MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus amyloliquefaciens CC178

Total Repeats: 3083

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022653	ATATT	2	10	144	153	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022653	ATCGG	2	10	775	784	20 %	20 %	40 %	20 %	556555760
3	NC_022653	ATTAT	2	10	1910	1919	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022653	AATTT	2	10	2271	2280	40 %	60 %	0 %	0 %	556555761
5	NC_022653	AGTGA	2	10	4542	4551	40 %	20 %	40 %	0 %	556555763
6	NC_022653	GTTGC	2	10	5642	5651	0 %	40 %	40 %	20 %	556555765
7	NC_022653	GGGAC	2	10	6184	6193	20 %	0 %	60 %	20 %	556555765
8	NC_022653	TTCGG	2	10	7330	7339	0 %	40 %	40 %	20 %	556555766
9	NC_022653	ACGAT	2	10	8663	8672	40 %	20 %	20 %	20 %	556555766
10	NC_022653	TCGTG	2	10	10838	10847	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_022653	GGACG	2	10	11713	11722	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
12	NC_022653	CTTCA	2	10	15394	15403	20 %	40 %	0 %	40 %	556555767
13	NC_022653	AATAA	2	10	15711	15720	80 %	20 %	0 %	0 %	556555767
14	NC_022653	CCTTT	2	10	15765	15774	0 %	60 %	0 %	40 %	556555767
15	NC_022653	CTGAA	2	10	16685	16694	40 %	20 %	20 %	20 %	556555768
16	NC_022653	AAGAG	2	10	17232	17241	60 %	0 %	40 %	0 %	556555768
17	NC_022653	AGCAC	2	10	18297	18306	40 %	0 %	20 %	40 %	556555769
18	NC_022653	CGGAA	2	10	18309	18318	40 %	0 %	40 %	20 %	556555769
19	NC_022653	AGAGA	2	10	20944	20953	60 %	0 %	40 %	0 %	556555772
20	NC_022653	CCAAG	2	10	21858	21867	40 %	0 %	20 %	40 %	556555772
21	NC_022653	ATCTG	2	10	22424	22433	20 %	40 %	20 %	20 %	556555773
22	NC_022653	CCCGC	2	10	22889	22898	0 %	0 %	20 %	80 %	556555773
23	NC_022653	GAAAT	2	10	23412	23421	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022653	ACTCC	2	10	24821	24830	20 %	20 %	0 %	60 %	556555776
25	NC_022653	GTTTT	2	10	25785	25794	0 %	80 %	20 %	0 %	556555777
26	NC_022653	ATGAC	2	10	30007	30016	40 %	20 %	20 %	20 %	556555782
27	NC_022653	GAAGC	2	10	30884	30893	40 %	0 %	40 %	20 %	556555784
28	NC_022653	TTGCT	2	10	31026	31035	0 %	60 %	20 %	20 %	556555785
29	NC_022653	TCGTG	2	10	32576	32585	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_022653	GGACG	2	10	33451	33460	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_022653	ACAAA	2	10	36549	36558	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_022653	AAGAA	2	10	37206	37215	80 %	0 %	20 %	0 %	556555787
33	NC_022653	TGCTC	2	10	37443	37452	0 %	40 %	20 %	40 %	556555787
34	NC_022653	AAAGA	2	10	37850	37859	80 %	0 %	20 %	0 %	556555788
35	NC_022653	CTGAT	2	10	37886	37895	20 %	40 %	20 %	20 %	556555788
36	NC_022653	TGTGC	2	10	40537	40546	0 %	40 %	40 %	20 %	556555790
37	NC_022653	GAAAA	2	10	41837	41846	80 %	0 %	20 %	0 %	556555793
38	NC_022653	GCAGA	2	10	43821	43830	40 %	0 %	40 %	20 %	556555795
39	NC_022653	GCGAT	2	10	46825	46834	20 %	20 %	40 %	20 %	556555800
40	NC_022653	TGACA	2	10	49001	49010	40 %	20 %	20 %	20 %	556555801
41	NC_022653	AGATC	2	10	50638	50647	40 %	20 %	20 %	20 %	556555803
42	NC_022653	TCAAA	2	10	51654	51663	60 %	20 %	0 %	20 %	556555804
43	NC_022653	TTTTG	2	10	54142	54151	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022653	TGAAG	2	10	58468	58477	40 %	20 %	40 %	0 %	556555813
45	NC_022653	ATTGA	2	10	60674	60683	40 %	40 %	20 %	0 %	556555816
46	NC_022653	AACAC	2	10	61408	61417	60 %	0 %	0 %	40 %	556555817
47	NC_022653	TTTGC	2	10	63440	63449	0 %	60 %	20 %	20 %	556555818
48	NC_022653	AACGG	2	10	63669	63678	40 %	0 %	40 %	20 %	556555818
49	NC_022653	TAAAG	2	10	65107	65116	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022653	CGGCG	2	10	66192	66201	0 %	0 %	60 %	40 %	556555820
51	NC_022653	ATGAT	2	10	66317	66326	40 %	40 %	20 %	0 %	556555820
52	NC_022653	GACGG	2	10	66655	66664	20 %	0 %	60 %	20 %	556555820
53	NC_022653	TGCCG	2	10	68527	68536	0 %	20 %	40 %	40 %	556555821
54	NC_022653	GGAGA	2	10	68905	68914	40 %	0 %	60 %	0 %	556555821
55	NC_022653	GAAAG	2	10	71452	71461	60 %	0 %	40 %	0 %	556555827
56	NC_022653	GGCCT	2	10	72072	72081	0 %	20 %	40 %	40 %	556555828
