MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Escherichia coli JJ1886 plasmid pJJ1886_4

Total Repeats: 166

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022650	ATTC	2	8	286	293	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_022650	GTAA	2	8	731	738	50 %	25 %	25 %	0 %	556555103
3	NC_022650	ATTT	2	8	755	762	25 %	75 %	0 %	0 %	556555103
4	NC_022650	TTCC	2	8	1344	1351	0 %	50 %	0 %	50 %	556555104
5	NC_022650	TGGC	2	8	1352	1359	0 %	25 %	50 %	25 %	556555104
6	NC_022650	GTTC	2	8	1518	1525	0 %	50 %	25 %	25 %	556555104
7	NC_022650	TCAT	2	8	1569	1576	25 %	50 %	0 %	25 %	556555104
8	NC_022650	CTTC	2	8	1975	1982	0 %	50 %	0 %	50 %	556555104
9	NC_022650	CTGC	2	8	2173	2180	0 %	25 %	25 %	50 %	556555104
10	NC_022650	TGGA	2	8	3020	3027	25 %	25 %	50 %	0 %	556555104
11	NC_022650	TTTA	2	8	3029	3036	25 %	75 %	0 %	0 %	556555104
12	NC_022650	GGAA	2	8	3172	3179	50 %	0 %	50 %	0 %	556555104
13	NC_022650	AAAG	3	12	4422	4433	75 %	0 %	25 %	0 %	556555106
14	NC_022650	AAAG	2	8	4455	4462	75 %	0 %	25 %	0 %	556555106
15	NC_022650	ACTA	2	8	4564	4571	50 %	25 %	0 %	25 %	556555106
16	NC_022650	TCAT	2	8	4978	4985	25 %	50 %	0 %	25 %	556555107
17	NC_022650	GATG	2	8	5356	5363	25 %	25 %	50 %	0 %	556555107
18	NC_022650	CATT	2	8	5772	5779	25 %	50 %	0 %	25 %	556555108
19	NC_022650	AATT	2	8	6132	6139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022650	TTTC	2	8	6485	6492	0 %	75 %	0 %	25 %	556555110
21	NC_022650	CTGC	2	8	6830	6837	0 %	25 %	25 %	50 %	556555110
22	NC_022650	TACC	2	8	7259	7266	25 %	25 %	0 %	50 %	556555111
23	NC_022650	AGCA	2	8	7542	7549	50 %	0 %	25 %	25 %	556555111
24	NC_022650	TTCC	2	8	7697	7704	0 %	50 %	0 %	50 %	556555111
25	NC_022650	GTAA	2	8	8189	8196	50 %	25 %	25 %	0 %	556555112
26	NC_022650	CTGA	2	8	8304	8311	25 %	25 %	25 %	25 %	556555112
27	NC_022650	CCGT	2	8	8684	8691	0 %	25 %	25 %	50 %	556555113
28	NC_022650	CTTG	2	8	8862	8869	0 %	50 %	25 %	25 %	556555113
29	NC_022650	CAGC	2	8	9273	9280	25 %	0 %	25 %	50 %	556555113
30	NC_022650	CTGG	2	8	9513	9520	0 %	25 %	50 %	25 %	556555114
31	NC_022650	GACA	2	8	9600	9607	50 %	0 %	25 %	25 %	556555114
32	NC_022650	ATCA	2	8	9864	9871	50 %	25 %	0 %	25 %	556555114
33	NC_022650	GTTT	2	8	11022	11029	0 %	75 %	25 %	0 %	556555116
34	NC_022650	AGTC	2	8	11648	11655	25 %	25 %	25 %	25 %	556555117
35	NC_022650	ATCT	2	8	12332	12339	25 %	50 %	0 %	25 %	556555117
36	NC_022650	AAGC	2	8	12957	12964	50 %	0 %	25 %	25 %	556555118
37	NC_022650	CAGC	2	8	13305	13312	25 %	0 %	25 %	50 %	556555118
38	NC_022650	TTGG	2	8	13481	13488	0 %	50 %	50 %	0 %	556555118
39	NC_022650	TTAT	2	8	13612	13619	25 %	75 %	0 %	0 %	556555119
40	NC_022650	CAAT	2	8	13853	13860	50 %	25 %	0 %	25 %	556555119
41	NC_022650	CAGT	2	8	13874	13881	25 %	25 %	25 %	25 %	556555119
42	NC_022650	GGGT	2	8	13975	13982	0 %	25 %	75 %	0 %	556555119
43	NC_022650	CTTG	2	8	14029	14036	0 %	50 %	25 %	25 %	556555119
44	NC_022650	GTAC	2	8	14546	14553	25 %	25 %	25 %	25 %	556555121
45	NC_022650	TTCA	2	8	14603	14610	25 %	50 %	0 %	25 %	556555121
46	NC_022650	AATA	2	8	14723	14730	75 %	25 %	0 %	0 %	556555121
47	NC_022650	CATG	2	8	15123	15130	25 %	25 %	25 %	25 %	556555122
48	NC_022650	TGGC	2	8	15306	15313	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_022650	TTTC	2	8	16443	16450	0 %	75 %	0 %	25 %	556555124
