MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Carnobacterium sp. WN1359

Total Repeats: 2006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022606	CAAAA	2	10	672	681	80 %	0 %	0 %	20 %	554648463
2	NC_022606	TTATT	2	10	3018	3027	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022606	ACGAT	2	10	3470	3479	40 %	20 %	20 %	20 %	554648466
4	NC_022606	TTATT	2	10	3630	3639	20 %	80 %	0 %	0 %	554648466
5	NC_022606	AATTT	2	10	4985	4994	40 %	60 %	0 %	0 %	554648467
6	NC_022606	TTTAT	2	10	5982	5991	20 %	80 %	0 %	0 %	554648467
7	NC_022606	CTGCA	2	10	6955	6964	20 %	20 %	20 %	40 %	554648468
8	NC_022606	GACGT	2	10	7300	7309	20 %	20 %	40 %	20 %	554648468
9	NC_022606	GTGAT	2	10	8878	8887	20 %	40 %	40 %	0 %	554648468
10	NC_022606	AAATG	2	10	10038	10047	60 %	20 %	20 %	0 %	554648471
11	NC_022606	CAAAA	2	10	11372	11381	80 %	0 %	0 %	20 %	554648472
12	NC_022606	GATAC	2	10	11507	11516	40 %	20 %	20 %	20 %	554648472
13	NC_022606	TGAAT	2	10	12715	12724	40 %	40 %	20 %	0 %	554648473
14	NC_022606	TAAAA	2	10	12727	12736	80 %	20 %	0 %	0 %	554648473
15	NC_022606	TAAAA	2	10	13094	13103	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022606	TTTAG	2	10	13942	13951	20 %	60 %	20 %	0 %	554648474
17	NC_022606	CTATT	2	10	16565	16574	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_022606	AGAAA	2	10	17405	17414	80 %	0 %	20 %	0 %	554648476
19	NC_022606	ATTTG	2	10	18814	18823	20 %	60 %	20 %	0 %	554648478
20	NC_022606	AAATA	2	10	19273	19282	80 %	20 %	0 %	0 %	554648478
21	NC_022606	AATTA	2	10	19359	19368	60 %	40 %	0 %	0 %	554648478
22	NC_022606	CTTTT	2	10	19647	19656	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_022606	TGCAT	2	10	19938	19947	20 %	40 %	20 %	20 %	554648479
24	NC_022606	TTTAT	2	10	21471	21480	20 %	80 %	0 %	0 %	554648481
25	NC_022606	TAAAT	2	10	21685	21694	60 %	40 %	0 %	0 %	554648481
26	NC_022606	TTAGT	2	10	22610	22619	20 %	60 %	20 %	0 %	554648483
27	NC_022606	ATTTA	2	10	24179	24188	40 %	60 %	0 %	0 %	554648485
28	NC_022606	AACCA	2	10	25460	25469	60 %	0 %	0 %	40 %	554648486
29	NC_022606	GAAAA	2	10	29087	29096	80 %	0 %	20 %	0 %	554648489
30	NC_022606	TCAAT	2	10	30915	30924	40 %	40 %	0 %	20 %	554648490
31	NC_022606	TTATT	2	10	32896	32905	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022606	AAAAT	2	10	33146	33155	80 %	20 %	0 %	0 %	554648494
33	NC_022606	TAGTG	2	10	36899	36908	20 %	40 %	40 %	0 %	554648498
34	NC_022606	ATTCA	2	10	37393	37402	40 %	40 %	0 %	20 %	554648498
35	NC_022606	AAGCT	2	10	37905	37914	40 %	20 %	20 %	20 %	554648498
36	NC_022606	AATAT	2	10	38123	38132	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022606	AATGG	2	10	38214	38223	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022606	TGAAA	2	10	39251	39260	60 %	20 %	20 %	0 %	554648500
39	NC_022606	TCCAT	2	10	41251	41260	20 %	40 %	0 %	40 %	554648502
40	NC_022606	TTATA	2	10	41687	41696	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022606	AAAAG	2	10	42914	42923	80 %	0 %	20 %	0 %	554648503
42	NC_022606	TAATG	2	10	44921	44930	40 %	40 %	20 %	0 %	554648505
43	NC_022606	AACAA	2	10	45282	45291	80 %	0 %	0 %	20 %	554648505
44	NC_022606	GTATC	2	10	45497	45506	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_022606	CTTTG	2	10	45557	45566	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_022606	ATATG	2	10	46914	46923	40 %	40 %	20 %	0 %	554648507
47	NC_022606	CTAAA	2	10	48645	48654	60 %	20 %	0 %	20 %	554648508