57	NC_022653	TTTCA	2	10	72214	72223	20 %	60 %	0 %	20 %	556555828
58	NC_022653	GTTCG	2	10	73340	73349	0 %	40 %	40 %	20 %	556555828
59	NC_022653	CGGGC	2	10	74635	74644	0 %	0 %	60 %	40 %	556555829
60	NC_022653	TTATT	2	10	78038	78047	20 %	80 %	0 %	0 %	556555833
61	NC_022653	TGAAG	2	10	82544	82553	40 %	20 %	40 %	0 %	556555836
62	NC_022653	CGGAG	2	10	83072	83081	20 %	0 %	60 %	20 %	556555837
63	NC_022653	GATCA	2	10	83457	83466	40 %	20 %	20 %	20 %	556555837
64	NC_022653	TAAAA	2	10	83796	83805	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022653	CGGAA	2	10	84097	84106	40 %	0 %	40 %	20 %	556555839
66	NC_022653	AGCGG	2	10	85549	85558	20 %	0 %	60 %	20 %	556555840
67	NC_022653	GGCCG	2	10	89284	89293	0 %	0 %	60 %	40 %	556555846
68	NC_022653	TCGTG	2	10	92604	92613	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_022653	GGACG	2	10	93305	93314	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
70	NC_022653	TCGTG	2	10	98431	98440	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_022653	GGACG	2	10	99132	99141	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
72	NC_022653	AGATC	2	10	103374	103383	40 %	20 %	20 %	20 %	556555850
73	NC_022653	GGGAC	2	10	103950	103959	20 %	0 %	60 %	20 %	556555851
74	NC_022653	TCAAA	2	10	104106	104115	60 %	20 %	0 %	20 %	556555851
75	NC_022653	GAACA	2	10	104835	104844	60 %	0 %	20 %	20 %	556555852
76	NC_022653	CGGAA	2	10	109079	109088	40 %	0 %	40 %	20 %	556555854
77	NC_022653	CCGTA	2	10	109952	109961	20 %	20 %	20 %	40 %	556555855
78	NC_022653	GAAAA	2	10	114096	114105	80 %	0 %	20 %	0 %	556555860
79	NC_022653	GTTTG	2	10	115522	115531	0 %	60 %	40 %	0 %	556555861
80	NC_022653	TGAAT	2	10	119207	119216	40 %	40 %	20 %	0 %	556555868
81	NC_022653	TTACG	2	10	120884	120893	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_022653	TAAAA	2	10	121524	121533	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022653	TTGAA	2	10	121604	121613	40 %	40 %	20 %	0 %	556555872
84	NC_022653	GACCG	2	10	122258	122267	20 %	0 %	40 %	40 %	556555873
85	NC_022653	GTGAA	2	10	126585	126594	40 %	20 %	40 %	0 %	556555875
86	NC_022653	ACCGG	2	10	127424	127433	20 %	0 %	40 %	40 %	556555875
87	NC_022653	GAAGA	2	10	128267	128276	60 %	0 %	40 %	0 %	556555875
88	NC_022653	CAAAG	2	10	128537	128546	60 %	0 %	20 %	20 %	556555875
89	NC_022653	GTGCT	2	10	129081	129090	0 %	40 %	40 %	20 %	556555875
90	NC_022653	CTGAC	2	10	129621	129630	20 %	20 %	20 %	40 %	556555875
91	NC_022653	GTCCT	2	10	129858	129867	0 %	40 %	20 %	40 %	556555875
92	NC_022653	CAATT	2	10	132101	132110	40 %	40 %	0 %	20 %	556555878
93	NC_022653	CTGAA	2	10	132332	132341	40 %	20 %	20 %	20 %	556555878
94	NC_022653	GAGGG	2	10	135702	135711	20 %	0 %	80 %	0 %	556555880
95	NC_022653	CAAAA	2	10	136330	136339	80 %	0 %	0 %	20 %	556555881
96	NC_022653	AATCA	2	10	137657	137666	60 %	20 %	0 %	20 %	556555883
97	NC_022653	AAACG	2	10	139229	139238	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_022653	TGGTA	2	10	140019	140028	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022653	AAAGT	2	10	140934	140943	60 %	20 %	20 %	0 %	556555887
100	NC_022653	CAAAC	2	10	144930	144939	60 %	0 %	0 %	40 %	556555895
101	NC_022653	TAAAT	2	10	147778	147787	60 %	40 %	0 %	0 %	556555899
102	NC_022653	AAACA	2	10	149348	149357	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_022653	TTATC	2	10	150430	150439	20 %	60 %	0 %	20 %	556555903
104	NC_022653	TTAAA	2	10	152109	152118	60 %	40 %	0 %	0 %	556555904
105	NC_022653	CGTTT	2	10	153453	153462	0 %	60 %	20 %	20 %	556555906
106	NC_022653	CGAAG	2	10	154580	154589	40 %	0 %	40 %	20 %	556555907
107	NC_022653	GCACC	2	10	154609	154618	20 %	0 %	20 %	60 %	556555907
108	NC_022653	TTGTG	2	10	154754	154763	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022653	TGCTT	2	10	155533	155542	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_022653	ATTCC	2	10	156356	156365	20 %	40 %	0 %	40 %	556555909
111	NC_022653	CGGCC	2	10	159564	159573	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
