MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus Z172 plasmid pZ172_1

Total Repeats: 277

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022610	TGA	2	6	91	96	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554652312
2	NC_022610	TAG	2	6	160	165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554652312
3	NC_022610	TTA	2	6	249	254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554652312
4	NC_022610	TTA	2	6	397	402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554652312
5	NC_022610	TAT	3	9	440	448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554652312
6	NC_022610	TAC	2	6	454	459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554652312
7	NC_022610	ATG	2	6	637	642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554652312
8	NC_022610	ATT	2	6	653	658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554652312
9	NC_022610	GAT	2	6	795	800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554652313
10	NC_022610	TTC	2	6	1044	1049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554652314
11	NC_022610	ATC	2	6	1059	1064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554652314
12	NC_022610	TGT	2	6	1159	1164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554652314
13	NC_022610	TTC	2	6	1182	1187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554652314
14	NC_022610	CTT	2	6	1199	1204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554652314
15	NC_022610	TTA	2	6	1300	1305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554652314
16	NC_022610	TTG	2	6	1323	1328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554652314
17	NC_022610	TTG	2	6	1368	1373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554652314
18	NC_022610	GTT	2	6	1379	1384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554652314
19	NC_022610	ATT	2	6	1494	1499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554652314
20	NC_022610	ATT	2	6	1677	1682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554652314
21	NC_022610	TAT	2	6	2179	2184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554652315
22	NC_022610	CAG	2	6	2283	2288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554652315
23	NC_022610	ATT	2	6	2308	2313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554652315
24	NC_022610	AAT	2	6	2360	2365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554652315
25	NC_022610	TAA	2	6	2386	2391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554652315
26	NC_022610	TTA	2	6	2465	2470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554652315
27	NC_022610	TAA	2	6	2491	2496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554652315
28	NC_022610	ATA	2	6	2661	2666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554652315
29	NC_022610	TAA	2	6	2730	2735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554652315
30	NC_022610	ATA	2	6	2736	2741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554652315
31	NC_022610	ATC	2	6	2742	2747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554652315
32	NC_022610	ATC	2	6	2763	2768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554652315
33	NC_022610	TAA	2	6	2782	2787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554652315
34	NC_022610	GAA	2	6	2813	2818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554652315
35	NC_022610	CAA	2	6	2825	2830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554652315
36	NC_022610	ATT	2	6	2873	2878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554652315
37	NC_022610	TTA	2	6	2929	2934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554652315
38	NC_022610	AGA	2	6	2941	2946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554652315
39	NC_022610	GAA	2	6	3062	3067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554652315
40	NC_022610	AAT	2	6	3123	3128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554652315
41	NC_022610	TGG	2	6	3268	3273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	554652316
42	NC_022610	TGA	2	6	3343	3348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554652316
43	NC_022610	GAA	3	9	3365	3373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554652316
44	NC_022610	ATT	3	9	3417	3425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554652316
45	NC_022610	AAT	2	6	3504	3509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554652317
46	NC_022610	TTA	2	6	3511	3516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554652317
47	NC_022610	ATT	2	6	3582	3587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554652317
48	NC_022610	AAT	2	6	3592	3597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554652317
49	NC_022610	GTT	2	6	4330	4335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554652318
50	NC_022610	AAT	2	6	4357	4362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554652318
51	NC_022610	GAT	3	9	4461	4469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554652319
52	NC_022610	GAA	2	6	4482	4487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554652319
53	NC_022610	GAC	2	6	4518	4523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554652319
54	NC_022610	GAA	2	6	4556	4561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554652319
55	NC_022610	CTG	2	6	4768	4773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554652320
56	NC_022610	TTA	2	6	4803	4808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554652320
57	NC_022610	TTA	2	6	4815	4820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554652320
58	NC_022610	TAT	2	6	4889	4894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554652320
59	NC_022610	ATA	2	6	5115	5120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554652321
60	NC_022610	TCT	2	6	5202	5207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554652321
61	NC_022610	TTG	2	6	5256	5261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554652321
62	NC_022610	TAT	2	6	5287	5292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554652321
63	NC_022610	TTA	3	9	5313	5321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554652321
64	NC_022610	AGA	2	6	5455	5460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554652322
65	NC_022610	TGA	2	6	5503	5508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554652322
66	NC_022610	GAA	2	6	5509	5514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554652322
