MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Carnobacterium sp. WN1359

Total Repeats: 942

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022606	ATAAAA	2	12	2678	2689	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	554648464
2	NC_022606	ACAAGC	2	12	7634	7645	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	554648468
3	NC_022606	TGAAGA	2	12	7862	7873	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	554648468
4	NC_022606	TGCAGT	2	12	10883	10894	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	554648472
5	NC_022606	GCTGTC	2	12	13507	13518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554648474
6	NC_022606	GATGAC	2	12	14452	14463	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	554648474
7	NC_022606	AAGGAA	2	12	14841	14852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554648475
8	NC_022606	GTCTCT	2	12	17484	17495	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	554648477
9	NC_022606	TGAATT	2	12	24608	24619	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	554648485
10	NC_022606	AATGAT	2	12	25191	25202	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	554648486
11	NC_022606	GAAAAT	2	12	28158	28169	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	554648488
12	NC_022606	CAATAC	2	12	30247	30258	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	554648490
13	NC_022606	GAAATT	2	12	31265	31276	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	554648490
14	NC_022606	TAAAAA	2	12	31424	31435	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022606	AAAGAA	2	12	31941	31952	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	554648492
16	NC_022606	TAAAAA	2	12	33112	33123	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022606	TCAAAG	2	12	35330	35341	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	554648496
18	NC_022606	AACTGC	2	12	36082	36093	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	554648497
19	NC_022606	ATATTA	2	12	37574	37585	50 %	50 %	0 %	0 %	554648498
20	NC_022606	TAAAAA	2	12	38238	38249	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022606	TTTATC	2	12	41441	41452	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	554648502
22	NC_022606	ATTTCA	2	12	42082	42093	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	554648503
23	NC_022606	CAGCTT	2	12	43645	43656	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	554648504
24	NC_022606	AAAGCA	2	12	51684	51695	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	554648510
25	NC_022606	TACCAT	2	12	76153	76164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554648531
26	NC_022606	TGAAAA	2	12	79087	79098	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022606	AGAGAT	2	12	79920	79931	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	554648534
28	NC_022606	TTATTT	2	12	86410	86421	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022606	TTCTGG	2	12	89933	89944	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	554648542
30	NC_022606	GCATTG	2	12	91511	91522	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	554648544
31	NC_022606	ATACGC	2	12	97123	97134	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	554648549
32	NC_022606	AAAAGG	2	12	98143	98154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554648550
33	NC_022606	TGGGAA	2	12	99844	99855	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	554648553
34	NC_022606	CAGAAA	2	12	101176	101187	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	554648554
35	NC_022606	AAAATC	2	12	101537	101548	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_022606	GGAAAT	2	12	102125	102136	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	554648555
37	NC_022606	CATGAT	2	12	103430	103441	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	554650439
38	NC_022606	TCTACG	2	12	103831	103842	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	554648556
39	NC_022606	TACAAG	2	12	106305	106316	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	554648558
40	NC_022606	AAATAA	2	12	110417	110428	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	554648561
41	NC_022606	TATCGA	2	12	111327	111338	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	554648562
42	NC_022606	ATTGTG	2	12	113138	113149	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	554648564
43	NC_022606	ACTTGA	2	12	114112	114123	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	554648564
44	NC_022606	ATAGCA	2	12	120246	120257	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	554648569
45	NC_022606	ATAACT	2	12	125728	125739	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	554648573
46	NC_022606	TGGAAG	2	12	135330	135341	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022606	CAAAAA	2	12	135683	135694	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_022606	GGCTAT	2	12	137364	137375	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	554648578
49	NC_022606	TGGAAG	2	12	148337	148348	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022606	AAATGA	2	12	150197	150208	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	554648582
51	NC_022606	TCCAAT	2	12	156650	156661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554648587
52	NC_022606	TAGGAG	2	12	157108	157119	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	554648588
53	NC_022606	CATGAT	2	12	157512	157523	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	554648588
54	NC_022606	AAGCAA	2	12	160723	160734	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	554648591
55	NC_022606	CAAAAC	2	12	163347	163358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554648594
56	NC_022606	TCGTCC	2	12	164234	164245	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	554648595
