MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli JJ1886 plasmid pJJ1886_4

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022650	CCG	2	6	19	24	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_022650	AAC	2	6	92	97	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_022650	TCA	2	6	216	221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_022650	CAG	2	6	227	232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_022650	CAG	2	6	235	240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_022650	TCA	2	6	313	318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_022650	GCA	2	6	351	356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_022650	CAG	2	6	470	475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_022650	GCC	2	6	528	533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_022650	TTA	2	6	585	590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022650	CGG	2	6	3802	3807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_022650	TGT	2	6	6294	6299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022650	TTG	2	6	6368	6373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022650	TAT	2	6	8353	8358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022650	CCT	2	6	15243	15248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_022650	TCT	2	6	15364	15369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_022650	GCT	2	6	15513	15518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_022650	ATA	2	6	17545	17550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022650	ATT	3	9	17576	17584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022650	ATA	2	6	18289	18294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022650	CAT	2	6	20305	20310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_022650	ATT	2	6	20311	20316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022650	ATC	2	6	20330	20335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_022650	CTT	2	6	20440	20445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_022650	CTG	2	6	20460	20465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_022650	AGT	2	6	20586	20591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022650	CAT	2	6	20594	20599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_022650	TTA	2	6	20624	20629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022650	AAG	2	6	20910	20915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022650	GAT	2	6	22268	22273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022650	GAA	2	6	22874	22879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022650	ACC	2	6	23309	23314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_022650	AAT	2	6	23315	23320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022650	GGA	2	6	24383	24388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022650	AAC	2	6	24466	24471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_022650	GGC	2	6	24906	24911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_022650	AAT	2	6	34059	34064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022650	GAT	2	6	35578	35583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022650	ATG	2	6	35775	35780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022650	TGT	3	9	35791	35799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022650	GGT	2	6	35864	35869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022650	CTG	2	6	35921	35926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_022650	CAG	2	6	35949	35954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_022650	TAA	2	6	36127	36132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022650	GTC	2	6	37584	37589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_022650	AGC	2	6	37598	37603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_022650	CAA	2	6	37643	37648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_022650	AGT	2	6	41329	41334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022650	AAC	2	6	41388	41393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_022650	ACC	2	6	41398	41403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_022650	ATC	2	6	41494	41499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_022650	CAT	2	6	42048	42053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_022650	GGC	2	6	45210	45215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_022650	AAT	2	6	45251	45256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022650	TTC	2	6	46674	46679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_022650	TCA	2	6	54666	54671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_022650	GCA	2	6	54675	54680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_022650	GAA	2	6	54752	54757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022650	ACC	2	6	54801	54806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_022650	CGC	2	6	54811	54816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_022650	CAG	2	6	54881	54886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_022650	CCT	2	6	54898	54903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_022650	AGA	2	6	55221	55226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022650	TTC	2	6	55242	55247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_022650	GTT	2	6	55316	55321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022650	CAG	2	6	55352	55357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_022650	TCA	2	6	55456	55461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_022650	CCA	2	6	55501	55506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_022650	CAT	2	6	55580	55585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_022650	GAT	2	6	55612	55617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022650	CTC	2	6	55669	55674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_022650	ATG	2	6	55689	55694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022650	CAT	2	6	55726	55731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_022650	GGA	2	6	55753	55758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.