75 %	556559730
33	NC_022654	TCCA	2	8	17704	17711	25 %	25 %	0 %	50 %	556559731
34	NC_022654	GAGT	2	8	17734	17741	25 %	25 %	50 %	0 %	556559731
35	NC_022654	TTGC	2	8	18702	18709	0 %	50 %	25 %	25 %	556559846
36	NC_022654	GCCG	2	8	18854	18861	0 %	0 %	50 %	50 %	556559846
37	NC_022654	TGCG	2	8	20213	20220	0 %	25 %	50 %	25 %	556559848
38	NC_022654	GCCG	2	8	20362	20369	0 %	0 %	50 %	50 %	556559848
39	NC_022654	GGGC	2	8	21055	21062	0 %	0 %	75 %	25 %	556559732
40	NC_022654	CGGC	2	8	22395	22402	0 %	0 %	50 %	50 %	556559734
41	NC_022654	TCAA	2	8	22619	22626	50 %	25 %	0 %	25 %	556559734
42	NC_022654	AGCG	2	8	24600	24607	25 %	0 %	50 %	25 %	556559850
43	NC_022654	CGAC	2	8	24608	24615	25 %	0 %	25 %	50 %	556559850
44	NC_022654	TCGA	2	8	25151	25158	25 %	25 %	25 %	25 %	556559737
45	NC_022654	ATTC	2	8	26995	27002	25 %	50 %	0 %	25 %	556559738
46	NC_022654	CCGC	2	8	27203	27210	0 %	0 %	25 %	75 %	556559738
47	NC_022654	ATTC	2	8	27479	27486	25 %	50 %	0 %	25 %	556559739
48	NC_022654	CGCA	2	8	27498	27505	25 %	0 %	25 %	50 %	556559739
49	NC_022654	ACCC	2	8	27605	27612	25 %	0 %	0 %	75 %	556559739
50	NC_022654	CTGG	2	8	27629	27636	0 %	25 %	50 %	25 %	556559739
51	NC_022654	CTGC	2	8	28716	28723	0 %	25 %	25 %	50 %	556559739
52	NC_022654	CGGG	2	8	29269	29276	0 %	0 %	75 %	25 %	556559740
53	NC_022654	GATC	2	8	30504	30511	25 %	25 %	25 %	25 %	556559741
54	NC_022654	CCTC	2	8	30879	30886	0 %	25 %	0 %	75 %	556559741
55	NC_022654	CGGC	2	8	30955	30962	0 %	0 %	50 %	50 %	556559741
56	NC_022654	CACC	2	8	31055	31062	25 %	0 %	0 %	75 %	556559741
57	NC_022654	GATC	2	8	31349	31356	25 %	25 %	25 %	25 %	556559741
58	NC_022654	CTCC	2	8	33382	33389	0 %	25 %	0 %	75 %	556559854
59	NC_022654	CACG	2	8	33712	33719	25 %	0 %	25 %	50 %	556559854
60	NC_022654	GATC	2	8	34245	34252	25 %	25 %	25 %	25 %	556559855
61	NC_022654	GCCC	2	8	34380	34387	0 %	0 %	25 %	75 %	556559855
62	NC_022654	TGTC	2	8	34401	34408	0 %	50 %	25 %	25 %	556559855
63	NC_022654	GATG	2	8	34722	34729	25 %	25 %	50 %	0 %	556559855
64	NC_022654	TCCG	2	8	35742	35749	0 %	25 %	25 %	50 %	556559744
65	NC_022654	GGCC	2	8	36124	36131	0 %	0 %	50 %	50 %	556559745
66	NC_022654	CCCG	2	8	36742	36749	0 %	0 %	25 %	75 %	556559745
67	NC_022654	CGGC	2	8	36882	36889	0 %	0 %	50 %	50 %	556559745
68	NC_022654	CGGG	2	8	37017	37024	0 %	0 %	75 %	25 %	556559745
69	NC_022654	GACA	2	8	38054	38061	50 %	0 %	25 %	25 %	556559746
70	NC_022654	TGGC	2	8	38278	38285	0 %	25 %	50 %	25 %	556559746
71	NC_022654	GGCG	2	8	38333	38340	0 %	0 %	75 %	25 %	556559746
72	NC_022654	CAGA	2	8	38932	38939	50 %	0 %	25 %	25 %	556559747
73	NC_022654	GAGC	2	8	39309	39316	25 %	0 %	50 %	25 %	556559747
74	NC_022654	GTTG	2	8	40386	40393	0 %	50 %	50 %	0 %	556559748
75	NC_022654	CCCG	2	8	40506	40513	0 %	0 %	25 %	75 %	556559748
76	NC_022654	GCAA	2	8	40661	40668	50 %	0 %	25 %	25 %	556559748
77	NC_022654	CGGC	2	8	41230	41237	0 %	0 %	50 %	50 %	556559749
78	NC_022654	AGAT	2	8	42192	42199	50 %	25 %	25 %	0 %	556559752
79	NC_022654	GCGT	2	8	42551	42558	0 %	25 %	50 %	25 %	556559752
80	NC_022654	GTCC	2	8	42572	42579	0 %	25 %	25 %	50 %	556559752
81	NC_022654	TCGG	2	8	42902	42909	0 %	25 %	50 %	25 %	556559753
82	NC_022654	CAGA	2	8	43812	43819	50 %	0 %	25 %	25 %	556559754
83	NC_022654	GATC	2	8	44111	44118	25 %	25 %	25 %	25 %	556559754
84	NC_022654	CGGC	2	8	44180	44187	0 %	0 %	50 %	50 %	556559754
85	NC_022654	CGGC	2	8	44697	44704	0 %	0 %	50 %	50 %	556559755
86	NC_022654	GCGG	2	8	45974	45981	0 %	0 %	75 %	25 %	556559757