57	NC_022606	CATCAG	2	12	167527	167538	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	554648597
58	NC_022606	ATGAAA	2	12	169029	169040	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	554648599
59	NC_022606	TAGCAA	2	12	171666	171677	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	554648602
60	NC_022606	ACAGCA	3	18	175486	175503	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	554648604
61	NC_022606	TAAAAG	2	12	177906	177917	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	554648608
62	NC_022606	AGCAGA	2	12	178192	178203	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	554648608
63	NC_022606	AATAAA	2	12	182155	182166	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022606	TTTTAT	2	12	184323	184334	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	554648617
65	NC_022606	TCATTT	2	12	191336	191347	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	554648623
66	NC_022606	TTATCT	2	12	200729	200740	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	554648629
67	NC_022606	TGGTGA	2	12	202212	202223	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	554648631
68	NC_022606	GAAGGT	2	12	204882	204893	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022606	TTACAC	2	12	209929	209940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554648639
70	NC_022606	TAAACT	2	12	210339	210350	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	554648640
71	NC_022606	ATGAAG	2	12	210492	210503	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	554648640
72	NC_022606	GAGGAC	2	12	210791	210802	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	554648640
73	NC_022606	CGTCAC	2	12	212453	212464	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	554648641
74	NC_022606	TCAACA	2	12	212881	212892	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	554648642
75	NC_022606	AAATAA	2	12	213909	213920	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022606	GTAGAA	2	12	215094	215105	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	554648643
77	NC_022606	TTATTT	2	12	217192	217203	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022606	TATGAT	2	12	219105	219116	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	554648647
79	NC_022606	TCAATT	2	12	220490	220501	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	554648648
80	NC_022606	AAAATA	2	12	223845	223856	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022606	TGGAAG	2	12	232829	232840	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022606	ATTAAA	2	12	233539	233550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554648657
83	NC_022606	ATCATA	2	12	235950	235961	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	554648659
84	NC_022606	AAGCTG	2	12	237441	237452	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	554650441
85	NC_022606	TCAAGT	2	12	237653	237664	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	554650441
86	NC_022606	GATGGA	2	12	238586	238597	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	554648660
87	NC_022606	CTATGG	2	12	240757	240768	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	554648661
88	NC_022606	TTATTT	2	12	240961	240972	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	554648661
89	NC_022606	AATCGC	2	12	241572	241583	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	554648662
90	NC_022606	TAAAGA	2	12	247514	247525	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	554648665
91	NC_022606	TGGAAA	2	12	259688	259699	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	554648675
92	NC_022606	GAAAAG	2	12	263785	263796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022606	ACCGAT	2	12	265578	265589	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	554648680
94	NC_022606	CATTAT	2	12	265623	265634	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	554648680
95	NC_022606	AAGATC	2	12	272142	272153	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	554648686
96	NC_022606	AAGAAA	2	12	276146	276157	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	554648688
97	NC_022606	TGAAAT	2	12	277996	278007	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	554648690
98	NC_022606	GAAAAA	2	12	278976	278987	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	554648691
99	NC_022606	TAAAAA	2	12	279746	279757	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022606	AGTAAA	2	12	281478	281489	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	554648693
101	NC_022606	GAAAGT	2	12	282215	282226	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	554648694
102	NC_022606	GGAATA	2	12	283406	283417	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	554648694
103	NC_022606	AGGTTT	2	12	283495	283506	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	554648694
104	NC_022606	AAAAGT	2	12	287834	287845	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	554648699
105	NC_022606	ACAAGA	2	12	288969	288980	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	554648700
106	NC_022606	TTGAAA	2	12	307431	307442	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	554648717
107	NC_022606	CAGAAA	2	12	308392	308403	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	554648718
108	NC_022606	TAAAGC	2	12	309142	309153	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	554648719
109	NC_022606	AGGAAA	2	12	311574	311585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554648721
110	NC_022606	ATATTT	2	12	312948	312959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554648722
111	NC_022606	GAAAGA	2	12	314704	314715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554648724
112	NC_022606	GATTTA	2	12	316652	316663	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	554648726
