MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli JJ1886 plasmid pJJ1886_5

Total Repeats: 228

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022651	TTAT	2	8	31	38	25 %	75 %	0 %	0 %	556555180
2	NC_022651	TTTC	2	8	223	230	0 %	75 %	0 %	25 %	556555180
3	NC_022651	CGGG	2	8	1066	1073	0 %	0 %	75 %	25 %	556555180
4	NC_022651	TTCT	2	8	2184	2191	0 %	75 %	0 %	25 %	556555202
5	NC_022651	ATTC	2	8	2396	2403	25 %	50 %	0 %	25 %	556555202
6	NC_022651	CCAG	2	8	2583	2590	25 %	0 %	25 %	50 %	556555203
7	NC_022651	GAAT	2	8	2840	2847	50 %	25 %	25 %	0 %	556555203
8	NC_022651	GCGT	2	8	2973	2980	0 %	25 %	50 %	25 %	556555203
9	NC_022651	CAGC	2	8	3026	3033	25 %	0 %	25 %	50 %	556555203
10	NC_022651	AGAA	2	8	3207	3214	75 %	0 %	25 %	0 %	556555203
11	NC_022651	AGGC	2	8	3586	3593	25 %	0 %	50 %	25 %	556555203
12	NC_022651	AGTG	2	8	5445	5452	25 %	25 %	50 %	0 %	556555207
13	NC_022651	CAGC	2	8	5697	5704	25 %	0 %	25 %	50 %	556555207
14	NC_022651	AGGA	2	8	5760	5767	50 %	0 %	50 %	0 %	556555207
15	NC_022651	ATCA	2	8	6876	6883	50 %	25 %	0 %	25 %	556555208
16	NC_022651	GGCA	2	8	7105	7112	25 %	0 %	50 %	25 %	556555208
17	NC_022651	GAAG	2	8	7130	7137	50 %	0 %	50 %	0 %	556555208
18	NC_022651	TCCA	2	8	7220	7227	25 %	25 %	0 %	50 %	556555208
19	NC_022651	TTCC	2	8	7577	7584	0 %	50 %	0 %	50 %	556555208
20	NC_022651	TGGA	2	8	9140	9147	25 %	25 %	50 %	0 %	556555182
21	NC_022651	ACTG	2	8	9657	9664	25 %	25 %	25 %	25 %	556555183
22	NC_022651	GAAT	2	8	9882	9889	50 %	25 %	25 %	0 %	556555183
23	NC_022651	GCTG	2	8	9909	9916	0 %	25 %	50 %	25 %	556555183
24	NC_022651	GCAG	2	8	13004	13011	25 %	0 %	50 %	25 %	556555209
25	NC_022651	GCGG	2	8	13864	13871	0 %	0 %	75 %	25 %	556555212
26	NC_022651	CAGT	2	8	14152	14159	25 %	25 %	25 %	25 %	556555212
27	NC_022651	AGTG	2	8	14501	14508	25 %	25 %	50 %	0 %	556555212
28	NC_022651	GGCA	2	8	15850	15857	25 %	0 %	50 %	25 %	556555214
29	NC_022651	GTCA	2	8	17025	17032	25 %	25 %	25 %	25 %	556555216
30	NC_022651	ATTA	2	8	17171	17178	50 %	50 %	0 %	0 %	556555216
31	NC_022651	CGCT	2	8	17740	17747	0 %	25 %	25 %	50 %	556555217
32	NC_022651	CCCG	2	8	17852	17859	0 %	0 %	25 %	75 %	556555217
33	NC_022651	GCCA	2	8	18612	18619	25 %	0 %	25 %	50 %	556555217
34	NC_022651	GTCG	2	8	20349	20356	0 %	25 %	50 %	25 %	556555184
35	NC_022651	CAGA	2	8	20469	20476	50 %	0 %	25 %	25 %	556555184
36	NC_022651	TAAG	2	8	21126	21133	50 %	25 %	25 %	0 %	556555218
37	NC_022651	AAGC	2	8	21228	21235	50 %	0 %	25 %	25 %	556555219
38	NC_022651	GAAC	2	8	22201	22208	50 %	0 %	25 %	25 %	556555219
39	NC_022651	GAAG	2	8	22666	22673	50 %	0 %	50 %	0 %	556555219
40	NC_022651	TCAG	2	8	22767	22774	25 %	25 %	25 %	25 %	556555219
41	NC_022651	CAGA	2	8	23102	23109	50 %	0 %	25 %	25 %	556555219
42	NC_022651	TCAC	2	8	23298	23305	25 %	25 %	0 %	50 %	556555220
43	NC_022651	GGCG	2	8	23690	23697	0 %	0 %	75 %	25 %	556555221
44	NC_022651	GCTG	2	8	23736	23743	0 %	25 %	50 %	25 %	556555221
45	NC_022651	GAGG	2	8	24033	24040	25 %	0 %	75 %	0 %	556555221
46	NC_022651	GCTG	2	8	25244	25251	0 %	25 %	50 %	25 %	556555222