112	NC_022653	AAACA	2	10	160094	160103	80 %	0 %	0 %	20 %	556555914
113	NC_022653	TTTTC	2	10	160266	160275	0 %	80 %	0 %	20 %	556555915
114	NC_022653	TCGTG	2	10	163020	163029	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_022653	GGACG	2	10	163721	163730	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
116	NC_022653	GTTCA	2	10	167016	167025	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_022653	TACAT	2	10	167284	167293	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_022653	TCGTG	2	10	168958	168967	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_022653	GGACG	2	10	169659	169668	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
120	NC_022653	ATTAT	2	10	175216	175225	40 %	60 %	0 %	0 %	556555918
121	NC_022653	TTGAA	2	10	175866	175875	40 %	40 %	20 %	0 %	556555919
122	NC_022653	CGGAC	2	10	176630	176639	20 %	0 %	40 %	40 %	556555920
123	NC_022653	AATGG	2	10	176834	176843	40 %	20 %	40 %	0 %	556555920
124	NC_022653	TTTTC	2	10	177501	177510	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_022653	TTCCT	2	10	177568	177577	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
126	NC_022653	TGGCT	2	10	179977	179986	0 %	40 %	40 %	20 %	556555922
127	NC_022653	GCGGA	2	10	180472	180481	20 %	0 %	60 %	20 %	556555923
128	NC_022653	CTTTT	2	10	182003	182012	0 %	80 %	0 %	20 %	556555925
129	NC_022653	TCCGA	2	10	182164	182173	20 %	20 %	20 %	40 %	556555925
130	NC_022653	TCCTT	2	10	183863	183872	0 %	60 %	0 %	40 %	556555926
131	NC_022653	TTTTG	2	10	187649	187658	0 %	80 %	20 %	0 %	556555929
132	NC_022653	CTGAA	2	10	188387	188396	40 %	20 %	20 %	20 %	556555929
133	NC_022653	ATCAG	2	10	190853	190862	40 %	20 %	20 %	20 %	556555931
134	NC_022653	GATGA	2	10	192807	192816	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022653	TAAAA	2	10	193122	193131	80 %	20 %	0 %	0 %	556555933
136	NC_022653	CCGTT	2	10	193580	193589	0 %	40 %	20 %	40 %	556555934
137	NC_022653	AAGAT	2	10	194680	194689	60 %	20 %	20 %	0 %	556555935
138	NC_022653	CTGAG	2	10	196214	196223	20 %	20 %	40 %	20 %	556555937
139	NC_022653	AGTGA	2	10	196597	196606	40 %	20 %	40 %	0 %	556555937
140	NC_022653	CATTG	2	10	196819	196828	20 %	40 %	20 %	20 %	556555938
141	NC_022653	GGAAG	2	10	197508	197517	40 %	0 %	60 %	0 %	556555938
142	NC_022653	ATGAA	2	10	199328	199337	60 %	20 %	20 %	0 %	556555939
143	NC_022653	ACAAG	2	10	199608	199617	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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146	NC_022653	TTTTC	2	10	202225	202234	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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152	NC_022653	GGATC	2	10	211713	211722	20 %	20 %	40 %	20 %	556555952
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162	NC_022653	AAATT	2	10	227551	227560	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_022653	TCCTT	2	10	230371	230380	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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181	NC_022653	AATAA	2	10	246506	246515	80 %	20 %	0 %	0 %	556555992
182	NC_022653	GAATA	2	10	247096	247105	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_022653	CGTTT	2	10	255608	255617	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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266	NC_022653	ACCGG	2	10	358016	358025	20 %	0 %	40 %	40 %	556556086
267	NC_022653	GCAAG	2	10	358874	358883	40 %	0 %	40 %	20 %	556556086
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387	NC_022653	GATTC	2	10	516333	516342	20 %	40 %	20 %	20 %	556556259
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395	NC_022653	ACATG	2	10	524199	524208	40 %	20 %	20 %	20 %	556556270
396	NC_022653	AAATC	2	10	525865	525874	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
397	NC_022653	TTTTA	2	10	528090	528099	20 %	80 %	0 %	0 %	556556275
398	NC_022653	AAGAT	2	10	531415	531424	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
399	NC_022653	TAACG	2	10	533429	533438	40 %	20 %	20 %	20 %	556556281
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