MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Carnobacterium sp. WN1359

Total Repeats: 133

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022606	TAAAAA	2	12	31424	31435	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022606	TAAAAA	2	12	33112	33123	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022606	TAAAAA	2	12	38238	38249	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022606	TGAAAA	2	12	79087	79098	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022606	TTATTT	2	12	86410	86421	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022606	AAAATC	2	12	101537	101548	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_022606	TGGAAG	2	12	135330	135341	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022606	CAAAAA	2	12	135683	135694	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_022606	TGGAAG	2	12	148337	148348	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022606	AATAAA	2	12	182155	182166	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022606	GAAGGT	2	12	204882	204893	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022606	AAATAA	2	12	213909	213920	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022606	TTATTT	2	12	217192	217203	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022606	AAAATA	2	12	223845	223856	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022606	TGGAAG	2	12	232829	232840	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022606	GAAAAG	2	12	263785	263796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022606	TAAAAA	2	12	279746	279757	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022606	TGAAGA	2	12	331032	331043	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022606	CCAGAT	2	12	332926	332937	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_022606	AAAAGA	2	12	333054	333065	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022606	TCAATA	2	12	355477	355488	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_022606	CATCCC	2	12	361307	361318	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_022606	TAAATA	2	12	367517	367528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022606	TTTTTA	2	12	377487	377498	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022606	AAATGG	2	12	391004	391015	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022606	GGAGGT	2	12	394333	394344	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022606	AACATA	2	12	397816	397827	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_022606	ACGGCT	2	12	402476	402487	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_022606	AGAAAC	2	12	403988	403999	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_022606	TAAGAA	2	12	406118	406129	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022606	TGGAAG	2	12	466730	466741	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022606	ATTAAT	2	12	468956	468967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022606	TAAAAA	2	12	469071	469082	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022606	AAAAGA	2	12	485755	485766	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022606	ATGAAG	2	12	504722	504733	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022606	TAAGAA	2	12	508184	508195	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022606	TTTTAG	2	12	510628	510639	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022606	AGGAGT	2	12	511808	511819	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022606	TGGAAG	2	12	526577	526588	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022606	TAGATG	2	12	544499	544510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022606	TATCTC	2	12	547726	547737	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_022606	TTAAAG	2	12	567628	567639	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022606	TAAAAA	2	12	592885	592896	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022606	ATTAAA	2	12	605937	605948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022606	AATTAA	2	12	617506	617517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022606	AGGTCA	2	12	628689	628700	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_022606	CTTAGT	2	12	699770	699781	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_022606	TGTTAT	2	12	716791	716802	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022606	ACAAAA	2	12	735819	735830	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_022606	TCTTAT	2	12	764193	764204	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_022606	AGTCTA	2	12	796086	796097	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_022606	TTAATA	2	12	825311	825322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022606	TACTTT	2	12	875018	875029	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_022606	AGCGTC	2	12	879584	879595	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_022606	TAAACC	2	12	879952	879963	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_022606	AATACA	2	12	889690	889701	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_022606	AAAATG	2	12	933076	933087	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022606	CAGTAT	2	12	966753	966764	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_022606	ATTTTT	2	12	967312	967323	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022606	ATTACT	2	12	996447	996458	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_022606	AAATAA	2	12	1001150	1001161	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022606	CTTTTG	2	12	1015695	1015706	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_022606	TAAAAT	2	12	1033794	1033805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022606	AAATAA	2	12	1058981	1058992	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022606	AATTTT	2	12	1103150	1103161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022606	ATATAA	2	12	1136205	1136216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022606	TTCTAT	2	12	1159697	1159708	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_022606	TTATTT	2	12	1199462	1199473	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022606	ATTTCT	2	12	1229877	1229888	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_022606	ATCTGA	2	12	1256193	1256204	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_022606	TTTAGT	2	12	1279674	1279685	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022606	ACTTCC	2	12	1289073	1289084	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_022606	ACTTCC	2	12	1302181	1302192	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_022606	AAGAAA	2	12	1344364	1344375	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022606	TTATTT	2	12	1371331	1371342	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022606	TTTTCA	2	12	1372004	1372015	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_022606	TTATAT	2	12	1372128	1372139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022606	TCTGCT	2	12	1376208	1376219	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_022606	GTTTGT	2	12	1389894	1389905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022606	TTCGTT	2	12	1405682	1405693	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_022606	AATTTA	2	12	1417173	1417184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022606	ATTTTT	2	12	1440874	1440885	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022606	TTTAAT	2	12	1451161	1451172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022606	TTTTTA	2	12	1472447	1472458	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022606	TTACAC	2	12	1481058	1481069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_022606	ATTTTA	2	12	1489546	1489557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022606	CTTTTT	2	12	1500522	1500533	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_022606	TACTTT	2	12	1536327	1536338	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_022606	TTTTAT	2	12	1540451	1540462	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022606	ATTTTT	2	12	1572798	1572809	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022606	TAAAGA	2	12	1605164	1605175	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022606	TGCTCT	2	12	1605295	1605306	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_022606	TTGAAA	2	12	1620255	1620266	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022606	CTCATT	2	12	1631342	1631353	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_022606	ATAAAA	2	12	1663181	1663192	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022606	TAAAAA	2	12	1667616	1667627	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022606	AAATAA	2	12	1692676	1692687	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022606	ATTTTT	2	12	1696339	1696350	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022606	TCTCAC	2	12	1700744	1700755	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_022606	ATTTTC	2	12	1777040	1777051	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_022606	TATTTT	2	12	1805159	1805170	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022606	AACGCA	2	12	1821862	1821873	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_022606	TATTTT	2	12	1846943	1846954	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022606	TCCAAT	2	12	1864882	1864893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_022606	AAAAAT	2	12	1962415	1962426	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022606	AAAGTA	2	12	1990786	1990797	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022606	ATCTTT	2	12	1993626	1993637	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_022606	ACCTTC	2	12	2008139	2008150	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_022606	TTTTAT	2	12	2009412	2009423	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022606	CGCACC	2	12	2045014	2045025	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_022606	ATAAAT	2	12	2058606	2058617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022606	ATAGGT	2	12	2059815	2059826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022606	TTATTT	2	12	2065887	2065898	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022606	TTTTAT	2	12	2083634	2083645	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022606	TTTTAA	2	12	2114720	2114731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022606	ATTATA	2	12	2122244	2122255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022606	TTTATT	2	12	2129150	2129161	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022606	CATCTT	2	12	2129705	2129716	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_022606	ACTTCA	2	12	2130703	2130714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_022606	TAAAAA	2	12	2154820	2154831	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022606	CTTATA	2	12	2164330	2164341	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_022606	TATTTT	2	12	2175736	2175747	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022606	TCTCGT	2	12	2190177	2190188	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_022606	ATTTTT	2	12	2191137	2191148	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022606	TTGAAA	2	12	2213325	2213336	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022606	TTTTTA	2	12	2219431	2219442	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022606	TAAAAA	2	12	2243437	2243448	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022606	GCTATT	2	12	2265694	2265705	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_022606	AAATTT	2	12	2304298	2304309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022606	ACTTCC	2	12	2306913	2306924	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_022606	AAAGAA	2	12	2332894	2332905	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022606	CTCCAT	2	12	2338404	2338415	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_022606	TCTATT	2	12	2342941	2342952	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.