MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli JJ1886 plasmid pJJ1886_4

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022650	GACCA	2	10	338	347	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_022650	AGTGA	2	10	534	543	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022650	ACTTC	2	10	1176	1185	20 %	40 %	0 %	40 %	556555104
4	NC_022650	TTTGC	2	10	3314	3323	0 %	60 %	20 %	20 %	556555104
5	NC_022650	AAAGT	2	10	3867	3876	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022650	CCGAT	2	10	5424	5433	20 %	20 %	20 %	40 %	556555108
7	NC_022650	CATCC	2	10	6551	6560	20 %	20 %	0 %	60 %	556555110
8	NC_022650	ATGGG	2	10	6921	6930	20 %	20 %	60 %	0 %	556555110
9	NC_022650	TCCAT	2	10	7771	7780	20 %	40 %	0 %	40 %	556555111
10	NC_022650	CTCAG	2	10	7819	7828	20 %	20 %	20 %	40 %	556555111
11	NC_022650	GTAGG	2	10	9622	9631	20 %	20 %	60 %	0 %	556555114
12	NC_022650	TTTAG	2	10	13540	13549	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022650	TTTAT	2	10	14156	14165	20 %	80 %	0 %	0 %	556555120
14	NC_022650	AGGGT	2	10	15840	15849	20 %	20 %	60 %	0 %	556555123
15	NC_022650	AAAAT	2	10	19377	19386	80 %	20 %	0 %	0 %	556555128
16	NC_022650	CAGCC	2	10	21852	21861	20 %	0 %	20 %	60 %	556555131
17	NC_022650	ACGCT	2	10	25747	25756	20 %	20 %	20 %	40 %	556555136
18	NC_022650	ATGGA	2	10	26901	26910	40 %	20 %	40 %	0 %	556555136
19	NC_022650	ACCGC	2	10	28026	28035	20 %	0 %	20 %	60 %	556555137
20	NC_022650	GCAGC	2	10	28823	28832	20 %	0 %	40 %	40 %	556555138
21	NC_022650	GTTCG	2	10	29562	29571	0 %	40 %	40 %	20 %	556555139
22	NC_022650	AAACC	2	10	30116	30125	60 %	0 %	0 %	40 %	556555140
23	NC_022650	GAACA	2	10	30391	30400	60 %	0 %	20 %	20 %	556555140
24	NC_022650	CGTTT	2	10	31228	31237	0 %	60 %	20 %	20 %	556555141
25	NC_022650	GAACA	2	10	31651	31660	60 %	0 %	20 %	20 %	556555141
26	NC_022650	ACAAA	2	10	36919	36928	80 %	0 %	0 %	20 %	556555149
27	NC_022650	GCTTT	2	10	39619	39628	0 %	60 %	20 %	20 %	556555156
28	NC_022650	CCATT	2	10	40971	40980	20 %	40 %	0 %	40 %	556555159
29	NC_022650	AAATG	2	10	42016	42025	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022650	TTTAC	2	10	42949	42958	20 %	60 %	0 %	20 %	556555161
31	NC_022650	GAACA	2	10	43816	43825	60 %	0 %	20 %	20 %	556555162
32	NC_022650	GTTCG	2	10	48793	48802	0 %	40 %	40 %	20 %	556555170
33	NC_022650	TTTCA	2	10	48977	48986	20 %	60 %	0 %	20 %	556555170
34	NC_022650	GTAAC	2	10	50130	50139	40 %	20 %	20 %	20 %	556555170
35	NC_022650	TCTGC	2	10	50785	50794	0 %	40 %	20 %	40 %	556555170

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.