50	NC_022650	TGTT	2	8	17919	17926	0 %	75 %	25 %	0 %	556555126
51	NC_022650	TTTA	2	8	18515	18522	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022650	GAGG	2	8	18732	18739	25 %	0 %	75 %	0 %	556555127
53	NC_022650	TAAA	2	8	18927	18934	75 %	25 %	0 %	0 %	556555128
54	NC_022650	AAAC	2	8	19085	19092	75 %	0 %	0 %	25 %	556555128
55	NC_022650	TAAA	2	8	19132	19139	75 %	25 %	0 %	0 %	556555128
56	NC_022650	CTTT	2	8	19295	19302	0 %	75 %	0 %	25 %	556555128
57	NC_022650	TCAT	2	8	19426	19433	25 %	50 %	0 %	25 %	556555128
58	NC_022650	GCAG	2	8	19564	19571	25 %	0 %	50 %	25 %	556555129
59	NC_022650	TGGT	2	8	19959	19966	0 %	50 %	50 %	0 %	556555099
60	NC_022650	GAGT	2	8	20572	20579	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022650	GAGT	2	8	20738	20745	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022650	TTTA	2	8	21160	21167	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022650	AAAG	2	8	23221	23228	75 %	0 %	25 %	0 %	556555132
64	NC_022650	CTTG	2	8	23344	23351	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_022650	GTTT	2	8	23355	23362	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022650	GACA	2	8	24035	24042	50 %	0 %	25 %	25 %	556555133
67	NC_022650	GAAC	2	8	24917	24924	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_022650	CAGC	2	8	25116	25123	25 %	0 %	25 %	50 %	556555135
69	NC_022650	CTTG	2	8	25244	25251	0 %	50 %	25 %	25 %	556555136
70	NC_022650	TGTA	2	8	25373	25380	25 %	50 %	25 %	0 %	556555136
71	NC_022650	CGAC	2	8	25435	25442	25 %	0 %	25 %	50 %	556555136
72	NC_022650	TTCA	2	8	26022	26029	25 %	50 %	0 %	25 %	556555136
73	NC_022650	GTCA	2	8	26307	26314	25 %	25 %	25 %	25 %	556555136
74	NC_022650	CTGC	2	8	27415	27422	0 %	25 %	25 %	50 %	556555136
75	NC_022650	TTAC	2	8	27909	27916	25 %	50 %	0 %	25 %	556555137
76	NC_022650	GAAT	2	8	28153	28160	50 %	25 %	25 %	0 %	556555137
77	NC_022650	GAGC	2	8	28586	28593	25 %	0 %	50 %	25 %	556555138
78	NC_022650	TACC	2	8	28960	28967	25 %	25 %	0 %	50 %	556555138
79	NC_022650	GGTG	2	8	30507	30514	0 %	25 %	75 %	0 %	556555140
80	NC_022650	CAGT	2	8	30606	30613	25 %	25 %	25 %	25 %	556555140
81	NC_022650	CGGA	2	8	30836	30843	25 %	0 %	50 %	25 %	556555140
82	NC_022650	CTTC	2	8	31262	31269	0 %	50 %	0 %	50 %	556555141
83	NC_022650	CGCT	2	8	31852	31859	0 %	25 %	25 %	50 %	556555141
84	NC_022650	TGAC	2	8	32105	32112	25 %	25 %	25 %	25 %	556555142
85	NC_022650	GCTT	2	8	33502	33509	0 %	50 %	25 %	25 %	556555143
86	NC_022650	ACAA	2	8	33717	33724	75 %	0 %	0 %	25 %	556555143
87	NC_022650	TTTA	2	8	34258	34265	25 %	75 %	0 %	0 %	556555145
88	NC_022650	CATA	2	8	35093	35100	50 %	25 %	0 %	25 %	556555146
89	NC_022650	TGGT	2	8	35121	35128	0 %	50 %	50 %	0 %	556555146
90	NC_022650	GTAT	2	8	35281	35288	25 %	50 %	25 %	0 %	556555146
91	NC_022650	GGGA	2	8	36104	36111	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022650	GATA	2	8	36231	36238	50 %	25 %	25 %	0 %	556555148
93	NC_022650	TCTT	2	8	36334	36341	0 %	75 %	0 %	25 %	556555148
94	NC_022650	ATTC	2	8	36368	36375	25 %	50 %	0 %	25 %	556555148
95	NC_022650	CTAA	2	8	36448	36455	50 %	25 %	0 %	25 %	556555148
96	NC_022650	GATA	2	8	36774	36781	50 %	25 %	25 %	0 %	556555149
97	NC_022650	TTTG	2	8	37163	37170	0 %	75 %	25 %	0 %	556555150