113	NC_022606	CTGCAG	2	12	317691	317702	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	554648726
114	NC_022606	GGCGAA	2	12	319225	319236	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	554648728
115	NC_022606	CTGTTC	2	12	319988	319999	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	554648728
116	NC_022606	AGGCGA	2	12	321127	321138	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	554648729
117	NC_022606	CTTGCT	2	12	329802	329813	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	554648735
118	NC_022606	TGAAGA	2	12	331032	331043	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022606	CCAGAT	2	12	332926	332937	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_022606	AAAAGA	2	12	333054	333065	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022606	GGTAAC	2	12	339012	339023	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	554648741
122	NC_022606	GGTTTT	2	12	342423	342434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554648744
123	NC_022606	CTGTAA	2	12	344292	344303	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	554650443
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231	NC_022606	TAAATG	2	12	597290	597301	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	554648941
232	NC_022606	GCAATT	2	12	602912	602923	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	554648945
233	NC_022606	TTCAGG	2	12	604865	604876	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	554648946
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332	NC_022606	TTAATA	2	12	825311	825322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
333	NC_022606	ACAACC	2	12	825984	825995	50 %	0 %	0 %	50 %	554649151
334	NC_022606	TGAAAA	2	12	829064	829075	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	554649153
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337	NC_022606	AGAACA	2	12	837032	837043	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	554649157
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340	NC_022606	ACAGCT	2	12	847281	847292	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	554649165
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342	NC_022606	TCAATC	2	12	848001	848012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554649165
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344	NC_022606	TAAAGG	2	12	851611	851622	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	554649169
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346	NC_022606	GGAACA	2	12	862778	862789	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	554649177
347	NC_022606	CAATGA	2	12	864125	864136	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	554649179
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350	NC_022606	TACTTT	2	12	875018	875029	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
351	NC_022606	AGCGTC	2	12	879584	879595	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
352	NC_022606	TAAACC	2	12	879952	879963	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
353	NC_022606	ATGAAA	2	12	883234	883245	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	554649193
354	NC_022606	TTGCTT	2	12	884117	884128	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	554649194
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379	NC_022606	TAAATT	2	12	933219	933230	50 %	50 %	0 %	0 %	554649240
380	NC_022606	TTTTTC	2	12	934436	934447	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	554649242
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389	NC_022606	ACAGGT	2	12	958640	958651	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	554649262
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399	NC_022606	ATTTTT	2	12	967312	967323	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
400	NC_022606	TTAGCA	2	12	968999	969010	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	554649270
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447	NC_022606	AAATAA	2	12	1058981	1058992	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
448	NC_022606	AAAAGC	2	12	1059260	1059271	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	554649348
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452	NC_022606	TACAAA	2	12	1067029	1067040	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	554649355
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454	NC_022606	TATATT	2	12	1077692	1077703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554649363
455	NC_022606	TGGAGC	2	12	1079901	1079912	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	554649365
456	NC_022606	TGGCGG	2	12	1081942	1081953	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	554649367
457	NC_022606	GTGGCG	2	12	1082025	1082036	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	554649367
458	NC_022606	TGGCGG	2	12	1082089	1082100	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	554649367
459	NC_022606	TTTTGA	2	12	1088214	1088225	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	554649375
460	NC_022606	TTGGTT	2	12	1091975	1091986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554649378
461	NC_022606	AATGCT	2	12	1092987	1092998	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	554649379
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463	NC_022606	AAAGAT	2	12	1094970	1094981	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	554649380
464	NC_022606	CTGTTG	2	12	1096419	1096430	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	554649383
465	NC_022606	TTATGT	2	12	1099153	1099164	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	554649386
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500	NC_022606	TTTAAA	2	12	1193006	1193017	50 %	50 %	0 %	0 %	554649456

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