MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Escherichia coli JJ1886 plasmid pJJ1886_2

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022649	TGC	2	6	115	120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555084
2	NC_022649	ACG	2	6	437	442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555084
3	NC_022649	CTG	2	6	806	811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555084
4	NC_022649	AAG	2	6	824	829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555084
5	NC_022649	ATC	2	6	869	874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555084
6	NC_022649	TCG	2	6	903	908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555084
7	NC_022649	GCG	2	6	921	926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555084
8	NC_022649	AAC	2	6	1470	1475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_022649	ACA	2	6	1551	1556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_022649	GTT	2	6	1564	1569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022649	AAC	2	6	1581	1586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_022649	ATA	2	6	1606	1611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022649	CAA	2	6	1869	1874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_022649	CAT	2	6	1911	1916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_022649	AAC	2	6	1962	1967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_022649	ATT	2	6	2278	2283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022649	ATA	2	6	2341	2346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022649	TAA	2	6	2396	2401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022649	TTA	2	6	2498	2503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022649	ATA	2	6	2648	2653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022649	ATC	2	6	2662	2667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_022649	TAT	2	6	2697	2702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555083
23	NC_022649	TGA	2	6	2796	2801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555083
24	NC_022649	CCA	2	6	2978	2983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556555086
25	NC_022649	CCG	2	6	3017	3022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555086
26	NC_022649	TCT	2	6	3460	3465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555086
27	NC_022649	CAT	2	6	3586	3591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555087
28	NC_022649	ATG	2	6	3714	3719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555087
29	NC_022649	CAT	2	6	3733	3738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555087
30	NC_022649	CGT	2	6	3780	3785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555087
31	NC_022649	CAT	2	6	4009	4014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555087
32	NC_022649	TCA	2	6	4027	4032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555087
33	NC_022649	CGC	2	6	4054	4059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555087
34	NC_022649	GCC	2	6	4233	4238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555087
35	NC_022649	CCA	2	6	4371	4376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556555087
36	NC_022649	CGA	2	6	4439	4444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_022649	CCG	2	6	4512	4517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_022649	GAA	2	6	4608	4613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555088
39	NC_022649	TCA	2	6	4625	4630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555088
40	NC_022649	ACG	2	6	4815	4820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555088
41	NC_022649	GCG	2	6	5052	5057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_022649	ACC	2	6	5064	5069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_022649	CTG	2	6	5128	5133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.