MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli JJ1886 plasmid pJJ1886_5

Total Repeats: 197

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022651	GT	3	6	834	839	0 %	50 %	50 %	0 %	556555180
2	NC_022651	AG	3	6	1594	1599	50 %	0 %	50 %	0 %	556555180
3	NC_022651	GC	3	6	3032	3037	0 %	0 %	50 %	50 %	556555203
4	NC_022651	CT	3	6	3991	3996	0 %	50 %	0 %	50 %	556555204
5	NC_022651	TG	3	6	4296	4301	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022651	GC	3	6	4680	4685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_022651	AT	3	6	4705	4710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022651	AG	4	8	4999	5006	50 %	0 %	50 %	0 %	556555206
9	NC_022651	CT	3	6	5677	5682	0 %	50 %	0 %	50 %	556555207
10	NC_022651	TA	3	6	6509	6514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022651	AC	3	6	6523	6528	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_022651	TC	3	6	6947	6952	0 %	50 %	0 %	50 %	556555208
13	NC_022651	TC	3	6	7399	7404	0 %	50 %	0 %	50 %	556555208
14	NC_022651	GT	3	6	7890	7895	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022651	GC	3	6	8925	8930	0 %	0 %	50 %	50 %	556555182
16	NC_022651	GC	3	6	9469	9474	0 %	0 %	50 %	50 %	556555183
17	NC_022651	TC	3	6	10422	10427	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_022651	GT	3	6	11027	11032	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022651	AC	3	6	11436	11441	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_022651	TG	3	6	11641	11646	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022651	CA	3	6	12970	12975	50 %	0 %	0 %	50 %	556555209
22	NC_022651	TG	3	6	13233	13238	0 %	50 %	50 %	0 %	556555210
23	NC_022651	GC	3	6	13566	13571	0 %	0 %	50 %	50 %	556555211
24	NC_022651	CA	3	6	13826	13831	50 %	0 %	0 %	50 %	556555211
25	NC_022651	TC	3	6	15135	15140	0 %	50 %	0 %	50 %	556555213
26	NC_022651	GC	3	6	15793	15798	0 %	0 %	50 %	50 %	556555214
27	NC_022651	CG	3	6	16205	16210	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_022651	CA	3	6	16699	16704	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_022651	CG	3	6	17541	17546	0 %	0 %	50 %	50 %	556555217
30	NC_022651	GA	3	6	17716	17721	50 %	0 %	50 %	0 %	556555217
31	NC_022651	GC	3	6	18924	18929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_022651	TG	3	6	19115	19120	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022651	CG	3	6	19394	19399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_022651	CG	3	6	19507	19512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_022651	GC	3	6	20539	20544	0 %	0 %	50 %	50 %	556555184
36	NC_022651	GA	3	6	20888	20893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022651	AG	3	6	21132	21137	50 %	0 %	50 %	0 %	556555218
38	NC_022651	CG	3	6	21146	21151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_022651	CA	3	6	21660	21665	50 %	0 %	0 %	50 %	556555219
40	NC_022651	CG	3	6	21808	21813	0 %	0 %	50 %	50 %	556555219
41	NC_022651	TG	3	6	23085	23090	0 %	50 %	50 %	0 %	556555219
42	NC_022651	TC	3	6	23451	23456	0 %	50 %	0 %	50 %	556555220
43	NC_022651	AG	3	6	24283	24288	50 %	0 %	50 %	0 %	556555221
44	NC_022651	TG	3	6	24511	24516	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022651	GT	4	8	24663	24670	0 %	50 %	50 %	0 %	556555185
46	NC_022651	GT	3	6	24676	24681	0 %	50 %	50 %	0 %	556555185