48	NC_022606	TATTT	2	10	54037	54046	20 %	80 %	0 %	0 %	554648512
49	NC_022606	GATTA	2	10	55613	55622	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022606	TGAAA	2	10	59208	59217	60 %	20 %	20 %	0 %	554648517
51	NC_022606	AGTGA	2	10	59350	59359	40 %	20 %	40 %	0 %	554648517
52	NC_022606	ATAAA	2	10	61052	61061	80 %	20 %	0 %	0 %	554648520
53	NC_022606	TATTT	2	10	61412	61421	20 %	80 %	0 %	0 %	554648520
54	NC_022606	AATTC	2	10	61446	61455	40 %	40 %	0 %	20 %	554648520
55	NC_022606	TGCAT	2	10	61491	61500	20 %	40 %	20 %	20 %	554648520
56	NC_022606	ATTTT	2	10	62064	62073	20 %	80 %	0 %	0 %	554648520
57	NC_022606	ATTAT	2	10	64864	64873	40 %	60 %	0 %	0 %	554648521
58	NC_022606	AACGA	2	10	67539	67548	60 %	0 %	20 %	20 %	554648524
59	NC_022606	ATCAT	2	10	67904	67913	40 %	40 %	0 %	20 %	554648525
60	NC_022606	AAGAA	2	10	68435	68444	80 %	0 %	20 %	0 %	554648525
61	NC_022606	TCCAA	2	10	69948	69957	40 %	20 %	0 %	40 %	554648526
62	NC_022606	TGAAG	2	10	70634	70643	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022606	TAATG	2	10	70848	70857	40 %	40 %	20 %	0 %	554650432
64	NC_022606	AAATT	2	10	71558	71567	60 %	40 %	0 %	0 %	554650433
65	NC_022606	ATAGT	2	10	73079	73088	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022606	TTCTT	2	10	74057	74066	0 %	80 %	0 %	20 %	554650434
67	NC_022606	ATAAG	2	10	74667	74676	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022606	ATTGT	2	10	75260	75269	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022606	TTGTT	2	10	78004	78013	0 %	80 %	20 %	0 %	554650438
70	NC_022606	CAATC	2	10	80015	80024	40 %	20 %	0 %	40 %	554648534
71	NC_022606	ATCTG	2	10	80225	80234	20 %	40 %	20 %	20 %	554648534
72	NC_022606	AAAAG	2	10	80597	80606	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022606	ATATT	2	10	81742	81751	40 %	60 %	0 %	0 %	554648535
74	NC_022606	AATAA	2	10	81781	81790	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022606	GCATG	2	10	82450	82459	20 %	20 %	40 %	20 %	554648536
76	NC_022606	AAATA	2	10	83169	83178	80 %	20 %	0 %	0 %	554648537
77	NC_022606	TATTG	2	10	83545	83554	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022606	ATTTA	2	10	83769	83778	40 %	60 %	0 %	0 %	554648538
79	NC_022606	TAACA	2	10	89691	89700	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_022606	ATTGA	2	10	90861	90870	40 %	40 %	20 %	0 %	554648543
81	NC_022606	AAAAG	2	10	92852	92861	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022606	TTTAG	2	10	93736	93745	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022606	AAATG	2	10	95604	95613	60 %	20 %	20 %	0 %	554648548
84	NC_022606	CTATT	2	10	96413	96422	20 %	60 %	0 %	20 %	554648548
85	NC_022606	GACGA	2	10	97914	97923	40 %	0 %	40 %	20 %	554648550
86	NC_022606	AAGCA	2	10	98942	98951	60 %	0 %	20 %	20 %	554648551
87	NC_022606	GAAAA	2	10	104563	104572	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022606	TTGTA	2	10	105523	105532	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022606	AAATA	2	10	105775	105784	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022606	ATATG	2	10	107240	107249	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022606	CAAGA	2	10	107589	107598	60 %	0 %	20 %	20 %	554648559
92	NC_022606	TTATT	2	10	108519	108528	20 %	80 %	0 %	0 %	554648560
93	NC_022606	AATAT	2	10	108699	108708	60 %	40 %	0 %	0 %	554648560
94	NC_022606	TATAC	2	10	109028	109037	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_022606	TGTTT	2	10	111316	111325	0 %	80 %	20 %	0 %	554648562