98	NC_022650	TCTT	2	8	37312	37319	0 %	75 %	0 %	25 %	556555151
99	NC_022650	TTTG	2	8	37512	37519	0 %	75 %	25 %	0 %	556555151
100	NC_022650	GCTG	2	8	37890	37897	0 %	25 %	50 %	25 %	556555152
101	NC_022650	GGCT	2	8	38022	38029	0 %	25 %	50 %	25 %	556555152
102	NC_022650	AATT	2	8	38186	38193	50 %	50 %	0 %	0 %	556555152
103	NC_022650	TAAA	2	8	38249	38256	75 %	25 %	0 %	0 %	556555153
104	NC_022650	ATAA	2	8	38335	38342	75 %	25 %	0 %	0 %	556555153
105	NC_022650	AGAA	2	8	38396	38403	75 %	0 %	25 %	0 %	556555153
106	NC_022650	CTTT	2	8	38508	38515	0 %	75 %	0 %	25 %	556555154
107	NC_022650	CAAT	2	8	39405	39412	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_022650	CTTT	2	8	39504	39511	0 %	75 %	0 %	25 %	556555156
109	NC_022650	GTTT	2	8	39544	39551	0 %	75 %	25 %	0 %	556555156
110	NC_022650	TTTC	2	8	39968	39975	0 %	75 %	0 %	25 %	556555157
111	NC_022650	GTAA	2	8	40213	40220	50 %	25 %	25 %	0 %	556555157
112	NC_022650	TTTG	2	8	40338	40345	0 %	75 %	25 %	0 %	556555157
113	NC_022650	TATC	2	8	40370	40377	25 %	50 %	0 %	25 %	556555157
114	NC_022650	CGCC	2	8	40454	40461	0 %	0 %	25 %	75 %	556555158
115	NC_022650	TAAA	2	8	40593	40600	75 %	25 %	0 %	0 %	556555158
116	NC_022650	CAGC	2	8	41057	41064	25 %	0 %	25 %	50 %	556555159
117	NC_022650	GTTG	2	8	41155	41162	0 %	50 %	50 %	0 %	556555159
118	NC_022650	GTCT	2	8	41685	41692	0 %	50 %	25 %	25 %	556555160
119	NC_022650	TGGC	2	8	42396	42403	0 %	25 %	50 %	25 %	556555161
120	NC_022650	GGTA	2	8	42550	42557	25 %	25 %	50 %	0 %	556555161
121	NC_022650	TTCG	2	8	42631	42638	0 %	50 %	25 %	25 %	556555161
122	NC_022650	ATGA	2	8	42973	42980	50 %	25 %	25 %	0 %	556555162
123	NC_022650	ATAC	2	8	43153	43160	50 %	25 %	0 %	25 %	556555162
124	NC_022650	GCAA	2	8	43394	43401	50 %	0 %	25 %	25 %	556555162
125	NC_022650	GACA	2	8	43530	43537	50 %	0 %	25 %	25 %	556555162
126	NC_022650	ATTA	2	8	44373	44380	50 %	50 %	0 %	0 %	556555164
127	NC_022650	CTTC	2	8	44503	44510	0 %	50 %	0 %	50 %	556555165
128	NC_022650	TTTC	2	8	44831	44838	0 %	75 %	0 %	25 %	556555165
129	NC_022650	TGAT	2	8	44908	44915	25 %	50 %	25 %	0 %	556555165
130	NC_022650	AGAA	2	8	44954	44961	75 %	0 %	25 %	0 %	556555165
131	NC_022650	AATG	2	8	44969	44976	50 %	25 %	25 %	0 %	556555165
132	NC_022650	CTGT	2	8	45133	45140	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_022650	GAAC	2	8	45337	45344	50 %	0 %	25 %	25 %	556555166
134	NC_022650	TGAG	2	8	45423	45430	25 %	25 %	50 %	0 %	556555166
135	NC_022650	ATGG	2	8	45843	45850	25 %	25 %	50 %	0 %	556555167
136	NC_022650	TTTA	2	8	45973	45980	25 %	75 %	0 %	0 %	556555101
137	NC_022650	TATC	2	8	46130	46137	25 %	50 %	0 %	25 %	556555101
138	NC_022650	GACT	2	8	46745	46752	25 %	25 %	25 %	25 %	556555169
139	NC_022650	TTCT	2	8	46849	46856	0 %	75 %	0 %	25 %	556555169
140	NC_022650	GCAG	2	8	47221	47228	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_022650	CTGC	2	8	47476	47483	0 %	25 %	25 %	50 %	556555170
142	NC_022650	CCTT	2	8	48054	48061	0 %	50 %	0 %	50 %	556555170
143	NC_022650	CTGC	2	8	48220	48227	0 %	25 %	25 %	50 %	556555170
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165	NC_022650	AAGG	2	8	55154	55161	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
166	NC_022650	TCCA	2	8	55650	55657	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.