47	NC_022651	CG	3	6	24968	24973	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_022651	TC	3	6	25457	25462	0 %	50 %	0 %	50 %	556555222
49	NC_022651	CG	3	6	25575	25580	0 %	0 %	50 %	50 %	556555222
50	NC_022651	TA	3	6	27840	27845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022651	TG	3	6	28057	28062	0 %	50 %	50 %	0 %	556555224
52	NC_022651	GT	3	6	28586	28591	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022651	TC	3	6	31005	31010	0 %	50 %	0 %	50 %	556555225
54	NC_022651	TC	3	6	31564	31569	0 %	50 %	0 %	50 %	556555226
55	NC_022651	CG	3	6	31682	31687	0 %	0 %	50 %	50 %	556555226
56	NC_022651	GT	3	6	32597	32602	0 %	50 %	50 %	0 %	556555227
57	NC_022651	GC	3	6	34511	34516	0 %	0 %	50 %	50 %	556555229
58	NC_022651	GA	3	6	34630	34635	50 %	0 %	50 %	0 %	556555229
59	NC_022651	AT	3	6	36840	36845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022651	GA	3	6	37145	37150	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022651	TG	3	6	37424	37429	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022651	CG	3	6	38197	38202	0 %	0 %	50 %	50 %	556555231
63	NC_022651	CT	4	8	39066	39073	0 %	50 %	0 %	50 %	556555232
64	NC_022651	TG	3	6	39131	39136	0 %	50 %	50 %	0 %	556555232
65	NC_022651	CA	3	6	40784	40789	50 %	0 %	0 %	50 %	556555234
66	NC_022651	AT	3	6	40825	40830	50 %	50 %	0 %	0 %	556555234
67	NC_022651	CA	3	6	40897	40902	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_022651	CA	3	6	41579	41584	50 %	0 %	0 %	50 %	556555236
69	NC_022651	GT	3	6	41708	41713	0 %	50 %	50 %	0 %	556555236
70	NC_022651	CT	3	6	42301	42306	0 %	50 %	0 %	50 %	556555237
71	NC_022651	CT	3	6	42503	42508	0 %	50 %	0 %	50 %	556555237
72	NC_022651	TC	3	6	42521	42526	0 %	50 %	0 %	50 %	556555237
73	NC_022651	AG	3	6	42921	42926	50 %	0 %	50 %	0 %	556555237
74	NC_022651	CT	3	6	44298	44303	0 %	50 %	0 %	50 %	556555239
75	NC_022651	GT	3	6	45043	45048	0 %	50 %	50 %	0 %	556555239
76	NC_022651	GA	3	6	45210	45215	50 %	0 %	50 %	0 %	556555239
77	NC_022651	TG	3	6	46041	46046	0 %	50 %	50 %	0 %	556555239
78	NC_022651	CT	3	6	46162	46167	0 %	50 %	0 %	50 %	556555239
79	NC_022651	TG	3	6	46662	46667	0 %	50 %	50 %	0 %	556555239
80	NC_022651	CT	3	6	47253	47258	0 %	50 %	0 %	50 %	556555239
81	NC_022651	GC	3	6	48160	48165	0 %	0 %	50 %	50 %	556555240
82	NC_022651	GA	3	6	48279	48284	50 %	0 %	50 %	0 %	556555240
83	NC_022651	AT	4	8	49764	49771	50 %	50 %	0 %	0 %	556555242
84	NC_022651	GT	3	6	50206	50211	0 %	50 %	50 %	0 %	556555244
85	NC_022651	GA	3	6	50639	50644	50 %	0 %	50 %	0 %	556555244
86	NC_022651	TG	3	6	50974	50979	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022651	TG	3	6	53197	53202	0 %	50 %	50 %	0 %	556555249
88	NC_022651	TC	3	6	54724	54729	0 %	50 %	0 %	50 %	556555250
89	NC_022651	AC	3	6	54936	54941	50 %	0 %	0 %	50 %	556555251
90	NC_022651	AT	3	6	54990	54995	50 %	50 %	0 %	0 %	556555251
91	NC_022651	AT	3	6	55151	55156	50 %	50 %	0 %	0 %	556555251
92	NC_022651	CT	3	6	57321	57326	0 %	50 %	0 %	50 %	556555255
93	NC_022651	TG	3	6	57640	57645	0 %	50 %	50 %	0 %	556555255
94	NC_022651	GC	3	6	58059	58064	0 %	0 %	50 %	50 %	556555255
95	NC_022651	CA	3	6	58265	58270	50 %	0 %	0 %	50 %	556555255
96	NC_022651	CT	3	6	58528	58533	0 %	50 %	0 %	50 %	556555255
97	NC_022651	AC	3	6	59122	59127	50 %	0 %	0 %	50 %	556555255