96	NC_022606	AGAAA	2	10	112930	112939	80 %	0 %	20 %	0 %	554648564
97	NC_022606	GATTT	2	10	115767	115776	20 %	60 %	20 %	0 %	554648564
98	NC_022606	GTTGA	2	10	116096	116105	20 %	40 %	40 %	0 %	554648564
99	NC_022606	GCACA	2	10	117340	117349	40 %	0 %	20 %	40 %	554648565
100	NC_022606	AAATG	2	10	117966	117975	60 %	20 %	20 %	0 %	554648566
101	NC_022606	TAGTA	2	10	119252	119261	40 %	40 %	20 %	0 %	554648567
102	NC_022606	TAGTT	2	10	119319	119328	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022606	AATCA	2	10	119676	119685	60 %	20 %	0 %	20 %	554648568
104	NC_022606	TACAT	2	10	121936	121945	40 %	40 %	0 %	20 %	554648570
105	NC_022606	AATCA	2	10	122799	122808	60 %	20 %	0 %	20 %	554648572
106	NC_022606	TAAAA	2	10	128849	128858	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022606	GTAAA	2	10	130102	130111	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022606	ATCTA	2	10	130156	130165	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_022606	TTTAT	2	10	130688	130697	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022606	TCGTG	2	10	131782	131791	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
111	NC_022606	GTTAA	2	10	132473	132482	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022606	AAACT	2	10	136276	136285	60 %	20 %	0 %	20 %	554648577
113	NC_022606	AAAAT	2	10	136554	136563	80 %	20 %	0 %	0 %	554648577
114	NC_022606	TAAAA	2	10	136690	136699	80 %	20 %	0 %	0 %	554648577
115	NC_022606	TTAAA	2	10	136934	136943	60 %	40 %	0 %	0 %	554648578
116	NC_022606	AACTT	2	10	139240	139249	40 %	40 %	0 %	20 %	554648579
117	NC_022606	ATAAC	2	10	139676	139685	60 %	20 %	0 %	20 %	554648579
118	NC_022606	GAATG	2	10	140226	140235	40 %	20 %	40 %	0 %	554648579
119	NC_022606	ATTTC	2	10	141296	141305	20 %	60 %	0 %	20 %	554648580
120	NC_022606	AAAAG	2	10	141761	141770	80 %	0 %	20 %	0 %	554648580
121	NC_022606	TTTTA	2	10	142158	142167	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022606	TAAAA	2	10	143268	143277	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022606	AACAA	2	10	143326	143335	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_022606	TCGTG	2	10	144560	144569	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_022606	GTTAA	2	10	145480	145489	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022606	ATTAT	2	10	149469	149478	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022606	TTTAT	2	10	149643	149652	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022606	GAAAA	2	10	149696	149705	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022606	ATCTT	2	10	150646	150655	20 %	60 %	0 %	20 %	554648583
130	NC_022606	ACAAA	2	10	150769	150778	80 %	0 %	0 %	20 %	554648583
131	NC_022606	TTCTA	2	10	151560	151569	20 %	60 %	0 %	20 %	554648583
132	NC_022606	AAAGT	2	10	152790	152799	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022606	GAAAG	2	10	152889	152898	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022606	TAGAA	2	10	153975	153984	60 %	20 %	20 %	0 %	554648585
135	NC_022606	AAAGA	2	10	154311	154320	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022606	GAAAA	2	10	155210	155219	80 %	0 %	20 %	0 %	554650440
137	NC_022606	GATAA	2	10	158205	158214	60 %	20 %	20 %	0 %	554648589
138	NC_022606	TGAGG	2	10	159173	159182	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022606	GAACA	2	10	159197	159206	60 %	0 %	20 %	20 %	554648590
140	NC_022606	GAAAA	2	10	160919	160928	80 %	0 %	20 %	0 %	554648591
