MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Carnobacterium sp. WN1359 plasmid pWNCR15

Total Repeats: 182

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022607	CAA	2	6	84	89	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_022607	TGT	2	6	124	129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022607	CTT	2	6	167	172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_022607	AAT	2	6	352	357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022607	TAA	2	6	406	411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022607	AAT	2	6	472	477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022607	TAT	2	6	513	518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022607	CTT	2	6	563	568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_022607	CAT	2	6	811	816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554650831
10	NC_022607	AAT	2	6	869	874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554650831
11	NC_022607	GAT	2	6	1037	1042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554650831
12	NC_022607	AGG	2	6	1134	1139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022607	AAT	2	6	1276	1281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554650832
14	NC_022607	CAT	2	6	1531	1536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554650832
15	NC_022607	GCA	2	6	1550	1555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554650832
16	NC_022607	TAA	2	6	1816	1821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554650832
17	NC_022607	GAA	2	6	1874	1879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650832
18	NC_022607	CAA	2	6	1911	1916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554650832
19	NC_022607	AGA	2	6	1942	1947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650832
20	NC_022607	GTT	2	6	2266	2271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022607	TCT	2	6	2279	2284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_022607	ATT	2	6	2315	2320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554650833
23	NC_022607	CTA	2	6	2352	2357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554650833
24	NC_022607	TTG	2	6	2395	2400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554650833
25	NC_022607	TTC	2	6	2428	2433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554650833
26	NC_022607	ATC	2	6	2497	2502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554650833
27	NC_022607	TAA	2	6	2533	2538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554650833
28	NC_022607	CTT	2	6	2616	2621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554650833
29	NC_022607	TCA	2	6	2726	2731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554650833
30	NC_022607	TTC	2	6	2734	2739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554650833
31	NC_022607	GAA	2	6	2796	2801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650833
32	NC_022607	CTT	2	6	2886	2891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554650833
33	NC_022607	ATT	2	6	2902	2907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554650833
34	NC_022607	GAA	2	6	3043	3048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650833
35	NC_022607	TTC	2	6	3049	3054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554650833
36	NC_022607	ATC	2	6	3103	3108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554650833
37	NC_022607	AGA	2	6	3237	3242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650833
38	NC_022607	TTC	2	6	3274	3279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554650833
39	NC_022607	TCA	3	9	3296	3304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554650833
40	NC_022607	AAG	2	6	3305	3310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650833
41	NC_022607	TAT	2	6	3336	3341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554650833
42	NC_022607	CTA	2	6	3492	3497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554650833
43	NC_022607	GTT	2	6	3568	3573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554650833
44	NC_022607	TCT	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554650833
45	NC_022607	TTG	2	6	3649	3654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554650833
46	NC_022607	TAA	2	6	3704	3709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554650833
47	NC_022607	TCA	2	6	3770	3775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554650833
48	NC_022607	GTT	2	6	3793	3798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554650833
49	NC_022607	AAG	2	6	3830	3835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650833
50	NC_022607	AAT	2	6	3884	3889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554650833
51	NC_022607	AGT	2	6	3946	3951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554650833
52	NC_022607	TGC	2	6	3952	3957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554650833
53	NC_022607	TAT	2	6	4123	4128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554650833
54	NC_022607	GTA	2	6	4162	4167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554650833
55	NC_022607	ACA	2	6	4208	4213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554650833
56	NC_022607	GAA	2	6	4315	4320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650833
57	NC_022607	CCT	2	6	4448	4453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_022607	TGC	2	6	4551	4556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_022607	GTG	2	6	4613	4618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022607	TAA	2	6	4906	4911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022607	TAT	2	6	4946	4951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022607	TTG	2	6	4967	4972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022607	ATT	2	6	4976	4981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022607	ATC	2	6	5022	5027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554650841
65	NC_022607	CTT	2	6	5101	5106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554650841
66	NC_022607	CAA	2	6	5113	5118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554650841
67	NC_022607	GCA	2	6	5133	5138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554650841
