MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Mycobacterium kansasii ATCC 12478 plasmid pMK12478

Total Repeats: 349

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022654	CG	3	6	787	792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_022654	CG	3	6	1066	1071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_022654	GC	3	6	1258	1263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_022654	GC	3	6	1669	1674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_022654	GC	3	6	1802	1807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_022654	AC	3	6	2065	2070	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_022654	CG	3	6	2288	2293	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_022654	GC	3	6	2580	2585	0 %	0 %	50 %	50 %	556559713
9	NC_022654	GC	3	6	4235	4240	0 %	0 %	50 %	50 %	556559714
10	NC_022654	GC	3	6	4572	4577	0 %	0 %	50 %	50 %	556559715
11	NC_022654	GC	3	6	4671	4676	0 %	0 %	50 %	50 %	556559715
12	NC_022654	GC	5	10	4681	4690	0 %	0 %	50 %	50 %	556559715
13	NC_022654	CG	4	8	4691	4698	0 %	0 %	50 %	50 %	556559715
14	NC_022654	GC	3	6	4904	4909	0 %	0 %	50 %	50 %	556559715
15	NC_022654	AG	3	6	5888	5893	50 %	0 %	50 %	0 %	556559717
16	NC_022654	CA	3	6	6300	6305	50 %	0 %	0 %	50 %	556559717
17	NC_022654	GT	3	6	6348	6353	0 %	50 %	50 %	0 %	556559717
18	NC_022654	AC	3	6	6802	6807	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_022654	GA	3	6	7731	7736	50 %	0 %	50 %	0 %	556559719
20	NC_022654	GC	3	6	8313	8318	0 %	0 %	50 %	50 %	556559720
21	NC_022654	CG	4	8	8333	8340	0 %	0 %	50 %	50 %	556559720
22	NC_022654	GC	4	8	8349	8356	0 %	0 %	50 %	50 %	556559720
23	NC_022654	GC	3	6	8727	8732	0 %	0 %	50 %	50 %	556559720
24	NC_022654	GC	3	6	8784	8789	0 %	0 %	50 %	50 %	556559720
25	NC_022654	GC	3	6	9277	9282	0 %	0 %	50 %	50 %	556559721
26	NC_022654	CG	3	6	9556	9561	0 %	0 %	50 %	50 %	556559721
27	NC_022654	GC	4	8	9759	9766	0 %	0 %	50 %	50 %	556559722
28	NC_022654	AC	3	6	10759	10764	50 %	0 %	0 %	50 %	556559723
29	NC_022654	CG	3	6	10779	10784	0 %	0 %	50 %	50 %	556559723
30	NC_022654	GC	3	6	11149	11154	0 %	0 %	50 %	50 %	556559724
31	NC_022654	GC	3	6	11521	11526	0 %	0 %	50 %	50 %	556559724
32	NC_022654	GC	3	6	11751	11756	0 %	0 %	50 %	50 %	556559724
33	NC_022654	AC	4	8	12060	12067	50 %	0 %	0 %	50 %	556559725
34	NC_022654	CG	3	6	12434	12439	0 %	0 %	50 %	50 %	556559725
35	NC_022654	CG	4	8	13411	13418	0 %	0 %	50 %	50 %	556559726
36	NC_022654	CG	3	6	14484	14489	0 %	0 %	50 %	50 %	556559728
37	NC_022654	CA	3	6	14629	14634	50 %	0 %	0 %	50 %	556559728
38	NC_022654	GC	3	6	14685	14690	0 %	0 %	50 %	50 %	556559728
39	NC_022654	CG	3	6	14789	14794	0 %	0 %	50 %	50 %	556559728
40	NC_022654	GT	3	6	15648	15653	0 %	50 %	50 %	0 %	556559729
41	NC_022654	CA	3	6	16171	16176	50 %	0 %	0 %	50 %	556559729
42	NC_022654	GC	3	6	16589	16594	0 %	0 %	50 %	50 %	556559730
43	NC_022654	CG	3	6	16923	16928	0 %	0 %	50 %	50 %	556559730
44	NC_022654	CG	3	6	17313	17318	0 %	0 %	50 %	50 %	556559731
45	NC_022654	AC	3	6	18440	18445	50 %	0 %	0 %	50 %	556559846
46	NC_022654	CG	3	6	18449	18454	0 %	0 %	50 %	50 %	556559846
47	NC_022654	GC	3	6	18708	18713	0 %	0 %	50 %	50 %	556559846
48	NC_022654	GC	3	6	21101	21106	0 %	0 %	50 %	50 %	556559732
