MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium kansasii ATCC 12478 plasmid pMK12478

Total Repeats: 286

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022654	GC	3	6	2580	2585	0 %	0 %	50 %	50 %	556559713
2	NC_022654	GC	3	6	4235	4240	0 %	0 %	50 %	50 %	556559714
3	NC_022654	GC	3	6	4572	4577	0 %	0 %	50 %	50 %	556559715
4	NC_022654	GC	3	6	4671	4676	0 %	0 %	50 %	50 %	556559715
5	NC_022654	GC	5	10	4681	4690	0 %	0 %	50 %	50 %	556559715
6	NC_022654	CG	4	8	4691	4698	0 %	0 %	50 %	50 %	556559715
7	NC_022654	GC	3	6	4904	4909	0 %	0 %	50 %	50 %	556559715
8	NC_022654	AG	3	6	5888	5893	50 %	0 %	50 %	0 %	556559717
9	NC_022654	CA	3	6	6300	6305	50 %	0 %	0 %	50 %	556559717
10	NC_022654	GT	3	6	6348	6353	0 %	50 %	50 %	0 %	556559717
11	NC_022654	GA	3	6	7731	7736	50 %	0 %	50 %	0 %	556559719
12	NC_022654	GC	3	6	8313	8318	0 %	0 %	50 %	50 %	556559720
13	NC_022654	CG	4	8	8333	8340	0 %	0 %	50 %	50 %	556559720
14	NC_022654	GC	4	8	8349	8356	0 %	0 %	50 %	50 %	556559720
15	NC_022654	GC	3	6	8727	8732	0 %	0 %	50 %	50 %	556559720
16	NC_022654	GC	3	6	8784	8789	0 %	0 %	50 %	50 %	556559720
17	NC_022654	GC	3	6	9277	9282	0 %	0 %	50 %	50 %	556559721
18	NC_022654	CG	3	6	9556	9561	0 %	0 %	50 %	50 %	556559721
19	NC_022654	GC	4	8	9759	9766	0 %	0 %	50 %	50 %	556559722
20	NC_022654	AC	3	6	10759	10764	50 %	0 %	0 %	50 %	556559723
21	NC_022654	CG	3	6	10779	10784	0 %	0 %	50 %	50 %	556559723
22	NC_022654	GC	3	6	11149	11154	0 %	0 %	50 %	50 %	556559724
23	NC_022654	GC	3	6	11521	11526	0 %	0 %	50 %	50 %	556559724
24	NC_022654	GC	3	6	11751	11756	0 %	0 %	50 %	50 %	556559724
25	NC_022654	AC	4	8	12060	12067	50 %	0 %	0 %	50 %	556559725
26	NC_022654	CG	3	6	12434	12439	0 %	0 %	50 %	50 %	556559725
27	NC_022654	CG	4	8	13411	13418	0 %	0 %	50 %	50 %	556559726
28	NC_022654	CG	3	6	14484	14489	0 %	0 %	50 %	50 %	556559728
29	NC_022654	CA	3	6	14629	14634	50 %	0 %	0 %	50 %	556559728
30	NC_022654	GC	3	6	14685	14690	0 %	0 %	50 %	50 %	556559728
31	NC_022654	CG	3	6	14789	14794	0 %	0 %	50 %	50 %	556559728
32	NC_022654	GT	3	6	15648	15653	0 %	50 %	50 %	0 %	556559729
33	NC_022654	CA	3	6	16171	16176	50 %	0 %	0 %	50 %	556559729
34	NC_022654	GC	3	6	16589	16594	0 %	0 %	50 %	50 %	556559730
35	NC_022654	CG	3	6	16923	16928	0 %	0 %	50 %	50 %	556559730
36	NC_022654	CG	3	6	17313	17318	0 %	0 %	50 %	50 %	556559731
37	NC_022654	AC	3	6	18440	18445	50 %	0 %	0 %	50 %	556559846
38	NC_022654	CG	3	6	18449	18454	0 %	0 %	50 %	50 %	556559846
39	NC_022654	GC	3	6	18708	18713	0 %	0 %	50 %	50 %	556559846
40	NC_022654	GC	3	6	21101	21106	0 %	0 %	50 %	50 %	556559732
41	NC_022654	CG	3	6	21303	21308	0 %	0 %	50 %	50 %	556559732
42	NC_022654	CG	3	6	21880	21885	0 %	0 %	50 %	50 %	556559733
43	NC_022654	CG	3	6	22191	22196	0 %	0 %	50 %	50 %	556559733
44	NC_022654	CG	4	8	22432	22439	0 %	0 %	50 %	50 %	556559734
45	NC_022654	GC	3	6	23112	23117	0 %	0 %	50 %	50 %	556559735
46	NC_022654	GC	4	8	23368	23375	0 %	0 %	50 %	50 %	556559735
47	NC_022654	AC	3	6	24354	24359	50 %	0 %	0 %	50 %	556559736
