MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus Z172 plasmid pZ172_1

Total Repeats: 100

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022610	AATT	2	8	208	215	50 %	50 %	0 %	0 %	554652312
2	NC_022610	AAAC	2	8	704	711	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_022610	TAAT	2	8	957	964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022610	CAAA	2	8	977	984	75 %	0 %	0 %	25 %	554652314
5	NC_022610	TCTT	2	8	1260	1267	0 %	75 %	0 %	25 %	554652314
6	NC_022610	TTTA	2	8	1341	1348	25 %	75 %	0 %	0 %	554652314
7	NC_022610	TCTT	2	8	1539	1546	0 %	75 %	0 %	25 %	554652314
8	NC_022610	CTTT	2	8	1576	1583	0 %	75 %	0 %	25 %	554652314
9	NC_022610	TAAT	2	8	1630	1637	50 %	50 %	0 %	0 %	554652314
10	NC_022610	GTTT	2	8	1690	1697	0 %	75 %	25 %	0 %	554652314
11	NC_022610	TATG	2	8	2299	2306	25 %	50 %	25 %	0 %	554652315
12	NC_022610	ATCC	2	8	2332	2339	25 %	25 %	0 %	50 %	554652315
13	NC_022610	TAGA	2	8	2352	2359	50 %	25 %	25 %	0 %	554652315
14	NC_022610	TATT	2	8	2510	2517	25 %	75 %	0 %	0 %	554652315
15	NC_022610	TTTA	2	8	3978	3985	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022610	TAGA	2	8	4056	4063	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022610	TATT	2	8	4320	4327	25 %	75 %	0 %	0 %	554652318
18	NC_022610	GTAT	2	8	4743	4750	25 %	50 %	25 %	0 %	554652320
19	NC_022610	TTAG	2	8	4902	4909	25 %	50 %	25 %	0 %	554652320
20	NC_022610	TGAA	2	8	5046	5053	50 %	25 %	25 %	0 %	554652320
21	NC_022610	TTAC	2	8	5168	5175	25 %	50 %	0 %	25 %	554652321
22	NC_022610	TTTA	2	8	5308	5315	25 %	75 %	0 %	0 %	554652321
23	NC_022610	CTAG	2	8	6103	6110	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_022610	TAAA	2	8	6474	6481	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022610	ATAA	2	8	6516	6523	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022610	AAAT	2	8	6692	6699	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022610	TACA	2	8	7009	7016	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_022610	ATTA	2	8	7182	7189	50 %	50 %	0 %	0 %	554652324
29	NC_022610	TTAG	2	8	7657	7664	25 %	50 %	25 %	0 %	554652324
30	NC_022610	CAAC	2	8	7728	7735	50 %	0 %	0 %	50 %	554652324
31	NC_022610	TCGG	2	8	7876	7883	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_022610	AAGC	2	8	8229	8236	50 %	0 %	25 %	25 %	554652325
33	NC_022610	GCTA	2	8	8693	8700	25 %	25 %	25 %	25 %	554652325
34	NC_022610	GTGG	2	8	8926	8933	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022610	ATTT	2	8	8946	8953	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022610	ATTT	2	8	8961	8968	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022610	AGGT	2	8	9252	9259	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022610	TGTA	2	8	9579	9586	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022610	TAAA	2	8	9852	9859	75 %	25 %	0 %	0 %	554652326
40	NC_022610	AAAT	2	8	10044	10051	75 %	25 %	0 %	0 %	554652326
41	NC_022610	AAGA	2	8	10845	10852	75 %	0 %	25 %	0 %	554652327
42	NC_022610	TATT	2	8	11242	11249	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022610	ACAT	2	8	12077	12084	50 %	25 %	0 %	25 %	554652328
44	NC_022610	AAGA	2	8	12311	12318	75 %	0 %	25 %	0 %	554652328
45	NC_022610	AGTA	2	8	12652	12659	50 %	25 %	25 %	0 %	554652329
46	NC_022610	TATT	2	8	13190	13197	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022610	TAGA	2	8	13223	13230	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022610	CCGA	2	8	13463	13470	25 %	0 %	25 %	50 %	554652330
49	NC_022610	CGGA	2	8	13558	13565	25 %	0 %	50 %	25 %	554652330
50	NC_022610	ACGG	2	8	13853	13860	25 %	0 %	50 %	25 %	554652330