87	NC_022654	GACC	2	8	46168	46175	25 %	0 %	25 %	50 %	556559757
88	NC_022654	ACCA	2	8	46338	46345	50 %	0 %	0 %	50 %	556559757
89	NC_022654	GCCC	2	8	46381	46388	0 %	0 %	25 %	75 %	556559757
90	NC_022654	ACAT	2	8	46530	46537	50 %	25 %	0 %	25 %	556559757
91	NC_022654	GGTG	2	8	46584	46591	0 %	25 %	75 %	0 %	556559758
92	NC_022654	CGGG	2	8	46659	46666	0 %	0 %	75 %	25 %	556559758
93	NC_022654	GCCA	2	8	46700	46707	25 %	0 %	25 %	50 %	556559758
94	NC_022654	GCCA	2	8	46811	46818	25 %	0 %	25 %	50 %	556559758
95	NC_022654	CGGT	2	8	47075	47082	0 %	25 %	50 %	25 %	556559758
96	NC_022654	CCGA	2	8	47310	47317	25 %	0 %	25 %	50 %	556559759
97	NC_022654	CTCC	2	8	48144	48151	0 %	25 %	0 %	75 %	556559761
98	NC_022654	GCGA	2	8	48220	48227	25 %	0 %	50 %	25 %	556559761
99	NC_022654	CTGC	2	8	48665	48672	0 %	25 %	25 %	50 %	556559761
100	NC_022654	GCCT	2	8	49144	49151	0 %	25 %	25 %	50 %	556559761
101	NC_022654	CCAG	2	8	50027	50034	25 %	0 %	25 %	50 %	556559762
102	NC_022654	TGGG	2	8	50527	50534	0 %	25 %	75 %	0 %	556559764
103	NC_022654	CTGG	2	8	51701	51708	0 %	25 %	50 %	25 %	556559766
104	NC_022654	GCCG	2	8	51723	51730	0 %	0 %	50 %	50 %	556559766
105	NC_022654	CGGC	2	8	52087	52094	0 %	0 %	50 %	50 %	556559766
106	NC_022654	CCTG	2	8	52888	52895	0 %	25 %	25 %	50 %	556559766
107	NC_022654	CTGG	2	8	53114	53121	0 %	25 %	50 %	25 %	556559766
108	NC_022654	GCCA	2	8	53352	53359	25 %	0 %	25 %	50 %	556559766
109	NC_022654	CCGC	2	8	54194	54201	0 %	0 %	25 %	75 %	556559767
110	NC_022654	GCTG	2	8	54357	54364	0 %	25 %	50 %	25 %	556559767
111	NC_022654	TGGC	2	8	54500	54507	0 %	25 %	50 %	25 %	556559767
112	NC_022654	ACCC	2	8	55343	55350	25 %	0 %	0 %	75 %	556559767
113	NC_022654	CCGG	2	8	55968	55975	0 %	0 %	50 %	50 %	556559767
114	NC_022654	CGCC	2	8	56267	56274	0 %	0 %	25 %	75 %	556559768
115	NC_022654	TCGG	2	8	56283	56290	0 %	25 %	50 %	25 %	556559768
116	NC_022654	GCCC	3	12	56472	56483	0 %	0 %	25 %	75 %	556559769
117	NC_022654	CGGG	2	8	57540	57547	0 %	0 %	75 %	25 %	556559770
118	NC_022654	CGGG	2	8	57848	57855	0 %	0 %	75 %	25 %	556559770
119	NC_022654	TCGG	2	8	58193	58200	0 %	25 %	50 %	25 %	556559770
120	NC_022654	CGCA	2	8	58991	58998	25 %	0 %	25 %	50 %	556559771
121	NC_022654	TCGG	2	8	59052	59059	0 %	25 %	50 %	25 %	556559771
122	NC_022654	CAGC	2	8	59266	59273	25 %	0 %	25 %	50 %	556559771
123	NC_022654	GCCA	2	8	59577	59584	25 %	0 %	25 %	50 %	556559771
124	NC_022654	CCAG	2	8	59668	59675	25 %	0 %	25 %	50 %	556559771
125	NC_022654	CACC	2	8	59704	59711	25 %	0 %	0 %	75 %	556559771
126	NC_022654	GCCG	2	8	60197	60204	0 %	0 %	50 %	50 %	556559771
127	NC_022654	GCCG	2	8	60904	60911	0 %	0 %	50 %	50 %	556559772
128	NC_022654	ATCA	2	8	60976	60983	50 %	25 %	0 %	25 %	556559772
129	NC_022654	GTCG	2	8	60985	60992	0 %	25 %	50 %	25 %	556559772
130	NC_022654	CGCC	2	8	61080	61087	0 %	0 %	25 %	75 %	556559772
131	NC_022654	GGTC	2	8	61599	61606	0 %	25 %	50 %	25 %	556559772
132	NC_022654	AGCC	2	8	62095	62102	25 %	0 %	25 %	50 %	556559773
133	NC_022654	GAAC	2	8	62240	62247	50 %	0 %	25 %	25 %	556559773
134	NC_022654	CAGC	2	8	62297	62304	25 %	0 %	25 %	50 %	556559773
135	NC_022654	CGGT	2	8	62397	62404	0 %	25 %	50 %	25 %	556559773
136	NC_022654	CAGG	2	8	63403	63410	25 %	0 %	50 %	25 %	556559773
137	NC_022654	TGCG	2	8	63720	63727	0 %	25 %	50 %	25 %	556559774
138	NC_022654	GCCA	2	8	63728	63735	25 %	0 %	25 %	50 %	556559774
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.