48	NC_022654	GC	3	6	24374	24379	0 %	0 %	50 %	50 %	556559736
49	NC_022654	GC	3	6	25812	25817	0 %	0 %	50 %	50 %	556559851
50	NC_022654	GC	3	6	29508	29513	0 %	0 %	50 %	50 %	556559740
51	NC_022654	GC	3	6	30433	30438	0 %	0 %	50 %	50 %	556559741
52	NC_022654	GC	4	8	30472	30479	0 %	0 %	50 %	50 %	556559741
53	NC_022654	CG	4	8	31307	31314	0 %	0 %	50 %	50 %	556559741
54	NC_022654	CG	3	6	31702	31707	0 %	0 %	50 %	50 %	556559742
55	NC_022654	CG	3	6	32341	32346	0 %	0 %	50 %	50 %	556559742
56	NC_022654	GC	3	6	32927	32932	0 %	0 %	50 %	50 %	556559853
57	NC_022654	GC	4	8	33346	33353	0 %	0 %	50 %	50 %	556559854
58	NC_022654	CG	3	6	33402	33407	0 %	0 %	50 %	50 %	556559854
59	NC_022654	GC	3	6	33864	33869	0 %	0 %	50 %	50 %	556559854
60	NC_022654	TC	4	8	33941	33948	0 %	50 %	0 %	50 %	556559854
61	NC_022654	CG	3	6	34004	34009	0 %	0 %	50 %	50 %	556559854
62	NC_022654	CG	3	6	34662	34667	0 %	0 %	50 %	50 %	556559855
63	NC_022654	GC	3	6	35819	35824	0 %	0 %	50 %	50 %	556559744
64	NC_022654	CG	3	6	35831	35836	0 %	0 %	50 %	50 %	556559744
65	NC_022654	GC	3	6	36395	36400	0 %	0 %	50 %	50 %	556559745
66	NC_022654	CG	3	6	36413	36418	0 %	0 %	50 %	50 %	556559745
67	NC_022654	GC	3	6	36586	36591	0 %	0 %	50 %	50 %	556559745
68	NC_022654	GC	3	6	36725	36730	0 %	0 %	50 %	50 %	556559745
69	NC_022654	GC	3	6	36909	36914	0 %	0 %	50 %	50 %	556559745
70	NC_022654	CG	3	6	37310	37315	0 %	0 %	50 %	50 %	556559746
71	NC_022654	CG	3	6	37474	37479	0 %	0 %	50 %	50 %	556559746
72	NC_022654	CG	4	8	37486	37493	0 %	0 %	50 %	50 %	556559746
73	NC_022654	GC	3	6	37541	37546	0 %	0 %	50 %	50 %	556559746
74	NC_022654	CG	3	6	38094	38099	0 %	0 %	50 %	50 %	556559746
75	NC_022654	GC	3	6	39249	39254	0 %	0 %	50 %	50 %	556559747
76	NC_022654	GC	3	6	39570	39575	0 %	0 %	50 %	50 %	556559747
77	NC_022654	GC	3	6	39636	39641	0 %	0 %	50 %	50 %	556559747
78	NC_022654	GC	3	6	39722	39727	0 %	0 %	50 %	50 %	556559747
79	NC_022654	CG	3	6	39848	39853	0 %	0 %	50 %	50 %	556559747
80	NC_022654	GT	3	6	40082	40087	0 %	50 %	50 %	0 %	556559747
81	NC_022654	GC	3	6	40307	40312	0 %	0 %	50 %	50 %	556559748
82	NC_022654	GT	3	6	41076	41081	0 %	50 %	50 %	0 %	556559749
83	NC_022654	GC	3	6	41145	41150	0 %	0 %	50 %	50 %	556559749
84	NC_022654	GT	3	6	41428	41433	0 %	50 %	50 %	0 %	556559750
85	NC_022654	CG	3	6	42444	42449	0 %	0 %	50 %	50 %	556559752
86	NC_022654	GC	3	6	42887	42892	0 %	0 %	50 %	50 %	556559753
87	NC_022654	GT	3	6	43047	43052	0 %	50 %	50 %	0 %	556559753
88	NC_022654	GC	4	8	43597	43604	0 %	0 %	50 %	50 %	556559754
89	NC_022654	GC	3	6	45054	45059	0 %	0 %	50 %	50 %	556559756
90	NC_022654	GC	4	8	45110	45117	0 %	0 %	50 %	50 %	556559756
91	NC_022654	GC	3	6	45453	45458	0 %	0 %	50 %	50 %	556559757
92	NC_022654	TG	3	6	46456	46461	0 %	50 %	50 %	0 %	556559757
93	NC_022654	CG	3	6	47016	47021	0 %	0 %	50 %	50 %	556559758
94	NC_022654	GC	3	6	47878	47883	0 %	0 %	50 %	50 %	556559760
95	NC_022654	CG	3	6	47884	47889	0 %	0 %	50 %	50 %	556559760
96	NC_022654	AC	3	6	48316	48321	50 %	0 %	0 %	50 %	556559761
97	NC_022654	GC	3	6	49013	49018	0 %	0 %	50 %	50 %	556559761