141	NC_022606	TGGAG	2	10	162280	162289	20 %	20 %	60 %	0 %	554648592
142	NC_022606	CTACA	2	10	162724	162733	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
143	NC_022606	AATTT	2	10	163054	163063	40 %	60 %	0 %	0 %	554648594
144	NC_022606	ACTGA	2	10	165738	165747	40 %	20 %	20 %	20 %	554648596
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147	NC_022606	ATTTG	2	10	166756	166765	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_022606	GAAAA	2	10	184284	184293	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
159	NC_022606	ATGTT	2	10	184804	184813	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_022606	AATTA	2	10	195421	195430	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_022606	ATGTA	2	10	203956	203965	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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260	NC_022606	GATTG	2	10	310419	310428	20 %	40 %	40 %	0 %	554648720
261	NC_022606	GAATA	2	10	310906	310915	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
262	NC_022606	TGGCA	2	10	311508	311517	20 %	20 %	40 %	20 %	554648721
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264	NC_022606	TGTTT	2	10	312323	312332	0 %	80 %	20 %	0 %	554650442
265	NC_022606	CTTAT	2	10	314159	314168	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
266	NC_022606	GGAAT	2	10	314630	314639	40 %	20 %	40 %	0 %	554648724
267	NC_022606	CTTTT	2	10	316571	316580	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
268	NC_022606	TTATT	2	10	316791	316800	20 %	80 %	0 %	0 %	554648726
269	NC_022606	AAATA	2	10	317813	317822	80 %	20 %	0 %	0 %	554648726
270	NC_022606	ATGGT	2	10	318204	318213	20 %	40 %	40 %	0 %	554648727
271	NC_022606	AAAAT	2	10	320127	320136	80 %	20 %	0 %	0 %	554648728
272	NC_022606	AAACT	2	10	320149	320158	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
273	NC_022606	CCTAA	2	10	320972	320981	40 %	20 %	0 %	40 %	554648729
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403	NC_022606	AGAAA	2	10	471209	471218	80 %	0 %	20 %	0 %	554648838
404	NC_022606	CGTAA	2	10	472007	472016	40 %	20 %	20 %	20 %	554648839
405	NC_022606	AAATA	2	10	473093	473102	80 %	20 %	0 %	0 %	554648840
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408	NC_022606	TAAAT	2	10	475723	475732	60 %	40 %	0 %	0 %	554648841
409	NC_022606	CCTTG	2	10	483810	483819	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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430	NC_022606	TAATT	2	10	504408	504417	40 %	60 %	0 %	0 %	554648861
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434	NC_022606	TTAAT	3	15	508216	508230	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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436	NC_022606	TAAAT	2	10	510640	510649	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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439	NC_022606	TATTT	2	10	512321	512330	20 %	80 %	0 %	0 %	554648865
440	NC_022606	TAAAT	2	10	512495	512504	60 %	40 %	0 %	0 %	554648865
441	NC_022606	ACAGT	2	10	513479	513488	40 %	20 %	20 %	20 %	554648866
442	NC_022606	TTTTA	2	10	513697	513706	20 %	80 %	0 %	0 %	554648867
443	NC_022606	AATAA	2	10	513820	513829	80 %	20 %	0 %	0 %	554648867
444	NC_022606	CTAGA	2	10	514294	514303	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
445	NC_022606	TGGGA	2	10	515586	515595	20 %	20 %	60 %	0 %	554648869
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