47	NC_022651	GGCA	2	8	26282	26289	25 %	0 %	50 %	25 %	556555223
48	NC_022651	ACAG	2	8	26378	26385	50 %	0 %	25 %	25 %	556555223
49	NC_022651	CTCC	2	8	26524	26531	0 %	25 %	0 %	75 %	556555223
50	NC_022651	CAAT	2	8	26885	26892	50 %	25 %	0 %	25 %	556555223
51	NC_022651	GACT	2	8	27350	27357	25 %	25 %	25 %	25 %	556555223
52	NC_022651	GCAG	2	8	27606	27613	25 %	0 %	50 %	25 %	556555223
53	NC_022651	GCTG	2	8	27938	27945	0 %	25 %	50 %	25 %	556555224
54	NC_022651	CTGC	2	8	28197	28204	0 %	25 %	25 %	50 %	556555224
55	NC_022651	GCCT	2	8	29011	29018	0 %	25 %	25 %	50 %	556555187
56	NC_022651	CAGT	2	8	29403	29410	25 %	25 %	25 %	25 %	556555225
57	NC_022651	CGAC	2	8	30059	30066	25 %	0 %	25 %	50 %	556555225
58	NC_022651	ACGG	2	8	30566	30573	25 %	0 %	50 %	25 %	556555225
59	NC_022651	TCTG	2	8	30736	30743	0 %	50 %	25 %	25 %	556555225
60	NC_022651	GAGC	2	8	30846	30853	25 %	0 %	50 %	25 %	556555225
61	NC_022651	GCTG	2	8	31351	31358	0 %	25 %	50 %	25 %	556555226
62	NC_022651	TCTT	2	8	32952	32959	0 %	75 %	0 %	25 %	556555227
63	NC_022651	TTTA	2	8	33015	33022	25 %	75 %	0 %	0 %	556555227
64	NC_022651	TCGC	2	8	33666	33673	0 %	25 %	25 %	50 %	556555228
65	NC_022651	CCGT	2	8	33841	33848	0 %	25 %	25 %	50 %	556555228
66	NC_022651	GGCG	2	8	34524	34531	0 %	0 %	75 %	25 %	556555229
67	NC_022651	CAGC	2	8	34841	34848	25 %	0 %	25 %	50 %	556555229
68	NC_022651	ACTT	2	8	36359	36366	25 %	50 %	0 %	25 %	556555230
69	NC_022651	TGAA	2	8	36458	36465	50 %	25 %	25 %	0 %	556555230
70	NC_022651	TGGA	2	8	36580	36587	25 %	25 %	50 %	0 %	556555230
71	NC_022651	GGCT	2	8	36630	36637	0 %	25 %	50 %	25 %	556555230
72	NC_022651	TGTT	2	8	38167	38174	0 %	75 %	25 %	0 %	556555231
73	NC_022651	GTCG	2	8	38262	38269	0 %	25 %	50 %	25 %	556555231
74	NC_022651	GGTA	2	8	38306	38313	25 %	25 %	50 %	0 %	556555231
75	NC_022651	AGTC	2	8	39176	39183	25 %	25 %	25 %	25 %	556555232
76	NC_022651	TCTG	2	8	39241	39248	0 %	50 %	25 %	25 %	556555232
77	NC_022651	GCCT	2	8	39603	39610	0 %	25 %	25 %	50 %	556555233
78	NC_022651	TGGC	2	8	39660	39667	0 %	25 %	50 %	25 %	556555233
79	NC_022651	GAAC	2	8	39698	39705	50 %	0 %	25 %	25 %	556555233
80	NC_022651	TTTA	2	8	40376	40383	25 %	75 %	0 %	0 %	556555234
81	NC_022651	CATT	2	8	40538	40545	25 %	50 %	0 %	25 %	556555234
82	NC_022651	ATAA	2	8	40807	40814	75 %	25 %	0 %	0 %	556555234
83	NC_022651	GGCA	2	8	41558	41565	25 %	0 %	50 %	25 %	556555236
84	NC_022651	ATTC	2	8	42512	42519	25 %	50 %	0 %	25 %	556555237
85	NC_022651	GCTG	2	8	42560	42567	0 %	25 %	50 %	25 %	556555237
86	NC_022651	CCAC	2	8	43345	43352	25 %	0 %	0 %	75 %	556555238
87	NC_022651	CAGC	2	8	43981	43988	25 %	0 %	25 %	50 %	556555239
88	NC_022651	CAGC	2	8	44287	44294	25 %	0 %	25 %	50 %	556555239
89	NC_022651	CCTG	2	8	44529	44536	0 %	25 %	25 %	50 %	556555239
90	NC_022651	CAGG	2	8	46765	46772	25 %	0 %	50 %	25 %	556555239
91	NC_022651	GCCC	2	8	46785	46792	0 %	0 %	25 %	75 %	556555239
92	NC_022651	TCGC	2	8	46892	46899	0 %	25 %	25 %	50 %	556555239
93	NC_022651	CCGG	2	8	46921	46928	0 %	0 %	50 %	50 %	556555239
94	NC_022651	CGGT	2	8	47087	47094	0 %	25 %	50 %	25 %	556555239
