MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens CC178

Total Repeats: 430

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022653	ATATT	2	10	144	153	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022653	ATTAT	2	10	1910	1919	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022653	TCGTG	2	10	10838	10847	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_022653	GGACG	2	10	11713	11722	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_022653	GAAAT	2	10	23412	23421	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022653	TCGTG	2	10	32576	32585	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_022653	GGACG	2	10	33451	33460	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_022653	ACAAA	2	10	36549	36558	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_022653	TTTTG	2	10	54142	54151	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022653	TAAAG	2	10	65107	65116	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022653	TAAAA	2	10	83796	83805	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022653	TCGTG	2	10	92604	92613	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_022653	GGACG	2	10	93305	93314	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_022653	TCGTG	2	10	98431	98440	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_022653	GGACG	2	10	99132	99141	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_022653	TTACG	2	10	120884	120893	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_022653	TAAAA	2	10	121524	121533	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022653	AAACG	2	10	139229	139238	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_022653	TGGTA	2	10	140019	140028	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022653	AAACA	2	10	149348	149357	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_022653	TTGTG	2	10	154754	154763	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022653	TGCTT	2	10	155533	155542	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_022653	CGGCC	2	10	159564	159573	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
24	NC_022653	TCGTG	2	10	163020	163029	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_022653	GGACG	2	10	163721	163730	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
26	NC_022653	GTTCA	2	10	167016	167025	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_022653	TACAT	2	10	167284	167293	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_022653	TCGTG	2	10	168958	168967	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_022653	GGACG	2	10	169659	169668	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
30	NC_022653	TTTTC	2	10	177501	177510	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_022653	TTCCT	2	10	177568	177577	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_022653	GATGA	2	10	192807	192816	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022653	ACAAG	2	10	199608	199617	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_022653	TATAA	2	10	201997	202006	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022653	TTTTC	2	10	202225	202234	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_022653	GAACA	2	10	210922	210931	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_022653	ACAAA	2	10	226043	226052	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_022653	AAATT	2	10	227551	227560	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022653	TCCTT	2	10	230371	230380	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_022653	TTAAT	2	10	241847	241856	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022653	AATAA	2	10	244309	244318	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022653	TGATA	2	10	244382	244391	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022653	GAATA	2	10	247096	247105	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022653	TAAAA	2	10	253390	253399	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022653	TAATT	2	10	255540	255549	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022653	CGTTT	2	10	255608	255617	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_022653	CTTTT	2	10	263005	263014	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_022653	GAGAA	2	10	267564	267573	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022653	AAATG	2	10	307058	307067	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022653	TTATG	2	10	364749	364758	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022653	GGGAA	2	10	367691	367700	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022653	TATCA	2	10	369775	369784	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_022653	AGGGA	2	10	419961	419970	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022653	AAGAA	2	10	438757	438766	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022653	CTATA	2	10	440046	440055	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_022653	ACGGG	2	10	450214	450223	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
57	NC_022653	TGCTG	2	10	450441	450450	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_022653	TTTTA	2	10	454717	454726	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022653	AAAAT	2	10	456106	456115	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022653	TGTAG	2	10	460198	460207	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022653	AGGAA	2	10	472251	472260	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022653	GCCGA	2	10	477851	477860	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
63	NC_022653	ATAAA	2	10	478755	478764	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022653	CTTGA	2	10	500730	500739	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_022653	TTTTG	2	10	500756	500765	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022653	TGCTT	2	10	501021	501030	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_022653	CATGT	2	10	501289	501298	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_022653	TAGTC	2	10	503693	503702	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_022653	TGAAA	2	10	512949	512958	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022653	TGATA	2	10	517194	517203	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022653	AGATT	2	10	518042	518051	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022653	AACTT	2	10	518669	518678	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_022653	CATGT	2	10	523679	523688	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_022653	AAATC	2	10	525865	525874	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_022653	AAGAT	2	10	531415	531424	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022653	AGAAA	2	10	533784	533793	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022653	TATCT	2	10	541432	541441	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_022653	GAGAG	2	10	551661	551670	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022653	TCGTA	2	10	570199	570208	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_022653	AAAGG	2	10	573412	573421	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022653	TCCGC	2	10	577675	577684	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