49	NC_022654	CG	3	6	21303	21308	0 %	0 %	50 %	50 %	556559732
50	NC_022654	CG	3	6	21880	21885	0 %	0 %	50 %	50 %	556559733
51	NC_022654	CG	3	6	22191	22196	0 %	0 %	50 %	50 %	556559733
52	NC_022654	CG	4	8	22432	22439	0 %	0 %	50 %	50 %	556559734
53	NC_022654	GC	3	6	23112	23117	0 %	0 %	50 %	50 %	556559735
54	NC_022654	GC	4	8	23368	23375	0 %	0 %	50 %	50 %	556559735
55	NC_022654	GC	3	6	23605	23610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_022654	AC	3	6	24354	24359	50 %	0 %	0 %	50 %	556559736
57	NC_022654	GC	3	6	24374	24379	0 %	0 %	50 %	50 %	556559736
58	NC_022654	CG	3	6	25522	25527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_022654	GC	3	6	25812	25817	0 %	0 %	50 %	50 %	556559851
60	NC_022654	TG	3	6	26138	26143	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022654	GC	3	6	29508	29513	0 %	0 %	50 %	50 %	556559740
62	NC_022654	GC	3	6	30433	30438	0 %	0 %	50 %	50 %	556559741
63	NC_022654	GC	4	8	30472	30479	0 %	0 %	50 %	50 %	556559741
64	NC_022654	CG	4	8	31307	31314	0 %	0 %	50 %	50 %	556559741
65	NC_022654	CG	3	6	31702	31707	0 %	0 %	50 %	50 %	556559742
66	NC_022654	CG	3	6	32341	32346	0 %	0 %	50 %	50 %	556559742
67	NC_022654	AC	3	6	32603	32608	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_022654	CA	3	6	32720	32725	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_022654	GC	3	6	32927	32932	0 %	0 %	50 %	50 %	556559853
70	NC_022654	GC	4	8	33346	33353	0 %	0 %	50 %	50 %	556559854
71	NC_022654	CG	3	6	33402	33407	0 %	0 %	50 %	50 %	556559854
72	NC_022654	GC	3	6	33864	33869	0 %	0 %	50 %	50 %	556559854
73	NC_022654	TC	4	8	33941	33948	0 %	50 %	0 %	50 %	556559854
74	NC_022654	CG	3	6	34004	34009	0 %	0 %	50 %	50 %	556559854
75	NC_022654	CG	3	6	34662	34667	0 %	0 %	50 %	50 %	556559855
76	NC_022654	CG	3	6	35490	35495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_022654	AC	3	6	35536	35541	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_022654	GC	3	6	35819	35824	0 %	0 %	50 %	50 %	556559744
79	NC_022654	CG	3	6	35831	35836	0 %	0 %	50 %	50 %	556559744
80	NC_022654	GC	3	6	36395	36400	0 %	0 %	50 %	50 %	556559745
81	NC_022654	CG	3	6	36413	36418	0 %	0 %	50 %	50 %	556559745
82	NC_022654	GC	3	6	36586	36591	0 %	0 %	50 %	50 %	556559745
83	NC_022654	GC	3	6	36725	36730	0 %	0 %	50 %	50 %	556559745
84	NC_022654	GC	3	6	36909	36914	0 %	0 %	50 %	50 %	556559745
85	NC_022654	CG	3	6	37310	37315	0 %	0 %	50 %	50 %	556559746
86	NC_022654	CG	3	6	37474	37479	0 %	0 %	50 %	50 %	556559746
87	NC_022654	CG	4	8	37486	37493	0 %	0 %	50 %	50 %	556559746
88	NC_022654	GC	3	6	37541	37546	0 %	0 %	50 %	50 %	556559746
89	NC_022654	CG	3	6	38094	38099	0 %	0 %	50 %	50 %	556559746
90	NC_022654	GC	3	6	39249	39254	0 %	0 %	50 %	50 %	556559747
91	NC_022654	GC	3	6	39570	39575	0 %	0 %	50 %	50 %	556559747
92	NC_022654	GC	3	6	39636	39641	0 %	0 %	50 %	50 %	556559747
93	NC_022654	GC	3	6	39722	39727	0 %	0 %	50 %	50 %	556559747
94	NC_022654	CG	3	6	39848	39853	0 %	0 %	50 %	50 %	556559747
95	NC_022654	GT	3	6	40082	40087	0 %	50 %	50 %	0 %	556559747
96	NC_022654	GC	3	6	40307	40312	0 %	0 %	50 %	50 %	556559748
97	NC_022654	GT	3	6	41076	41081	0 %	50 %	50 %	0 %	556559749
