MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Carnobacterium sp. WN1359 plasmid pWNCR9

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022608	AGC	2	6	645	650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554651120
2	NC_022608	TAA	2	6	669	674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651120
3	NC_022608	AGA	2	6	840	845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554651120
4	NC_022608	GAA	2	6	973	978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554651121
5	NC_022608	AAT	2	6	997	1002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651121
6	NC_022608	TTA	2	6	1012	1017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651121
7	NC_022608	CAT	2	6	2650	2655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554651122
8	NC_022608	ACA	2	6	2775	2780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554651122
9	NC_022608	CAG	2	6	2879	2884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554651122
10	NC_022608	GAA	2	6	3052	3057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554651113
11	NC_022608	TAA	2	6	3064	3069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651113
12	NC_022608	ATT	2	6	3070	3075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651113
13	NC_022608	ATT	2	6	3120	3125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651113
14	NC_022608	AAT	2	6	3259	3264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651113
15	NC_022608	TTA	3	9	3266	3274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651113
16	NC_022608	TGG	2	6	3292	3297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	554651113
17	NC_022608	ATT	2	6	3358	3363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651113
18	NC_022608	AAC	2	6	3889	3894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554651123
19	NC_022608	TCT	2	6	3940	3945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554651123
20	NC_022608	ATT	2	6	4092	4097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651123
21	NC_022608	ACA	2	6	4128	4133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554651123
22	NC_022608	ATT	2	6	4136	4141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651123
23	NC_022608	TAT	2	6	4175	4180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651123
24	NC_022608	GAA	2	6	4183	4188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554651123
25	NC_022608	ATG	2	6	4262	4267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554651124
26	NC_022608	TTG	2	6	4282	4287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554651124
27	NC_022608	CTG	3	9	4444	4452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554651124
28	NC_022608	TTG	2	6	4495	4500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554651124
29	NC_022608	TAT	2	6	4525	4530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651124
30	NC_022608	ATT	2	6	4533	4538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651124
31	NC_022608	TCT	2	6	4731	4736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554651124
32	NC_022608	TCT	2	6	4755	4760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554651124
33	NC_022608	TCT	2	6	4776	4781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554651124
34	NC_022608	TTC	2	6	4916	4921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554651124
35	NC_022608	TTC	2	6	4967	4972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554651124
36	NC_022608	TTC	2	6	4979	4984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554651124
37	NC_022608	CTT	2	6	4993	4998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554651124
38	NC_022608	TAA	2	6	5083	5088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651124
39	NC_022608	AAG	2	6	5214	5219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554651125
40	NC_022608	GCA	2	6	5378	5383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554651125
41	NC_022608	TAT	2	6	5394	5399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651125
42	NC_022608	ATC	2	6	5431	5436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554651125
43	NC_022608	ATA	2	6	5468	5473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651125
44	NC_022608	ACA	3	9	5546	5554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554651125
45	NC_022608	ATT	2	6	5561	5566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651125
46	NC_022608	ATT	2	6	5593	5598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651125
47	NC_022608	TGT	2	6	5606	5611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554651125
48	NC_022608	ATT	2	6	5671	5676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651125
49	NC_022608	AAT	2	6	5716	5721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651125
50	NC_022608	TTA	2	6	5769	5774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651125
51	NC_022608	TAA	2	6	5788	5793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651125
52	NC_022608	ATA	2	6	6234	6239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651114
53	NC_022608	TAC	2	6	6303	6308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554651114
54	NC_022608	ATT	2	6	6321	6326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651114
55	NC_022608	GAA	2	6	6366	6371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554651114
56	NC_022608	TAA	2	6	6617	6622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651114
57	NC_022608	TAA	2	6	6626	6631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651114
58	NC_022608	CAA	2	6	6866	6871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554651115
59	NC_022608	TCG	2	6	7023	7028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554651115
60	NC_022608	AGT	2	6	7064	7069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554651115
61	NC_022608	ATT	2	6	7116	7121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651115
62	NC_022608	AGC	2	6	7301	7306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554651115
63	NC_022608	ATT	2	6	7360	7365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651115
64	NC_022608	CTG	2	6	7470	7475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554651126
65	NC_022608	TAT	2	6	7515	7520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651126
66	NC_022608	TTC	2	6	7616	7621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554651126
67	NC_022608	TAA	2	6	7626	7631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651126
68	NC_022608	CAT	2	6	7633	7638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554651126
69	NC_022608	TAT	2	6	7921	7926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651116
70	NC_022608	CTG	2	6	8160	8165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554651116
71	NC_022608	GCA	2	6	8198	8203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554651116
72	NC_022608	GTA	2	6	8238	8243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554651117
73	NC_022608	ATG	2	6	8302	8307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554651117
74	NC_022608	GAA	2	6	8747	8752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554651118
75	NC_022608	AAT	2	6	8879	8884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651118
76	NC_022608	TAA	2	6	8968	8973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651118
77	NC_022608	AAT	2	6	9041	9046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651119
78	NC_022608	CTT	3	9	9082	9090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554651119
79	NC_022608	TAA	2	6	9152	9157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651119
80	NC_022608	AAT	2	6	9206	9211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651119

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.