95	NC_022651	CCAG	2	8	47125	47132	25 %	0 %	25 %	50 %	556555239
96	NC_022651	GCGA	2	8	47626	47633	25 %	0 %	50 %	25 %	556555239
97	NC_022651	GGCG	2	8	48173	48180	0 %	0 %	75 %	25 %	556555240
98	NC_022651	CAGC	2	8	48490	48497	25 %	0 %	25 %	50 %	556555240
99	NC_022651	CGCC	2	8	49333	49340	0 %	0 %	25 %	75 %	556555241
100	NC_022651	CCCT	2	8	49480	49487	0 %	25 %	0 %	75 %	556555242
101	NC_022651	ACAT	2	8	49621	49628	50 %	25 %	0 %	25 %	556555242
102	NC_022651	TTCA	2	8	49879	49886	25 %	50 %	0 %	25 %	556555243
103	NC_022651	ATCC	2	8	49919	49926	25 %	25 %	0 %	50 %	556555243
104	NC_022651	ATCC	2	8	50144	50151	25 %	25 %	0 %	50 %	556555244
105	NC_022651	CCTG	2	8	50452	50459	0 %	25 %	25 %	50 %	556555244
106	NC_022651	ATTT	2	8	52047	52054	25 %	75 %	0 %	0 %	556555247
107	NC_022651	CCTG	2	8	52426	52433	0 %	25 %	25 %	50 %	556555249
108	NC_022651	CAGA	2	8	52698	52705	50 %	0 %	25 %	25 %	556555249
109	NC_022651	GTTT	2	8	52751	52758	0 %	75 %	25 %	0 %	556555249
110	NC_022651	TGAC	2	8	53247	53254	25 %	25 %	25 %	25 %	556555249
111	NC_022651	CAGT	2	8	53474	53481	25 %	25 %	25 %	25 %	556555249
112	NC_022651	TGAA	2	8	53893	53900	50 %	25 %	25 %	0 %	556555249
113	NC_022651	GCCT	2	8	54306	54313	0 %	25 %	25 %	50 %	556555250
114	NC_022651	GTCC	2	8	55680	55687	0 %	25 %	25 %	50 %	556555252
115	NC_022651	CGTC	2	8	55916	55923	0 %	25 %	25 %	50 %	556555252
116	NC_022651	CTGA	2	8	56037	56044	25 %	25 %	25 %	25 %	556555252
117	NC_022651	GACG	2	8	56555	56562	25 %	0 %	50 %	25 %	556555253
118	NC_022651	GGCT	2	8	56949	56956	0 %	25 %	50 %	25 %	556555254
119	NC_022651	GGAA	2	8	57437	57444	50 %	0 %	50 %	0 %	556555255
120	NC_022651	GACG	2	8	57841	57848	25 %	0 %	50 %	25 %	556555255
121	NC_022651	AGCC	2	8	58077	58084	25 %	0 %	25 %	50 %	556555255
122	NC_022651	GGTG	2	8	58455	58462	0 %	25 %	75 %	0 %	556555255
123	NC_022651	GCAG	2	8	58595	58602	25 %	0 %	50 %	25 %	556555255
124	NC_022651	ACGG	2	8	58813	58820	25 %	0 %	50 %	25 %	556555255
125	NC_022651	CTGT	2	8	59237	59244	0 %	50 %	25 %	25 %	556555255
126	NC_022651	ACCA	2	8	59514	59521	50 %	0 %	0 %	50 %	556555255
127	NC_022651	TCAT	2	8	59659	59666	25 %	50 %	0 %	25 %	556555255
128	NC_022651	GACT	2	8	59987	59994	25 %	25 %	25 %	25 %	556555256
129	NC_022651	ATTT	2	8	60132	60139	25 %	75 %	0 %	0 %	556555190
130	NC_022651	TTAA	2	8	60350	60357	50 %	50 %	0 %	0 %	556555257
131	NC_022651	GCGG	2	8	60481	60488	0 %	0 %	75 %	25 %	556555257
132	NC_022651	CGGA	2	8	60613	60620	25 %	0 %	50 %	25 %	556555257
133	NC_022651	AATA	2	8	60842	60849	75 %	25 %	0 %	0 %	556555257
134	NC_022651	ATTT	2	8	61072	61079	25 %	75 %	0 %	0 %	556555258
135	NC_022651	GCAT	2	8	61350	61357	25 %	25 %	25 %	25 %	556555259
136	NC_022651	TGTT	2	8	61445	61452	0 %	75 %	25 %	0 %	556555260
137	NC_022651	ACAT	2	8	61612	61619	50 %	25 %	0 %	25 %	556555260
138	NC_022651	AAAC	2	8	61856	61863	75 %	0 %	0 %	25 %	556555260
139	NC_022651	CCCT	2	8	62005	62012	0 %	25 %	0 %	75 %	556555261
140	NC_022651	GCGT	2	8	62154	62161	0 %	25 %	50 %	25 %	556555261
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.