MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli JJ1886 plasmid pJJ1886_5

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022651	TTTC	2	8	4312	4319	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_022651	CTCC	2	8	4366	4373	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_022651	GCTG	2	8	6159	6166	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_022651	CGAA	2	8	6182	6189	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_022651	CTGT	2	8	6716	6723	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_022651	TCGC	2	8	7992	7999	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_022651	GCTG	2	8	11428	11435	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_022651	TTCA	2	8	11841	11848	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_022651	TGGC	2	8	11963	11970	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_022651	CGGG	2	8	12120	12127	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11	NC_022651	ACGG	2	8	15517	15524	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_022651	TTTC	2	8	16310	16317	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_022651	TGCC	2	8	16686	16693	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_022651	ACTG	2	8	16754	16761	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_022651	ATTT	2	8	16986	16993	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022651	AGTA	2	8	17204	17211	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022651	CAGT	2	8	18894	18901	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_022651	GTCT	2	8	19327	19334	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_022651	AGTG	2	8	24417	24424	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022651	AGAA	2	8	24519	24526	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022651	GGCG	2	8	24802	24809	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
22	NC_022651	GCCA	2	8	32224	32231	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_022651	GCTT	2	8	32527	32534	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_022651	TTGA	2	8	32549	32556	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022651	CCTG	2	8	35065	35072	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_022651	GATT	2	8	36852	36859	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022651	TGAT	2	8	37083	37090	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022651	GAGG	2	8	37363	37370	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022651	TCTG	2	8	37484	37491	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_022651	AATG	2	8	37527	37534	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022651	GAGC	2	8	38731	38738	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_022651	AGAA	2	8	38741	38748	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022651	GCCA	2	8	38932	38939	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_022651	TAAT	2	8	40102	40109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022651	ATGA	2	8	40353	40360	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022651	TTCC	2	8	41297	41304	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_022651	GATA	2	8	65417	65424	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022651	TAAT	2	8	66539	66546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022651	ATTT	2	8	67046	67053	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022651	AAAT	2	8	67263	67270	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022651	ACTG	2	8	68029	68036	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_022651	TGAA	2	8	71081	71088	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022651	CTGC	2	8	71941	71948	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_022651	GCCT	2	8	72001	72008	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_022651	GGAA	2	8	82255	82262	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022651	TTAC	2	8	82434	82441	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_022651	CCAT	2	8	82594	82601	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_022651	GTGG	2	8	82802	82809	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022651	TTAA	2	8	83200	83207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022651	GAAT	2	8	89373	89380	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022651	ATCC	2	8	89482	89489	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_022651	ATCA	2	8	93099	93106	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_022651	TTAT	2	8	94224	94231	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022651	AGCC	2	8	94362	94369	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_022651	CATG	2	8	95843	95850	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_022651	TCTG	2	8	95998	96005	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_022651	CGGC	2	8	100232	100239	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_022651	GCTG	2	8	107420	107427	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.