MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Carnobacterium sp. WN1359 plasmid pWNCR9

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022608	TGTT	2	8	45	52	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022608	TTTC	2	8	179	186	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_022608	AGGT	2	8	883	890	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022608	ATGA	2	8	949	956	50 %	25 %	25 %	0 %	554651121
5	NC_022608	TAAA	2	8	959	966	75 %	25 %	0 %	0 %	554651121
6	NC_022608	CTTT	2	8	1152	1159	0 %	75 %	0 %	25 %	554651121
7	NC_022608	GAAA	2	8	1237	1244	75 %	0 %	25 %	0 %	554651121
8	NC_022608	GTTT	2	8	1414	1421	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022608	ATTT	2	8	1558	1565	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022608	AGGC	2	8	1822	1829	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_022608	AATT	2	8	2865	2872	50 %	50 %	0 %	0 %	554651122
12	NC_022608	ATAG	2	8	3012	3019	50 %	25 %	25 %	0 %	554651122
13	NC_022608	AAGT	2	8	3150	3157	50 %	25 %	25 %	0 %	554651113
14	NC_022608	TTTA	2	8	3172	3179	25 %	75 %	0 %	0 %	554651113
15	NC_022608	AGTA	2	8	4901	4908	50 %	25 %	25 %	0 %	554651124
16	NC_022608	TTAT	2	8	5177	5184	25 %	75 %	0 %	0 %	554651125
17	NC_022608	TAAA	2	8	6065	6072	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022608	TAAA	2	8	6191	6198	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022608	GTAG	2	8	6246	6253	25 %	25 %	50 %	0 %	554651114
20	NC_022608	TAAT	2	8	6394	6401	50 %	50 %	0 %	0 %	554651114
21	NC_022608	GCAC	2	8	7215	7222	25 %	0 %	25 %	50 %	554651115
22	NC_022608	TAGT	2	8	7656	7663	25 %	50 %	25 %	0 %	554651126
23	NC_022608	GGTT	2	8	7664	7671	0 %	50 %	50 %	0 %	554651126
24	NC_022608	TTAC	2	8	7734	7741	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_022608	AACA	2	8	8081	8088	75 %	0 %	0 %	25 %	554651116
26	NC_022608	AATT	2	8	8603	8610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022608	GATT	2	8	8821	8828	25 %	50 %	25 %	0 %	554651118
28	NC_022608	ACTA	2	8	8981	8988	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_022608	GTAT	2	8	9058	9065	25 %	50 %	25 %	0 %	554651119
30	NC_022608	TCCT	2	8	9259	9266	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_022608	CTTA	2	8	9405	9412	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.