MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Carnobacterium sp. WN1359 plasmid pWNCR9

Total Repeats: 125

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022608	GCT	2	6	31	36	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_022608	GAA	2	6	103	108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022608	TAA	2	6	159	164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022608	ACT	2	6	205	210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_022608	GCA	2	6	214	219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_022608	TCA	2	6	384	389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_022608	AGG	2	6	575	580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022608	AGC	2	6	645	650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554651120
9	NC_022608	TAA	2	6	669	674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651120
10	NC_022608	AGA	2	6	840	845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554651120
11	NC_022608	GAA	2	6	973	978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554651121
12	NC_022608	AAT	2	6	997	1002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651121
13	NC_022608	TTA	2	6	1012	1017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651121
14	NC_022608	AAT	2	6	1283	1288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022608	GTC	2	6	1430	1435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_022608	AAT	2	6	1500	1505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022608	TAA	2	6	1615	1620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022608	TCA	2	6	1650	1655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_022608	TTA	2	6	1761	1766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022608	CTT	2	6	1816	1821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_022608	CGC	2	6	1912	1917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_022608	TGT	2	6	1966	1971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022608	GGT	2	6	2006	2011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022608	ACA	2	6	2088	2093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_022608	ATT	2	6	2202	2207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022608	CAG	2	6	2262	2267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_022608	CAT	2	6	2650	2655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554651122
28	NC_022608	ACA	2	6	2775	2780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554651122
29	NC_022608	CAG	2	6	2879	2884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554651122
30	NC_022608	GAA	2	6	3052	3057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554651113
31	NC_022608	TAA	2	6	3064	3069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651113
32	NC_022608	ATT	2	6	3070	3075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651113
33	NC_022608	ATT	2	6	3120	3125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651113
34	NC_022608	AAT	2	6	3259	3264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651113
35	NC_022608	TTA	3	9	3266	3274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651113
36	NC_022608	TGG	2	6	3292	3297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	554651113
37	NC_022608	ATT	2	6	3358	3363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651113
38	NC_022608	TCA	2	6	3462	3467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_022608	AGG	2	6	3577	3582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022608	ATT	2	6	3608	3613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022608	TTA	2	6	3630	3635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022608	AAC	2	6	3889	3894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554651123
43	NC_022608	TCT	2	6	3940	3945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554651123
44	NC_022608	ATT	2	6	4092	4097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651123
45	NC_022608	ACA	2	6	4128	4133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554651123
46	NC_022608	ATT	2	6	4136	4141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651123
47	NC_022608	TAT	2	6	4175	4180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651123
48	NC_022608	GAA	2	6	4183	4188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554651123
49	NC_022608	ATG	2	6	4262	4267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554651124
50	NC_022608	TTG	2	6	4282	4287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554651124
51	NC_022608	CTG	3	9	4444	4452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554651124
52	NC_022608	TTG	2	6	4495	4500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554651124
53	NC_022608	TAT	2	6	4525	4530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651124
54	NC_022608	ATT	2	6	4533	4538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651124
55	NC_022608	TCT	2	6	4731	4736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554651124
56	NC_022608	TCT	2	6	4755	4760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554651124
57	NC_022608	TCT	2	6	4776	4781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554651124
58	NC_022608	TTC	2	6	4916	4921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554651124
59	NC_022608	TTC	2	6	4967	4972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554651124
60	NC_022608	TTC	2	6	4979	4984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554651124
61	NC_022608	CTT	2	6	4993	4998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554651124
62	NC_022608	TAA	2	6	5083	5088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651124
63	NC_022608	TAA	2	6	5148	5153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022608	AAG	2	6	5214	5219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554651125
65	NC_022608	GCA	2	6	5378	5383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554651125
66	NC_022608	TAT	2	6	5394	5399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651125
67	NC_022608	ATC	2	6	5431	5436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554651125
68	NC_022608	ATA	2	6	5468	5473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651125
69	NC_022608	ACA	3	9	5546	5554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554651125
70	NC_022608	ATT	2	6	5561	5566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651125
71	NC_022608	ATT	2	6	5593	5598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651125
72	NC_022608	TGT	2	6	5606	5611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554651125
73	NC_022608	ATT	2	6	5671	5676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651125
74	NC_022608	AAT	2	6	5716	5721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651125
75	NC_022608	TTA	2	6	5769	5774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651125
76	NC_022608	TAA	2	6	5788	5793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651125
77	NC_022608	CCT	2	6	5825	5830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_022608	CCT	2	6	5835	5840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_022608	ATA	2	6	5844	5849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022608	TAT	2	6	5850	5855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022608	AAT	2	6	5960	5965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022608	TTA	2	6	6008	6013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022608	TTG	2	6	6049	6054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022608	CTT	2	6	6076	6081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_022608	ATG	2	6	6083	6088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022608	ATA	2	6	6234	6239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651114
87	NC_022608	TAC	2	6	6303	6308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554651114
88	NC_022608	ATT	2	6	6321	6326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651114
89	NC_022608	GAA	2	6	6366	6371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554651114
90	NC_022608	TAA	2	6	6617	6622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651114
91	NC_022608	TAA	2	6	6626	6631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651114
92	NC_022608	TAA	2	6	6788	6793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022608	CAA	2	6	6866	6871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554651115
94	NC_022608	TCG	2	6	7023	7028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554651115
95	NC_022608	AGT	2	6	7064	7069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554651115
96	NC_022608	ATT	2	6	7116	7121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651115
97	NC_022608	AGC	2	6	7301	7306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554651115
98	NC_022608	ATT	2	6	7360	7365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651115
99	NC_022608	AGG	2	6	7444	7449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022608	CTG	2	6	7470	7475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554651126
101	NC_022608	TAT	2	6	7515	7520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651126
102	NC_022608	TTC	2	6	7616	7621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554651126
103	NC_022608	TAA	2	6	7626	7631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651126
104	NC_022608	CAT	2	6	7633	7638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554651126
105	NC_022608	TAT	2	6	7700	7705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022608	ATT	2	6	7788	7793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022608	TAT	2	6	7806	7811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022608	GGA	2	6	7877	7882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022608	TAT	2	6	7921	7926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651116
110	NC_022608	CTG	2	6	8160	8165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554651116
111	NC_022608	GCA	2	6	8198	8203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554651116
112	NC_022608	GTA	2	6	8238	8243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554651117
113	NC_022608	ATG	2	6	8302	8307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554651117
114	NC_022608	TTA	2	6	8542	8547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022608	TAA	2	6	8566	8571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022608	ACT	2	6	8629	8634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_022608	GAA	2	6	8747	8752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554651118
118	NC_022608	AAT	2	6	8879	8884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651118
119	NC_022608	TAA	2	6	8968	8973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651118
120	NC_022608	AAT	2	6	9041	9046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651119
121	NC_022608	CTT	3	9	9082	9090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554651119
122	NC_022608	TAA	2	6	9152	9157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651119
123	NC_022608	AAT	2	6	9206	9211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651119
124	NC_022608	ATT	2	6	9338	9343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022608	GAT	2	6	9582	9587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.