MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus Z172 plasmid pZ172_1

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022610	GA	3	6	343	348	50 %	0 %	50 %	0 %	554652312
2	NC_022610	TA	3	6	664	669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022610	TA	3	6	919	924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022610	CT	3	6	1036	1041	0 %	50 %	0 %	50 %	554652314
5	NC_022610	TC	3	6	1063	1068	0 %	50 %	0 %	50 %	554652314
6	NC_022610	AT	3	6	1399	1404	50 %	50 %	0 %	0 %	554652314
7	NC_022610	TA	3	6	1501	1506	50 %	50 %	0 %	0 %	554652314
8	NC_022610	AT	3	6	1658	1663	50 %	50 %	0 %	0 %	554652314
9	NC_022610	TA	3	6	1953	1958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022610	TA	3	6	2060	2065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022610	AT	4	8	2085	2092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022610	TA	3	6	2672	2677	50 %	50 %	0 %	0 %	554652315
13	NC_022610	AT	3	6	3686	3691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022610	AT	3	6	4008	4013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022610	TA	4	8	4277	4284	50 %	50 %	0 %	0 %	554652318
16	NC_022610	AG	3	6	5028	5033	50 %	0 %	50 %	0 %	554652320
17	NC_022610	TA	3	6	5294	5299	50 %	50 %	0 %	0 %	554652321
18	NC_022610	TG	3	6	5553	5558	0 %	50 %	50 %	0 %	554652322
19	NC_022610	TA	3	6	5622	5627	50 %	50 %	0 %	0 %	554652322
20	NC_022610	AG	3	6	5696	5701	50 %	0 %	50 %	0 %	554652322
21	NC_022610	TA	3	6	5768	5773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022610	GA	3	6	6013	6018	50 %	0 %	50 %	0 %	554652323
23	NC_022610	TA	3	6	6173	6178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022610	AT	3	6	6698	6703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022610	TA	3	6	7491	7496	50 %	50 %	0 %	0 %	554652324
26	NC_022610	AT	3	6	8119	8124	50 %	50 %	0 %	0 %	554652325
27	NC_022610	GA	3	6	8135	8140	50 %	0 %	50 %	0 %	554652325
28	NC_022610	TA	3	6	8626	8631	50 %	50 %	0 %	0 %	554652325
29	NC_022610	TA	3	6	9481	9486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022610	TA	3	6	9549	9554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022610	GA	3	6	9779	9784	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022610	TA	3	6	10312	10317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022610	AT	3	6	10536	10541	50 %	50 %	0 %	0 %	554652327
34	NC_022610	GA	3	6	11122	11127	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022610	AT	3	6	11162	11167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022610	TA	3	6	11337	11342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022610	TC	3	6	11412	11417	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_022610	AG	3	6	11437	11442	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022610	AT	3	6	11875	11880	50 %	50 %	0 %	0 %	554652328
40	NC_022610	TA	3	6	12382	12387	50 %	50 %	0 %	0 %	554652328
41	NC_022610	TA	3	6	12731	12736	50 %	50 %	0 %	0 %	554652329
42	NC_022610	GT	3	6	13631	13636	0 %	50 %	50 %	0 %	554652330
43	NC_022610	AT	3	6	14514	14519	50 %	50 %	0 %	0 %	554652331
44	NC_022610	TA	3	6	15123	15128	50 %	50 %	0 %	0 %	554652331
45	NC_022610	CT	3	6	15751	15756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_022610	TA	3	6	17172	17177	50 %	50 %	0 %	0 %	554652333
47	NC_022610	TC	3	6	17550	17555	0 %	50 %	0 %	50 %	554652334
48	NC_022610	AT	3	6	17661	17666	50 %	50 %	0 %	0 %	554652334
49	NC_022610	TG	3	6	18091	18096	0 %	50 %	50 %	0 %	554652335
50	NC_022610	AT	3	6	18970	18975	50 %	50 %	0 %	0 %	554652336
51	NC_022610	TA	3	6	19477	19482	50 %	50 %	0 %	0 %	554652336
52	NC_022610	AC	3	6	20789	20794	50 %	0 %	0 %	50 %	554652337
53	NC_022610	GC	3	6	21016	21021	0 %	0 %	50 %	50 %	554652337
54	NC_022610	AC	3	6	21200	21205	50 %	0 %	0 %	50 %	554652337
55	NC_022610	AC	3	6	22160	22165	50 %	0 %	0 %	50 %	554652338
56	NC_022610	CT	3	6	22573	22578	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_022610	TA	5	10	22588	22597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022610	TA	3	6	22688	22693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022610	AC	3	6	23322	23327	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_022610	AG	3	6	23779	23784	50 %	0 %	50 %	0 %	554652340
61	NC_022610	TA	3	6	23841	23846	50 %	50 %	0 %	0 %	554652340
62	NC_022610	TC	3	6	24047	24052	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_022610	TA	3	6	24137	24142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022610	AT	3	6	24173	24178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022610	AG	3	6	24813	24818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022610	CT	3	6	24831	24836	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_022610	AT	5	10	24914	24923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022610	GA	3	6	24955	24960	50 %	0 %	50 %	0 %	554652343
69	NC_022610	TA	3	6	25121	25126	50 %	50 %	0 %	0 %	554652343
70	NC_022610	TA	3	6	25246	25251	50 %	50 %	0 %	0 %	554652343
71	NC_022610	AG	3	6	25808	25813	50 %	0 %	50 %	0 %	554652344
72	NC_022610	AT	3	6	25851	25856	50 %	50 %	0 %	0 %	554652344
73	NC_022610	CT	3	6	25858	25863	0 %	50 %	0 %	50 %	554652344
74	NC_022610	AT	3	6	27223	27228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.