MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli JJ1886 plasmid pJJ1886_5

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022651	TG	3	6	4296	4301	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022651	GC	3	6	4680	4685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_022651	AT	3	6	4705	4710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022651	TA	3	6	6509	6514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022651	AC	3	6	6523	6528	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_022651	GT	3	6	7890	7895	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022651	TC	3	6	10422	10427	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_022651	GT	3	6	11027	11032	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022651	AC	3	6	11436	11441	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_022651	TG	3	6	11641	11646	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022651	CG	3	6	16205	16210	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_022651	CA	3	6	16699	16704	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_022651	GC	3	6	18924	18929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_022651	TG	3	6	19115	19120	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022651	CG	3	6	19394	19399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_022651	CG	3	6	19507	19512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_022651	GA	3	6	20888	20893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022651	CG	3	6	21146	21151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_022651	TG	3	6	24511	24516	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022651	CG	3	6	24968	24973	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_022651	TA	3	6	27840	27845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022651	GT	3	6	28586	28591	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022651	AT	3	6	36840	36845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022651	GA	3	6	37145	37150	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022651	TG	3	6	37424	37429	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022651	CA	3	6	40897	40902	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_022651	TG	3	6	50974	50979	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022651	GC	3	6	65732	65737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_022651	CA	4	8	67999	68006	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_022651	TA	4	8	68067	68074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022651	GA	3	6	69163	69168	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022651	CT	4	8	69484	69491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_022651	TG	4	8	72065	72072	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022651	GA	3	6	79784	79789	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022651	AG	4	8	82179	82186	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022651	GC	3	6	82286	82291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_022651	AT	3	6	82499	82504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022651	CA	4	8	92841	92848	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_022651	TC	3	6	92967	92972	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_022651	CT	3	6	93039	93044	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_022651	TG	4	8	93817	93824	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022651	AT	4	8	95785	95792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022651	TC	3	6	96164	96169	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_022651	GA	3	6	96231	96236	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022651	AT	3	6	96460	96465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022651	TA	3	6	100210	100215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022651	TA	3	6	105803	105808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022651	TG	3	6	105860	105865	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022651	TC	3	6	105930	105935	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.