82	NC_022653	CCGCT	2	10	582942	582951	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
83	NC_022653	CAAAA	2	10	587463	587472	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_022653	TAAAA	2	10	594140	594149	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022653	ATTCA	2	10	597519	597528	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_022653	TCGTG	2	10	602030	602039	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_022653	GGACG	2	10	602731	602740	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
88	NC_022653	AAACG	2	10	605967	605976	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_022653	AAAAG	2	10	621296	621305	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022653	TACAG	2	10	621693	621702	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_022653	TACTG	2	10	621811	621820	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_022653	GATGA	2	10	636104	636113	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022653	ATTGA	2	10	652419	652428	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022653	GCGGG	2	10	655311	655320	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
95	NC_022653	AGGAA	2	10	677645	677654	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022653	GCAAG	2	10	695093	695102	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_022653	TGAGA	2	10	704029	704038	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022653	CAACC	2	10	708175	708184	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
99	NC_022653	AGCTA	2	10	726185	726194	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_022653	GGCGG	2	10	754021	754030	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
101	NC_022653	GATGC	2	10	754128	754137	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_022653	AATCA	2	10	754383	754392	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_022653	ACAAA	2	10	756199	756208	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_022653	TTCAA	2	10	782731	782740	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_022653	ATCAG	2	10	788079	788088	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_022653	AATTA	2	10	797306	797315	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022653	AGAGC	2	10	805464	805473	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_022653	ATGAA	2	10	811989	811998	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022653	TCCCA	2	10	812777	812786	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
110	NC_022653	ATAAA	2	10	828799	828808	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022653	TTATA	2	10	847125	847134	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022653	TTTTC	2	10	850358	850367	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_022653	AAGGA	2	10	853377	853386	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022653	TCGTG	2	10	872552	872561	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_022653	GGACG	2	10	873311	873320	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
116	NC_022653	TATTT	2	10	877290	877299	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022653	GTTTC	2	10	892788	892797	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_022653	GTGAT	2	10	917142	917151	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022653	CCGCT	2	10	924168	924177	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
120	NC_022653	ATAAA	2	10	935368	935377	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022653	CTTTT	2	10	939539	939548	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_022653	ATGTT	2	10	942641	942650	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022653	AAGTC	2	10	942875	942884	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_022653	ATATT	2	10	944811	944820	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022653	GGAAG	2	10	948743	948752	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022653	ATGAT	2	10	962010	962019	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022653	AAAAG	2	10	962021	962030	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022653	AGTGG	2	10	976297	976306	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022653	TTTTG	2	10	984268	984277	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022653	AAATT	2	10	994152	994161	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022653	ATTAC	2	10	994859	994868	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_022653	TTTTC	2	10	996630	996639	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_022653	AATAA	2	10	996652	996661	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022653	CAAAA	2	10	999865	999874	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_022653	AGAAA	2	10	1019297	1019306	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022653	TGTGA	2	10	1037248	1037257	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022653	GATAG	2	10	1039907	1039916	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022653	TTTAT	2	10	1049528	1049537	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022653	TGGCC	2	10	1073938	1073947	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
140	NC_022653	GTTTC	2	10	1075714	1075723	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_022653	TTTCT	2	10	1076770	1076779	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_022653	AAATA	2	10	1079150	1079159	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022653	GCCCC	2	10	1081847	1081856	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
144	NC_022653	CTTTT	2	10	1088324	1088333	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_022653	CATAC	2	10	1101201	1101210	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
146	NC_022653	GAATA	2	10	1102160	1102169	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022653	TTCCT	2	10	1111414	1111423	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
148	NC_022653	GAAGG	2	10	1125142	1125151	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022653	TGATA	2	10	1129503	1129512	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022653	TCATA	2	10	1131119	1131128	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_022653	TGATA	2	10	1132542	1132551	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022653	TATGA	2	10	1143712	1143721	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_022653	CTCTC	2	10	1174550	1174559	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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169	NC_022653	GAATA	2	10	1273177	1273186	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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426	NC_022653	GAAGT	2	10	3900134	3900143	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
427	NC_022653	TCCTC	2	10	3904432	3904441	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
428	NC_022653	ATGAC	2	10	3906583	3906592	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
429	NC_022653	TAAAA	2	10	3909120	3909129	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
430	NC_022653	GTTTG	2	10	3914218	3914227	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.