MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Escherichia coli JJ1886 plasmid pJJ1886_5

Total Repeats: 166

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022651	T	6	6	358	363	0 %	100 %	0 %	0 %	556555180
2	NC_022651	T	7	7	1117	1123	0 %	100 %	0 %	0 %	556555180
3	NC_022651	T	6	6	1671	1676	0 %	100 %	0 %	0 %	556555181
4	NC_022651	T	6	6	2987	2992	0 %	100 %	0 %	0 %	556555203
5	NC_022651	T	6	6	4304	4309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022651	G	6	6	5549	5554	0 %	0 %	100 %	0 %	556555207
7	NC_022651	A	6	6	6537	6542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022651	T	8	8	6590	6597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022651	T	6	6	6615	6620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022651	T	6	6	6771	6776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022651	T	6	6	6804	6809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022651	T	6	6	7141	7146	0 %	100 %	0 %	0 %	556555208
13	NC_022651	T	6	6	8109	8114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022651	A	7	7	8165	8171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022651	A	6	6	9184	9189	100 %	0 %	0 %	0 %	556555182
16	NC_022651	T	6	6	9992	9997	0 %	100 %	0 %	0 %	556555183
17	NC_022651	A	6	6	10102	10107	100 %	0 %	0 %	0 %	556555183
18	NC_022651	A	6	6	11662	11667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022651	G	6	6	12448	12453	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022651	A	6	6	12677	12682	100 %	0 %	0 %	0 %	556555209
21	NC_022651	A	6	6	15206	15211	100 %	0 %	0 %	0 %	556555213
22	NC_022651	T	6	6	16789	16794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022651	A	6	6	16809	16814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022651	A	6	6	17104	17109	100 %	0 %	0 %	0 %	556555216
25	NC_022651	A	6	6	17613	17618	100 %	0 %	0 %	0 %	556555217
26	NC_022651	A	7	7	18045	18051	100 %	0 %	0 %	0 %	556555217
27	NC_022651	A	6	6	18214	18219	100 %	0 %	0 %	0 %	556555217
28	NC_022651	C	6	6	18850	18855	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
29	NC_022651	G	6	6	19308	19313	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022651	T	6	6	20102	20107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022651	A	6	6	20122	20127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022651	A	6	6	20736	20741	100 %	0 %	0 %	0 %	556555184
33	NC_022651	T	6	6	26080	26085	0 %	100 %	0 %	0 %	556555223
34	NC_022651	A	6	6	28010	28015	100 %	0 %	0 %	0 %	556555224
35	NC_022651	T	7	7	28591	28597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022651	T	6	6	32582	32587	0 %	100 %	0 %	0 %	556555227
37	NC_022651	T	6	6	33029	33034	0 %	100 %	0 %	0 %	556555227
38	NC_022651	A	6	6	33283	33288	100 %	0 %	0 %	0 %	556555227
39	NC_022651	A	7	7	33379	33385	100 %	0 %	0 %	0 %	556555227
40	NC_022651	T	6	6	35995	36000	0 %	100 %	0 %	0 %	556555230
41	NC_022651	T	6	6	36402	36407	0 %	100 %	0 %	0 %	556555230
42	NC_022651	T	6	6	37751	37756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022651	T	7	7	37770	37776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022651	T	6	6	39305	39310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022651	T	6	6	40262	40267	0 %	100 %	0 %	0 %	556555189
46	NC_022651	G	6	6	40401	40406	0 %	0 %	100 %	0 %	556555234
47	NC_022651	A	6	6	40963	40968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022651	A	7	7	41016	41022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022651	C	6	6	41205	41210	0 %	0 %	0 %	100 %	556555235
50	NC_022651	T	6	6	41420	41425	0 %	100 %	0 %	0 %	556555236
51	NC_022651	T	6	6	41628	41633	0 %	100 %	0 %	0 %	556555236
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66	NC_022651	A	6	6	49749	49754	100 %	0 %	0 %	0 %	556555242
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111	NC_022651	A	6	6	69680	69685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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113	NC_022651	T	6	6	71000	71005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022651	T	6	6	71023	71028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022651	T	6	6	71111	71116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.