MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli JJ1886 plasmid pJJ1886_5

Total Repeats: 286

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022651	CGG	2	6	2512	2517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_022651	AGC	2	6	4219	4224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_022651	GTT	2	6	4267	4272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022651	TGT	2	6	4437	4442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022651	ATG	2	6	4492	4497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022651	ATT	2	6	6227	6232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022651	AGT	2	6	6264	6269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022651	ATG	2	6	6278	6283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022651	AAC	2	6	6388	6393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_022651	ATG	2	6	6411	6416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022651	AGT	2	6	6437	6442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022651	CGC	2	6	6446	6451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_022651	ATT	2	6	6586	6591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022651	TCT	2	6	6610	6615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_022651	AGA	2	6	6760	6765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022651	GGT	2	6	7642	7647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022651	TCA	2	6	7835	7840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_022651	TGA	2	6	7842	7847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022651	TTA	2	6	7865	7870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022651	TCT	2	6	7930	7935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_022651	TTC	2	6	7969	7974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_022651	GCG	2	6	8019	8024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_022651	ATA	2	6	8035	8040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022651	CTT	2	6	8060	8065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_022651	AAC	2	6	8096	8101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_022651	TGT	2	6	8131	8136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022651	TAA	2	6	8161	8166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022651	TCG	2	6	10450	10455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_022651	TCG	2	6	10493	10498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_022651	ATT	2	6	10504	10509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022651	TCG	2	6	10536	10541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_022651	ATT	2	6	10547	10552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022651	TCG	2	6	10579	10584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_022651	ATT	2	6	10590	10595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022651	TCG	2	6	10622	10627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_022651	ATT	2	6	10633	10638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022651	TCG	2	6	10665	10670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_022651	ATT	2	6	10676	10681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022651	TCG	2	6	10708	10713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_022651	ATT	2	6	10719	10724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022651	GTC	2	6	10861	10866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_022651	CTG	2	6	10909	10914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_022651	TGC	2	6	10920	10925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_022651	CCT	2	6	11045	11050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_022651	TCG	2	6	11065	11070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_022651	TCC	3	9	11072	11080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_022651	GAG	2	6	11168	11173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022651	CGC	2	6	11280	11285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_022651	GTG	2	6	11392	11397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022651	CTG	2	6	11457	11462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_022651	TGC	2	6	11482	11487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_022651	GTG	2	6	11627	11632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022651	CTG	2	6	11682	11687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_022651	GGT	2	6	11733	11738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022651	GTG	2	6	11867	11872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022651	GTT	2	6	11889	11894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022651	GCC	2	6	11905	11910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_022651	TTG	2	6	11992	11997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022651	GAT	3	9	12035	12043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022651	CTC	2	6	12167	12172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_022651	CGG	2	6	12235	12240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_022651	TGA	2	6	12312	12317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022651	GAC	2	6	12362	12367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_022651	CAC	2	6	12441	12446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_022651	GTT	2	6	12485	12490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022651	CGC	2	6	14736	14741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_022651	CGT	2	6	14805	14810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_022651	CGC	2	6	14870	14875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_022651	CCT	2	6	14891	14896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_022651	AAC	2	6	15069	15074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_022651	GGA	2	6	15075	15080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022651	GGC	2	6	15525	15530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_022651	GCC	2	6	15534	15539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_022651	GCC	2	6	16191	16196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_022651	TGT	3	9	16341	16349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022651	CTG	2	6	16358	16363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_022651	ACT	2	6	16375	16380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_022651	GTT	2	6	16386	16391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022651	GGC	2	6	16428	16433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_022651	GTC	2	6	16439	16444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_022651	CCG	2	6	16482	16487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_022651	GCC	2	6	16615	16620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_022651	CGT	2	6	16660	16665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_022651	GCG	2	6	16667	16672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_022651	GCG	2	6	16867	16872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_022651	CAG	3	9	16912	16920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_022651	CCG	2	6	17243	17248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_022651	GTG	2	6	17347	17352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022651	TGA	2	6	17427	17432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022651	GCC	2	6	17438	17443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_022651	CAA	2	6	17457	17462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_022651	CGC	2	6	18942	18947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_022651	CCG	2	6	19246	19251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_022651	CAG	2	6	19348	19353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_022651	CGA	2	6	19424	19429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_022651	ATT	2	6	19432	19437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022651	TGA	2	6	19450	19455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022651	GGA	2	6	19469	19474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022651	TGA	2	6	19615	19620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022651	TGT	3	9	19621	19629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022651	CTT	2	6	19655	19660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_022651	ACT	2	6	19682	19687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_022651	GGC	2	6	19735	19740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_022651	GTC	2	6	19746	19751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_022651	GCT	2	6	19772	19777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_022651	CCG	2	6	19795	19800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_022651	CGC	2	6	19879	19884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_022651	CGT	2	6	19974	19979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_022651	GCG	2	6	19981	19986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_022651	GTT	2	6	19998	20003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022651	GCG	2	6	20180	20185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_022651	GAT	2	6	20276	20281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022651	GAT	2	6	21184	21189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022651	GCA	2	6	23184	23189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_022651	CAA	2	6	24360	24365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_022651	ATT	2	6	24402	24407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022651	ATG	2	6	24450	24455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022651	GGT	2	6	24493	24498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022651	TTG	2	6	24499	24504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022651	GTA	2	6	24536	24541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022651	ACC	2	6	24557	24562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_022651	GAA	2	6	24624	24629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022651	ACT	2	6	24843	24848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_022651	GCT	2	6	24868	24873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_022651	TGT	2	6	24905	24910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022651	AAC	2	6	24920	24925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_022651	GCG	2	6	24977	24982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_022651	ATT	2	6	25046	25051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022651	TTC	2	6	25058	25063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_022651	GGT	2	6	25099	25104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022651	ATC	2	6	25114	25119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_022651	GAA	2	6	25936	25941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022651	TTA	2	6	28559	28564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022651	TGT	2	6	29289	29294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022651	CCA	2	6	29296	29301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_022651	ACG	2	6	31093	31098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_022651	GGT	2	6	31206	31211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022651	ATC	2	6	31221	31226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_022651	TTC	2	6	32164	32169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_022651	GAT	2	6	32192	32197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022651	GAT	2	6	32272	32277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022651	TCA	2	6	32291	32296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_022651	TAG	2	6	32345	32350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022651	TTC	2	6	32390	32395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_022651	AGC	2	6	32408	32413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_022651	AGT	2	6	32436	32441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_022651	CGC	2	6	37459	37464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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163	NC_022651	CGG	2	6	37783	37788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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172	NC_022651	GAA	2	6	41366	41371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
173	NC_022651	CCT	2	6	41398	41403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
174	NC_022651	AGG	2	6	41413	41418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_022651	TCC	2	6	60223	60228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
184	NC_022651	CCG	2	6	60311	60316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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199	NC_022651	TCA	2	6	69172	69177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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278	NC_022651	ACT	2	6	97576	97581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_022651	CAA	2	6	101244	101249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_022651	GGC	2	6	105119	105124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_022651	TCC	2	6	105782	105787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
282	NC_022651	GGC	2	6	105794	105799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_022651	TAG	2	6	105964	105969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_022651	TCC	2	6	107468	107473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
286	NC_022651	CGG	2	6	110020	110025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.