98	NC_022654	GC	3	6	41145	41150	0 %	0 %	50 %	50 %	556559749
99	NC_022654	TC	3	6	41298	41303	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_022654	GT	3	6	41428	41433	0 %	50 %	50 %	0 %	556559750
101	NC_022654	CG	3	6	42444	42449	0 %	0 %	50 %	50 %	556559752
102	NC_022654	GC	3	6	42887	42892	0 %	0 %	50 %	50 %	556559753
103	NC_022654	GT	3	6	43047	43052	0 %	50 %	50 %	0 %	556559753
104	NC_022654	GC	4	8	43597	43604	0 %	0 %	50 %	50 %	556559754
105	NC_022654	GC	3	6	45054	45059	0 %	0 %	50 %	50 %	556559756
106	NC_022654	GC	4	8	45110	45117	0 %	0 %	50 %	50 %	556559756
107	NC_022654	GC	3	6	45453	45458	0 %	0 %	50 %	50 %	556559757
108	NC_022654	TG	3	6	46456	46461	0 %	50 %	50 %	0 %	556559757
109	NC_022654	CG	3	6	47016	47021	0 %	0 %	50 %	50 %	556559758
110	NC_022654	GC	3	6	47878	47883	0 %	0 %	50 %	50 %	556559760
111	NC_022654	CG	3	6	47884	47889	0 %	0 %	50 %	50 %	556559760
112	NC_022654	AC	3	6	48316	48321	50 %	0 %	0 %	50 %	556559761
113	NC_022654	GC	3	6	49013	49018	0 %	0 %	50 %	50 %	556559761
114	NC_022654	TG	3	6	49459	49464	0 %	50 %	50 %	0 %	556559762
115	NC_022654	TG	3	6	50540	50545	0 %	50 %	50 %	0 %	556559764
116	NC_022654	CT	3	6	50674	50679	0 %	50 %	0 %	50 %	556559764
117	NC_022654	CA	3	6	50732	50737	50 %	0 %	0 %	50 %	556559765
118	NC_022654	CG	3	6	50837	50842	0 %	0 %	50 %	50 %	556559765
119	NC_022654	AC	3	6	50953	50958	50 %	0 %	0 %	50 %	556559765
120	NC_022654	CG	3	6	51056	51061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_022654	GC	3	6	51344	51349	0 %	0 %	50 %	50 %	556559766
122	NC_022654	AC	3	6	52577	52582	50 %	0 %	0 %	50 %	556559766
123	NC_022654	GC	3	6	53151	53156	0 %	0 %	50 %	50 %	556559766
124	NC_022654	GC	3	6	53932	53937	0 %	0 %	50 %	50 %	556559766
125	NC_022654	GC	3	6	54044	54049	0 %	0 %	50 %	50 %	556559766
126	NC_022654	GC	3	6	54082	54087	0 %	0 %	50 %	50 %	556559767
127	NC_022654	GC	3	6	55207	55212	0 %	0 %	50 %	50 %	556559767
128	NC_022654	CG	3	6	55213	55218	0 %	0 %	50 %	50 %	556559767
129	NC_022654	CG	3	6	55354	55359	0 %	0 %	50 %	50 %	556559767
130	NC_022654	CG	3	6	55539	55544	0 %	0 %	50 %	50 %	556559767
131	NC_022654	GC	3	6	55663	55668	0 %	0 %	50 %	50 %	556559767
132	NC_022654	GC	3	6	56005	56010	0 %	0 %	50 %	50 %	556559767
133	NC_022654	CA	3	6	56113	56118	50 %	0 %	0 %	50 %	556559767
134	NC_022654	GA	3	6	56124	56129	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022654	GT	3	6	57560	57565	0 %	50 %	50 %	0 %	556559770
136	NC_022654	CG	3	6	59161	59166	0 %	0 %	50 %	50 %	556559771
137	NC_022654	TG	3	6	59887	59892	0 %	50 %	50 %	0 %	556559771
138	NC_022654	AC	3	6	60283	60288	50 %	0 %	0 %	50 %	556559772
139	NC_022654	CG	3	6	60474	60479	0 %	0 %	50 %	50 %	556559772
140	NC_022654	CG	3	6	60544	60549	0 %	0 %	50 %	50 %	556559772
141	NC_022654	CG	3	6	60654	60659	0 %	0 %	50 %	50 %	556559772
142	NC_022654	GA	3	6	61134	61139	50 %	0 %	50 %	0 %	556559772
143	NC_022654	CG	3	6	61336	61341	0 %	0 %	50 %	50 %	556559772
144	NC_022654	GC	3	6	62558	62563	0 %	0 %	50 %	50 %	556559773
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348	NC_022654	GC	3	6	143998	144003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
349	NC_022654	CG	3	6	144727	144732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.