67	NC_022610	AGA	2	6	5542	5547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554652322
68	NC_022610	CAT	2	6	5606	5611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554652322
69	NC_022610	ATT	2	6	5670	5675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554652322
70	NC_022610	TTA	2	6	5676	5681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554652322
71	NC_022610	ATA	2	6	5931	5936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554652323
72	NC_022610	CTA	2	6	5937	5942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554652323
73	NC_022610	ATA	2	6	5964	5969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554652323
74	NC_022610	AAC	2	6	6000	6005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554652323
75	NC_022610	ATA	2	6	7095	7100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554652324
76	NC_022610	CTT	2	6	7148	7153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554652324
77	NC_022610	TCA	2	6	7171	7176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554652324
78	NC_022610	CCA	2	6	7246	7251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	554652324
79	NC_022610	TTC	2	6	7479	7484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554652324
80	NC_022610	CAT	2	6	7565	7570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554652324
81	NC_022610	TTA	2	6	7573	7578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554652324
82	NC_022610	CAA	2	6	7607	7612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554652324
83	NC_022610	CTT	2	6	7760	7765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554652324
84	NC_022610	ATT	2	6	8035	8040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554652325
85	NC_022610	CTA	2	6	8087	8092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554652325
86	NC_022610	TCA	2	6	8156	8161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554652325
87	NC_022610	CAA	2	6	8164	8169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554652325
88	NC_022610	GAA	2	6	8216	8221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554652325
89	NC_022610	TTA	2	6	8237	8242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554652325
90	NC_022610	ATT	2	6	8290	8295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554652325
91	NC_022610	TTA	2	6	8377	8382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554652325
92	NC_022610	TTA	2	6	8389	8394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554652325
93	NC_022610	AAT	2	6	8517	8522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554652325
94	NC_022610	ATC	2	6	8536	8541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554652325
95	NC_022610	TTC	2	6	8647	8652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554652325
96	NC_022610	CAT	2	6	8687	8692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554652325
97	NC_022610	TTC	2	6	9820	9825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554652326
98	NC_022610	TGT	2	6	9912	9917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554652326
99	NC_022610	ATT	2	6	9932	9937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554652326
100	NC_022610	ATA	2	6	9983	9988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554652326
101	NC_022610	TTA	2	6	9989	9994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554652326
102	NC_022610	AAT	2	6	10073	10078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554652326
103	NC_022610	ATT	2	6	10105	10110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554652326
104	NC_022610	TTA	2	6	10128	10133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554652326
105	NC_022610	TAT	2	6	10174	10179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554652326
106	NC_022610	ATT	3	9	10223	10231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554652326
107	NC_022610	ATA	2	6	10289	10294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554652326
108	NC_022610	GAA	2	6	10371	10376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554652327
109	NC_022610	ATT	3	9	10425	10433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554652327
110	NC_022610	TGC	2	6	10458	10463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554652327
111	NC_022610	GTT	2	6	10477	10482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554652327
112	NC_022610	GAT	2	6	10561	10566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554652327
113	NC_022610	ATG	2	6	10622	10627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554652327
114	NC_022610	AAG	2	6	10643	10648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554652327
115	NC_022610	TTC	2	6	10659	10664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554652327
116	NC_022610	TAA	2	6	10674	10679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554652327
117	NC_022610	CTT	2	6	10760	10765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554652327
118	NC_022610	TGG	2	6	10773	10778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	554652327
119	NC_022610	AAG	2	6	10929	10934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554652327
120	NC_022610	CTA	2	6	11843	11848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554652328
121	NC_022610	GTG	2	6	11899	11904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	554652328
122	NC_022610	TCA	2	6	11912	11917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554652328
123	NC_022610	GAA	2	6	11972	11977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554652328
124	NC_022610	TTA	2	6	11993	11998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554652328
125	NC_022610	TGA	2	6	12011	12016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554652328
126	NC_022610	CAT	2	6	12443	12448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554652328
127	NC_022610	ACC	2	6	12621	12626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	554652329
128	NC_022610	CAA	2	6	12677	12682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554652329
129	NC_022610	ATG	2	6	12821	12826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554652329
130	NC_022610	ATA	2	6	13058	13063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554652329
131	NC_022610	ACA	2	6	13299	13304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554652330
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.