68	NC_022607	TAT	2	6	5192	5197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554650841
69	NC_022607	GTA	2	6	5235	5240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554650841
70	NC_022607	CTG	2	6	5287	5292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554650842
71	NC_022607	TAA	2	6	5442	5447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022607	GTA	2	6	5519	5524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022607	ACC	2	6	5550	5555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	554650843
74	NC_022607	AGC	2	6	5571	5576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554650843
75	NC_022607	AGC	2	6	5645	5650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554650843
76	NC_022607	ACC	2	6	5660	5665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	554650843
77	NC_022607	CTC	2	6	5824	5829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_022607	TAT	2	6	5865	5870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022607	GTG	2	6	6014	6019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022607	TAG	2	6	6126	6131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022607	ACG	2	6	6205	6210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_022607	TTC	2	6	6412	6417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_022607	AAT	2	6	6509	6514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022607	TTG	2	6	6621	6626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022607	ATT	2	6	6652	6657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022607	TTG	2	6	6806	6811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554650834
87	NC_022607	CCA	2	6	6832	6837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	554650834
88	NC_022607	GAT	2	6	6856	6861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554650834
89	NC_022607	AAT	2	6	6928	6933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554650834
90	NC_022607	TAT	2	6	6939	6944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554650834
91	NC_022607	AGA	2	6	7162	7167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650835
92	NC_022607	GTT	2	6	7316	7321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554650835
93	NC_022607	TAG	3	9	7388	7396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022607	TAC	2	6	7465	7470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_022607	GAT	2	6	7647	7652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022607	GCC	2	6	7759	7764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_022607	GAG	2	6	7781	7786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022607	CGG	2	6	7880	7885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_022607	AGC	2	6	7909	7914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_022607	TGT	2	6	7958	7963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022607	GAA	2	6	8249	8254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650836
102	NC_022607	CAA	2	6	8315	8320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554650836
103	NC_022607	CAA	2	6	8470	8475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554650836
104	NC_022607	AAC	2	6	8511	8516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554650836
105	NC_022607	AGC	2	6	8676	8681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554650844
106	NC_022607	TCC	2	6	8946	8951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	554650844
107	NC_022607	CAT	2	6	9312	9317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554650844
108	NC_022607	AAC	2	6	9359	9364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554650844
109	NC_022607	GCA	2	6	9371	9376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554650844
110	NC_022607	ATC	2	6	9534	9539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_022607	ACA	2	6	9604	9609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554650845
112	NC_022607	GCA	2	6	9718	9723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554650845
113	NC_022607	CAA	2	6	9731	9736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554650845
114	NC_022607	ATT	2	6	9856	9861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554650846
115	NC_022607	GTG	2	6	9955	9960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	554650846
116	NC_022607	CTT	2	6	10002	10007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554650846
117	NC_022607	TGC	2	6	10026	10031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554650846
118	NC_022607	TTA	2	6	10034	10039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554650846
119	NC_022607	CAA	3	9	10097	10105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554650846
120	NC_022607	GAA	2	6	10154	10159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650846
121	NC_022607	GCT	2	6	10190	10195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554650846
122	NC_022607	GTT	2	6	10226	10231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554650846
123	NC_022607	TTA	2	6	10254	10259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554650846
124	NC_022607	AGA	2	6	10261	10266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650846
125	NC_022607	CAA	2	6	10283	10288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554650846
126	NC_022607	AGA	2	6	10321	10326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650846
127	NC_022607	AAT	2	6	10408	10413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022607	GCT	2	6	10479	10484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_022607	TTA	2	6	10545	10550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022607	ATA	2	6	10749	10754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022607	ATA	2	6	10884	10889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554650837
132	NC_022607	GAT	2	6	10970	10975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554650837
133	NC_022607	GAA	2	6	11043	11048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650837
134	NC_022607	AAG	2	6	11064	11069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554650837
135	NC_022607	TAA	2	6	11086	11091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554650837
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.