51	NC_022610	TCAC	2	8	14191	14198	25 %	25 %	0 %	50 %	554652331
52	NC_022610	CGAT	2	8	14366	14373	25 %	25 %	25 %	25 %	554652331
53	NC_022610	CGCT	2	8	14815	14822	0 %	25 %	25 %	50 %	554652331
54	NC_022610	TCAT	2	8	14965	14972	25 %	50 %	0 %	25 %	554652331
55	NC_022610	TGAC	2	8	15145	15152	25 %	25 %	25 %	25 %	554652331
56	NC_022610	GGCT	2	8	15448	15455	0 %	25 %	50 %	25 %	554652331
57	NC_022610	CATC	2	8	16052	16059	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_022610	TACA	2	8	16105	16112	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_022610	ATAG	2	8	16509	16516	50 %	25 %	25 %	0 %	554652332
60	NC_022610	CTTT	2	8	17076	17083	0 %	75 %	0 %	25 %	554652333
61	NC_022610	AACT	2	8	17104	17111	50 %	25 %	0 %	25 %	554652333
62	NC_022610	TAGG	2	8	17227	17234	25 %	25 %	50 %	0 %	554652333
63	NC_022610	ATTC	2	8	17269	17276	25 %	50 %	0 %	25 %	554652333
64	NC_022610	ATTT	2	8	17374	17381	25 %	75 %	0 %	0 %	554652334
65	NC_022610	TTAT	2	8	17893	17900	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022610	TACC	2	8	18370	18377	25 %	25 %	0 %	50 %	554652335
67	NC_022610	TTAC	2	8	18549	18556	25 %	50 %	0 %	25 %	554652335
68	NC_022610	ACAT	2	8	19172	19179	50 %	25 %	0 %	25 %	554652336
69	NC_022610	AAGA	2	8	19406	19413	75 %	0 %	25 %	0 %	554652336
70	NC_022610	CTTA	2	8	19995	20002	25 %	50 %	0 %	25 %	554652337
71	NC_022610	AGTA	2	8	20483	20490	50 %	25 %	25 %	0 %	554652337
72	NC_022610	TAGA	2	8	20766	20773	50 %	25 %	25 %	0 %	554652337
73	NC_022610	CCAT	2	8	21220	21227	25 %	25 %	0 %	50 %	554652337
74	NC_022610	CGTA	2	8	22099	22106	25 %	25 %	25 %	25 %	554652338
75	NC_022610	GTAA	2	8	22189	22196	50 %	25 %	25 %	0 %	554652338
76	NC_022610	TCTT	2	8	22322	22329	0 %	75 %	0 %	25 %	554652338
77	NC_022610	TTCA	2	8	22350	22357	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_022610	ATTT	2	8	22361	22368	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022610	GCAA	2	8	22400	22407	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_022610	TGAA	2	8	22413	22420	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022610	AAGT	2	8	22429	22436	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022610	AACG	2	8	22461	22468	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_022610	TAGA	2	8	22894	22901	50 %	25 %	25 %	0 %	554652339
84	NC_022610	TAAA	2	8	23140	23147	75 %	25 %	0 %	0 %	554652339
85	NC_022610	ATAA	2	8	23278	23285	75 %	25 %	0 %	0 %	554652339
86	NC_022610	AAGA	2	8	23300	23307	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022610	TATT	2	8	23388	23395	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022610	ATGA	2	8	23407	23414	50 %	25 %	25 %	0 %	554652340
89	NC_022610	TTAT	2	8	23898	23905	25 %	75 %	0 %	0 %	554652340
90	NC_022610	ATTG	2	8	24023	24030	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022610	TAAC	2	8	24320	24327	50 %	25 %	0 %	25 %	554652341
92	NC_022610	AATA	2	8	24713	24720	75 %	25 %	0 %	0 %	554652342
93	NC_022610	CATT	2	8	24795	24802	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_022610	AACG	2	8	24872	24879	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_022610	ATAA	2	8	25446	25453	75 %	25 %	0 %	0 %	554652343
96	NC_022610	GTTT	2	8	25749	25756	0 %	75 %	25 %	0 %	554652344
97	NC_022610	ATTA	2	8	25780	25787	50 %	50 %	0 %	0 %	554652344
98	NC_022610	AAAG	2	8	26087	26094	75 %	0 %	25 %	0 %	554652344
99	NC_022610	TAAT	2	8	26202	26209	50 %	50 %	0 %	0 %	554652344
100	NC_022610	TATG	2	8	26893	26900	25 %	50 %	25 %	0 %	554652344

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.