MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium kansasii ATCC 12478 plasmid pMK12478

Total Repeats: 338

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022654	CGG	2	6	5	10	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_022654	CAG	2	6	37	42	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_022654	ACC	3	9	92	100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_022654	GCG	2	6	122	127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_022654	CCA	2	6	247	252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_022654	GCC	2	6	278	283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_022654	CGG	2	6	288	293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_022654	ACG	2	6	365	370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_022654	AGC	2	6	380	385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_022654	GCG	2	6	386	391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_022654	AGT	2	6	392	397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022654	CGC	2	6	400	405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_022654	GGT	2	6	414	419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022654	CCA	2	6	465	470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_022654	CGC	2	6	507	512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_022654	ACA	2	6	555	560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_022654	CTG	2	6	589	594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_022654	CTC	2	6	628	633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_022654	CCA	3	9	678	686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_022654	GAC	2	6	712	717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_022654	GCA	2	6	739	744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_022654	CCG	2	6	759	764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_022654	CAT	2	6	823	828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_022654	CGA	2	6	876	881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_022654	CAG	3	9	883	891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_022654	CCG	2	6	939	944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_022654	CAG	2	6	1006	1011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_022654	AAC	2	6	1013	1018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_022654	GCC	2	6	1019	1024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_022654	CGC	2	6	1045	1050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_022654	CAG	2	6	1171	1176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_022654	CTG	2	6	1177	1182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_022654	CGG	2	6	1203	1208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_022654	CCA	2	6	1213	1218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_022654	GGC	2	6	1270	1275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_022654	CGT	2	6	1281	1286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_022654	CCA	2	6	1329	1334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_022654	CAC	2	6	1349	1354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_022654	CAA	2	6	1405	1410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_022654	TTC	2	6	1457	1462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_022654	GTG	2	6	1478	1483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022654	CGT	2	6	1662	1667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_022654	CGG	2	6	1701	1706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_022654	CCG	2	6	1730	1735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_022654	TCG	2	6	1824	1829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_022654	CAC	2	6	1855	1860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_022654	GCT	2	6	1867	1872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_022654	GAC	2	6	1876	1881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_022654	CGT	3	9	1909	1917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_022654	CGT	2	6	2084	2089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_022654	CAC	2	6	2163	2168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_022654	TGA	2	6	2207	2212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022654	GCG	2	6	2303	2308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_022654	TCG	2	6	3432	3437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_022654	CAC	2	6	5337	5342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_022654	GCT	2	6	5418	5423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_022654	GCC	2	6	5741	5746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_022654	CAG	2	6	6928	6933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_022654	CGA	2	6	7443	7448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_022654	CCA	2	6	7480	7485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_022654	GGC	2	6	7507	7512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_022654	ATC	2	6	9915	9920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_022654	CCA	2	6	9997	10002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_022654	GGT	2	6	13126	13131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022654	CAT	2	6	13274	13279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_022654	CGG	2	6	13280	13285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_022654	GGA	2	6	14370	14375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022654	GGC	2	6	15014	15019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_022654	CGT	2	6	15090	15095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_022654	CAA	2	6	18982	18987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_022654	CTG	2	6	19060	19065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_022654	ACA	2	6	19186	19191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_022654	CCA	2	6	19315	19320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_022654	AGT	2	6	19388	19393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022654	CCA	2	6	19434	19439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_022654	CAA	2	6	19476	19481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_022654	CCG	2	6	19517	19522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_022654	CCT	2	6	19523	19528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_022654	CGC	2	6	19974	19979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_022654	CAG	2	6	20060	20065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_022654	CAC	3	9	20067	20075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_022654	GGC	2	6	20076	20081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_022654	GCC	2	6	20929	20934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_022654	GCT	2	6	20967	20972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_022654	TCA	2	6	21667	21672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_022654	AGT	2	6	21683	21688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022654	CGC	2	6	22205	22210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_022654	CGC	2	6	22283	22288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_022654	GCG	2	6	22304	22309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_022654	CGA	4	12	22831	22842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_022654	CGA	2	6	22899	22904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_022654	TCG	2	6	22936	22941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_022654	ATC	2	6	22994	22999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_022654	CAA	2	6	23589	23594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_022654	GAG	2	6	24694	24699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022654	CAA	2	6	25485	25490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_022654	CGA	2	6	25530	25535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_022654	TGA	2	6	25538	25543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022654	TCC	2	6	25604	25609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_022654	ACC	2	6	26124	26129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_022654	GAC	2	6	26192	26197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_022654	CGT	2	6	26233	26238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_022654	CGC	2	6	26282	26287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_022654	GGC	2	6	26372	26377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_022654	GCC	2	6	26406	26411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_022654	CCA	2	6	32716	32721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_022654	CTC	2	6	32726	32731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_022654	GGC	2	6	32995	33000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_022654	CAC	2	6	33048	33053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_022654	CGT	2	6	33060	33065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_022654	GGC	2	6	33106	33111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_022654	GCC	2	6	33221	33226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_022654	CGC	2	6	33227	33232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_022654	CAG	2	6	33246	33251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_022654	CGG	2	6	35547	35552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_022654	CGC	2	6	35976	35981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_022654	CAC	2	6	36025	36030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_022654	ATG	2	6	36047	36052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022654	TCA	2	6	36062	36067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_022654	CGG	2	6	36069	36074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_022654	CGC	2	6	36075	36080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_022654	CGC	2	6	38459	38464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_022654	CAC	2	6	38465	38470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_022654	TCG	2	6	38523	38528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_022654	CGA	2	6	38558	38563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_022654	AAC	2	6	38581	38586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_022654	CCG	2	6	38605	38610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_022654	ACC	2	6	38614	38619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_022654	TGG	2	6	38687	38692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022654	CAC	2	6	40693	40698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_022654	ACC	2	6	41325	41330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_022654	TGC	2	6	41355	41360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_022654	AAT	2	6	41724	41729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022654	GGT	2	6	41931	41936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022654	TGG	2	6	42014	42019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022654	ATT	2	6	42678	42683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022654	TGA	2	6	43357	43362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022654	CGG	2	6	43398	43403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_022654	AAC	2	6	47636	47641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_022654	AGG	2	6	47709	47714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022654	CAG	2	6	47716	47721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_022654	CCA	2	6	49246	49251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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278	NC_022654	TTC	2	6	123149	123154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_022654	CCA	2	6	123210	123215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
280	NC_022654	CGC	2	6	123404	123409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
281	NC_022654	TCG	2	6	123415	123420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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283	NC_022654	CAC	2	6	123879	123884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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299	NC_022654	CAC	2	6	127711	127716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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307	NC_022654	GGT	2	6	131559	131564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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309	NC_022654	CCG	2	6	131669	131674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
310	NC_022654	CGC	2	6	131685	131690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
311	NC_022654	CGC	2	6	131759	131764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
312	NC_022654	GCC	2	6	132466	132471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
313	NC_022654	TCA	2	6	132480	132485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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337	NC_022654	GCC	2	6	144910	144915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
338	NC_022654	TCA	2	6	144930	144935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.