MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli JJ1886 plasmid pJJ1886_5

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022651	TGCGA	2	10	1615	1624	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_022651	CAGCA	2	10	4393	4402	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_022651	CGCGG	2	10	12192	12201	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4	NC_022651	ACGGG	2	10	12243	12252	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_022651	GGCAC	2	10	15036	15045	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_022651	GGAAG	2	10	16238	16247	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022651	TTATG	2	10	16318	16327	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022651	CCGCC	2	10	23162	23171	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
9	NC_022651	ATCAC	2	10	25026	25035	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_022651	TGAGT	2	10	31155	31164	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022651	CACCG	2	10	32041	32050	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_022651	TTTAA	2	10	36872	36881	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022651	CGGGG	2	10	37338	37347	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
14	NC_022651	AAAGT	2	10	38982	38991	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022651	AAATC	2	10	51384	51393	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_022651	GAATC	2	10	67083	67092	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_022651	ATCAC	2	10	67130	67139	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_022651	TGTTT	2	10	100254	100263	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022651	TGCGA	2	10	109123	109132	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.