MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli JJ1886 plasmid pJJ1886_4

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022650	TG	3	6	507	512	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022650	AT	3	6	1032	1037	50 %	50 %	0 %	0 %	556555104
3	NC_022650	CT	3	6	1947	1952	0 %	50 %	0 %	50 %	556555104
4	NC_022650	TC	3	6	3531	3536	0 %	50 %	0 %	50 %	556555105
5	NC_022650	AC	3	6	4087	4092	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_022650	AC	3	6	4120	4125	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_022650	GA	3	6	4477	4482	50 %	0 %	50 %	0 %	556555106
8	NC_022650	CT	3	6	6471	6476	0 %	50 %	0 %	50 %	556555110
9	NC_022650	GA	3	6	7804	7809	50 %	0 %	50 %	0 %	556555111
10	NC_022650	GA	3	6	9410	9415	50 %	0 %	50 %	0 %	556555113
11	NC_022650	GA	3	6	9984	9989	50 %	0 %	50 %	0 %	556555114
12	NC_022650	AC	3	6	11199	11204	50 %	0 %	0 %	50 %	556555116
13	NC_022650	AG	3	6	11247	11252	50 %	0 %	50 %	0 %	556555116
14	NC_022650	GC	3	6	11814	11819	0 %	0 %	50 %	50 %	556555117
15	NC_022650	CT	3	6	16209	16214	0 %	50 %	0 %	50 %	556555124
16	NC_022650	TC	3	6	16228	16233	0 %	50 %	0 %	50 %	556555124
17	NC_022650	AG	3	6	18916	18921	50 %	0 %	50 %	0 %	556555128
18	NC_022650	TA	3	6	19347	19352	50 %	50 %	0 %	0 %	556555128
19	NC_022650	AC	3	6	19878	19883	50 %	0 %	0 %	50 %	556555099
20	NC_022650	TA	3	6	20876	20881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022650	CG	3	6	22082	22087	0 %	0 %	50 %	50 %	556555131
22	NC_022650	AT	3	6	24350	24355	50 %	50 %	0 %	0 %	556555133
23	NC_022650	CA	4	8	24398	24405	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_022650	AG	3	6	25449	25454	50 %	0 %	50 %	0 %	556555136
25	NC_022650	AC	3	6	26604	26609	50 %	0 %	0 %	50 %	556555136
26	NC_022650	GA	3	6	28752	28757	50 %	0 %	50 %	0 %	556555138
27	NC_022650	TA	3	6	29118	29123	50 %	50 %	0 %	0 %	556555138
28	NC_022650	TG	3	6	29914	29919	0 %	50 %	50 %	0 %	556555140
29	NC_022650	AT	3	6	32007	32012	50 %	50 %	0 %	0 %	556555142
30	NC_022650	CA	3	6	32236	32241	50 %	0 %	0 %	50 %	556555143
31	NC_022650	AC	4	8	34618	34625	50 %	0 %	0 %	50 %	556555145
32	NC_022650	AT	3	6	36239	36244	50 %	50 %	0 %	0 %	556555148
33	NC_022650	AT	3	6	36263	36268	50 %	50 %	0 %	0 %	556555148
34	NC_022650	AC	3	6	37365	37370	50 %	0 %	0 %	50 %	556555151
35	NC_022650	AG	3	6	37667	37672	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022650	CT	3	6	38008	38013	0 %	50 %	0 %	50 %	556555152
37	NC_022650	TG	3	6	38672	38677	0 %	50 %	50 %	0 %	556555154
38	NC_022650	TG	3	6	41849	41854	0 %	50 %	50 %	0 %	556555160
39	NC_022650	AC	3	6	43347	43352	50 %	0 %	0 %	50 %	556555162
40	NC_022650	AC	3	6	43578	43583	50 %	0 %	0 %	50 %	556555162
41	NC_022650	AT	3	6	45123	45128	50 %	50 %	0 %	0 %	556555165
42	NC_022650	TA	3	6	46666	46671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022650	AC	3	6	47085	47090	50 %	0 %	0 %	50 %	556555169
44	NC_022650	CT	3	6	52253	52258	0 %	50 %	0 %	50 %	556555102
45	NC_022650	AT	3	6	53606	53611	50 %	50 %	0 %	0 %	556555172
46	NC_022650	CA	4	8	54572	54579	50 %	0 %	0 %	50 %	556555174
47	NC_022650	CG	3	6	54686	54691	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_022650	AC	3	6	54916	54921	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.