98	NC_022651	AG	3	6	59176	59181	50 %	0 %	50 %	0 %	556555255
99	NC_022651	CG	3	6	59558	59563	0 %	0 %	50 %	50 %	556555255
100	NC_022651	CT	3	6	61761	61766	0 %	50 %	0 %	50 %	556555260
101	NC_022651	GC	3	6	62390	62395	0 %	0 %	50 %	50 %	556555261
102	NC_022651	GC	3	6	63453	63458	0 %	0 %	50 %	50 %	556555262
103	NC_022651	AT	3	6	64397	64402	50 %	50 %	0 %	0 %	556555263
104	NC_022651	AG	3	6	64609	64614	50 %	0 %	50 %	0 %	556555263
105	NC_022651	GC	3	6	65732	65737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_022651	CT	3	6	65912	65917	0 %	50 %	0 %	50 %	556555267
107	NC_022651	TA	3	6	66236	66241	50 %	50 %	0 %	0 %	556555267
108	NC_022651	CT	3	6	66243	66248	0 %	50 %	0 %	50 %	556555267
109	NC_022651	CA	3	6	66430	66435	50 %	0 %	0 %	50 %	556555267
110	NC_022651	CA	4	8	67999	68006	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_022651	TA	4	8	68067	68074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022651	GA	3	6	69163	69168	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022651	CT	4	8	69484	69491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_022651	GC	3	6	70430	70435	0 %	0 %	50 %	50 %	556555270
115	NC_022651	GA	3	6	70549	70554	50 %	0 %	50 %	0 %	556555270
116	NC_022651	CG	3	6	71417	71422	0 %	0 %	50 %	50 %	556555271
117	NC_022651	TG	4	8	72065	72072	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022651	CT	3	6	72233	72238	0 %	50 %	0 %	50 %	556555272
119	NC_022651	GC	3	6	72358	72363	0 %	0 %	50 %	50 %	556555272
120	NC_022651	CG	3	6	72432	72437	0 %	0 %	50 %	50 %	556555272
121	NC_022651	GC	3	6	72517	72522	0 %	0 %	50 %	50 %	556555272
122	NC_022651	GC	3	6	73066	73071	0 %	0 %	50 %	50 %	556555272
123	NC_022651	GC	3	6	73268	73273	0 %	0 %	50 %	50 %	556555272
124	NC_022651	GC	3	6	73621	73626	0 %	0 %	50 %	50 %	556555272
125	NC_022651	CG	3	6	74340	74345	0 %	0 %	50 %	50 %	556555273
126	NC_022651	CT	3	6	75639	75644	0 %	50 %	0 %	50 %	556555274
127	NC_022651	AG	3	6	76334	76339	50 %	0 %	50 %	0 %	556555275
128	NC_022651	GC	3	6	76929	76934	0 %	0 %	50 %	50 %	556555275
129	NC_022651	CT	3	6	78255	78260	0 %	50 %	0 %	50 %	556555276
130	NC_022651	GC	3	6	78306	78311	0 %	0 %	50 %	50 %	556555276
131	NC_022651	CG	3	6	78555	78560	0 %	0 %	50 %	50 %	556555276
132	NC_022651	GT	4	8	79055	79062	0 %	50 %	50 %	0 %	556555193
133	NC_022651	GC	3	6	79751	79756	0 %	0 %	50 %	50 %	556555277
134	NC_022651	GA	3	6	79784	79789	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022651	AT	3	6	80053	80058	50 %	50 %	0 %	0 %	556555278
136	NC_022651	GC	4	8	80528	80535	0 %	0 %	50 %	50 %	556555194
137	NC_022651	TA	3	6	80722	80727	50 %	50 %	0 %	0 %	556555194
138	NC_022651	GC	3	6	81257	81262	0 %	0 %	50 %	50 %	556555279
139	NC_022651	GA	3	6	81376	81381	50 %	0 %	50 %	0 %	556555279
140	NC_022651	AG	4	8	82179	82186	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022651	GC	3	6	82286	82291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_022651	AT	3	6	82499	82504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022651	GC	3	6	84027	84032	0 %	0 %	50 %	50 %	556555282
144	NC_022651	GC	3	6	84100	84105	0 %	0 %	50 %	50 %	556555282
145	NC_022651	GC	3	6	84300	84305	0 %	0 %	50 %	50 %	556555282
146	NC_022651	CG	3	6	85778	85783	0 %	0 %	50 %	50 %	556555196
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.