98	NC_022654	TG	3	6	49459	49464	0 %	50 %	50 %	0 %	556559762
99	NC_022654	TG	3	6	50540	50545	0 %	50 %	50 %	0 %	556559764
100	NC_022654	CT	3	6	50674	50679	0 %	50 %	0 %	50 %	556559764
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102	NC_022654	CG	3	6	50837	50842	0 %	0 %	50 %	50 %	556559765
103	NC_022654	AC	3	6	50953	50958	50 %	0 %	0 %	50 %	556559765
104	NC_022654	GC	3	6	51344	51349	0 %	0 %	50 %	50 %	556559766
105	NC_022654	AC	3	6	52577	52582	50 %	0 %	0 %	50 %	556559766
106	NC_022654	GC	3	6	53151	53156	0 %	0 %	50 %	50 %	556559766
107	NC_022654	GC	3	6	53932	53937	0 %	0 %	50 %	50 %	556559766
108	NC_022654	GC	3	6	54044	54049	0 %	0 %	50 %	50 %	556559766
109	NC_022654	GC	3	6	54082	54087	0 %	0 %	50 %	50 %	556559767
110	NC_022654	GC	3	6	55207	55212	0 %	0 %	50 %	50 %	556559767
111	NC_022654	CG	3	6	55213	55218	0 %	0 %	50 %	50 %	556559767
112	NC_022654	CG	3	6	55354	55359	0 %	0 %	50 %	50 %	556559767
113	NC_022654	CG	3	6	55539	55544	0 %	0 %	50 %	50 %	556559767
114	NC_022654	GC	3	6	55663	55668	0 %	0 %	50 %	50 %	556559767
115	NC_022654	GC	3	6	56005	56010	0 %	0 %	50 %	50 %	556559767
116	NC_022654	CA	3	6	56113	56118	50 %	0 %	0 %	50 %	556559767
117	NC_022654	GT	3	6	57560	57565	0 %	50 %	50 %	0 %	556559770
118	NC_022654	CG	3	6	59161	59166	0 %	0 %	50 %	50 %	556559771
119	NC_022654	TG	3	6	59887	59892	0 %	50 %	50 %	0 %	556559771
120	NC_022654	AC	3	6	60283	60288	50 %	0 %	0 %	50 %	556559772
121	NC_022654	CG	3	6	60474	60479	0 %	0 %	50 %	50 %	556559772
122	NC_022654	CG	3	6	60544	60549	0 %	0 %	50 %	50 %	556559772
123	NC_022654	CG	3	6	60654	60659	0 %	0 %	50 %	50 %	556559772
124	NC_022654	GA	3	6	61134	61139	50 %	0 %	50 %	0 %	556559772
125	NC_022654	CG	3	6	61336	61341	0 %	0 %	50 %	50 %	556559772
126	NC_022654	GC	3	6	62558	62563	0 %	0 %	50 %	50 %	556559773
127	NC_022654	GC	3	6	62867	62872	0 %	0 %	50 %	50 %	556559773
128	NC_022654	GC	3	6	62888	62893	0 %	0 %	50 %	50 %	556559773
129	NC_022654	CG	3	6	63037	63042	0 %	0 %	50 %	50 %	556559773
130	NC_022654	GC	3	6	65081	65086	0 %	0 %	50 %	50 %	556559775
131	NC_022654	GC	4	8	65273	65280	0 %	0 %	50 %	50 %	556559775
132	NC_022654	GC	3	6	65357	65362	0 %	0 %	50 %	50 %	556559775
133	NC_022654	GC	3	6	65561	65566	0 %	0 %	50 %	50 %	556559775
134	NC_022654	CG	3	6	65629	65634	0 %	0 %	50 %	50 %	556559775
135	NC_022654	GC	3	6	65737	65742	0 %	0 %	50 %	50 %	556559775
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139	NC_022654	GC	3	6	69301	69306	0 %	0 %	50 %	50 %	556559780
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141	NC_022654	AC	3	6	69828	69833	50 %	0 %	0 %	50 %	556559780
142	NC_022654	GC	3	6	70063	70068	0 %	0 %	50 %	50 %	556559780
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283	NC_022654	CG	3	6	140884	140889	0 %	0 %	50 %	50 %	556559842
284	NC_022654	CA	3	6	142620	142625	50 %	0 %	0 %	50 %	556559844
285	NC_022654	CG	3	6	143388	143393	0 %	0 %	50 %	50 %	556559845
286	NC_022654	GC	4	8	143764	143771	0 %	0 %	50 %	50 %	556559845

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.