MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens CC178

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022653	TTTGAA	2	12	17424	17435	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022653	TCATAT	2	12	65774	65785	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_022653	AACACC	2	12	80093	80104	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_022653	AGTCAA	2	12	102374	102385	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_022653	TTAACT	2	12	155432	155443	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_022653	AGGTAT	2	12	167056	167067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022653	TTTTCT	2	12	167607	167618	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_022653	TTTATA	2	12	201942	201953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022653	CAAAGT	2	12	226024	226035	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_022653	GAGAAT	2	12	268421	268432	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022653	GATAAA	2	12	317153	317164	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022653	ATTGAT	2	12	318559	318570	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022653	ACGATT	2	12	330002	330013	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_022653	ATATCA	2	12	333413	333424	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_022653	TTTTTC	2	12	431720	431731	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_022653	TTTCTT	2	12	458131	458142	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_022653	AAACGG	2	12	458361	458372	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_022653	AATAAA	2	12	460480	460491	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022653	CGGCTC	2	12	473488	473499	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
20	NC_022653	ACATGA	2	12	478333	478344	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_022653	AAATAA	2	12	512980	512991	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022653	TAAAGA	2	12	517838	517849	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022653	ATCCTC	2	12	525769	525780	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_022653	ATGTGA	2	12	565375	565386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022653	ATTAAT	2	12	621184	621195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022653	AAAAGG	2	12	636082	636093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022653	TCAATC	2	12	652527	652538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_022653	CTTTCT	2	12	664774	664785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_022653	TTTCTC	2	12	684722	684733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_022653	CAATGT	2	12	705097	705108	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_022653	AAATGA	2	12	712809	712820	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022653	GGTACA	2	12	725779	725790	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_022653	AAAAAT	2	12	735641	735652	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022653	GTTTAC	2	12	749325	749336	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_022653	TTTTTC	2	12	805433	805444	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_022653	CTTTTT	2	12	812827	812838	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_022653	GGATTT	2	12	813376	813387	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022653	TAAAAA	2	12	815196	815207	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022653	TTTTTA	2	12	833856	833867	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022653	TCATTT	2	12	847143	847154	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_022653	AAAAAG	2	12	867244	867255	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022653	TTATAT	2	12	877982	877993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022653	GTGCTG	2	12	880833	880844	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_022653	CATCTT	2	12	882684	882695	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_022653	CCTTTC	2	12	914667	914678	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_022653	ATGCTC	2	12	1016749	1016760	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_022653	TCTTTT	2	12	1033477	1033488	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_022653	GAAAAA	2	12	1036506	1036517	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022653	GAAAAG	2	12	1042339	1042350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022653	TTACTA	2	12	1047500	1047511	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_022653	TGGCGA	2	12	1075543	1075554	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_022653	GTAACA	2	12	1168826	1168837	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_022653	AAATTT	2	12	1169138	1169149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022653	TTTTGT	2	12	1187075	1187086	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022653	GAAATT	2	12	1331525	1331536	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022653	TAATTG	2	12	1333371	1333382	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022653	ATCATT	2	12	1350019	1350030	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_022653	TATTTA	2	12	1386991	1387002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022653	TACAAA	2	12	1455355	1455366	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_022653	TCAAAC	2	12	1464805	1464816	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_022653	CTTTTT	2	12	1509193	1509204	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_022653	TCCGGT	2	12	1587173	1587184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_022653	TAAAAA	2	12	1803152	1803163	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022653	TGTTCT	2	12	1807814	1807825	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_022653	AAAATG	2	12	1814520	1814531	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022653	GATATA	2	12	1828326	1828337	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022653	TAAAAA	2	12	1828346	1828357	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022653	TAAAAT	2	12	1843362	1843373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022653	CTCTAT	2	12	1860395	1860406	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_022653	GTCATT	2	12	1863213	1863224	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_022653	ATAAAA	2	12	1968921	1968932	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022653	AAGAGA	2	12	1968998	1969009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022653	TATAAC	2	12	1987107	1987118	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_022653	CGTATT	2	12	1988304	1988315	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_022653	TACACA	2	12	1988435	1988446	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_022653	TATTGC	2	12	2000318	2000329	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_022653	CTTTTT	2	12	2011845	2011856	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_022653	CCTTCC	2	12	2043633	2043644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_022653	GCACTT	2	12	2077963	2077974	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_022653	CTTTTT	2	12	2083425	2083436	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_022653	TAATGC	2	12	2087681	2087692	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_022653	AAATAA	2	12	2119060	2119071	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022653	ATAAAA	2	12	2343443	2343454	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022653	CGTCAT	2	12	2358595	2358606	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_022653	ATATTT	2	12	2362687	2362698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022653	CAATCT	2	12	2406820	2406831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_022653	ACCGTT	2	12	2412492	2412503	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_022653	TGAAAA	2	12	2415324	2415335	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022653	TTCTAA	2	12	2466505	2466516	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_022653	TGACTT	2	12	2492623	2492634	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_022653	GAAGCA	2	12	2514467	2514478	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_022653	AATAAA	2	12	2526974	2526985	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022653	GAATCA	2	12	2649304	2649315	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_022653	CCCTCT	2	12	2668590	2668601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_022653	GCTTTT	2	12	2713221	2713232	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_022653	CTCTTT	2	12	2715393	2715404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_022653	CTTATA	2	12	2728495	2728506	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_022653	TTTAAG	2	12	2742199	2742210	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022653	GGAAAA	2	12	2757906	2757917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022653	CTTATC	2	12	2809759	2809770	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_022653	CTAAAA	2	12	2849770	2849781	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_022653	TTAAGA	2	12	2931945	2931956	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022653	CTTCAT	2	12	2962277	2962288	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_022653	CCCGAA	2	12	2979801	2979812	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
105	NC_022653	ATTATC	2	12	3029936	3029947	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_022653	CCGCGG	2	12	3037442	3037453	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_022653	ATTTTA	2	12	3040339	3040350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022653	CTGCTC	2	12	3072382	3072393	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
109	NC_022653	TAAATG	2	12	3115797	3115808	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022653	TAATGA	2	12	3153731	3153742	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022653	GAAAAA	2	12	3171077	3171088	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022653	AATAAC	2	12	3251418	3251429	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_022653	TTTCAT	2	12	3340648	3340659	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_022653	TCTTAT	2	12	3367003	3367014	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_022653	CAATCA	2	12	3403388	3403399	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_022653	GATGAA	2	12	3436779	3436790	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022653	CTACCA	2	12	3455565	3455576	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_022653	GTTTAA	2	12	3492809	3492820	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022653	AAAATA	2	12	3493609	3493620	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022653	CAAAAA	2	12	3565902	3565913	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_022653	ACATAT	2	12	3565952	3565963	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_022653	ATCTCC	2	12	3586111	3586122	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_022653	CAAAAA	2	12	3586242	3586253	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_022653	AATATA	2	12	3658268	3658279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022653	CTCTAT	2	12	3824443	3824454	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_022653	ATCAAG	2	12	3841183	3841194	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_022653	CGGGGC	2	12	3866145	3866156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_022653	AAACAA	2	12	3875219	3875230	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_022653	AAACAG	2	12	3894898	3894909	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_022653	GCTCTT	2	12	3899933	3899944	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_022653	GAAAAA	2	12	3914346	3914357	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.