MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus Z172

Total Repeats: 259

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022604	ATAAAT	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022604	TAAATC	2	12	17154	17165	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_022604	TTTAAA	2	12	34354	34365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022604	TAAAAT	2	12	53814	53825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022604	ATAATT	2	12	54399	54410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022604	ATATTA	2	12	71709	71720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022604	AAAAAT	2	12	73933	73944	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022604	ATTTGG	2	12	93126	93137	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022604	AATATA	2	12	124721	124732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022604	TTAACA	2	12	134582	134593	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_022604	TAAGAA	2	12	156952	156963	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022604	GTTTTT	2	12	171018	171029	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022604	TTTATA	2	12	219380	219391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022604	ATTAAT	2	12	219403	219414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022604	AAATTT	2	12	243919	243930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022604	AGTGGA	2	12	279287	279298	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022604	ATATAG	2	12	301058	301069	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022604	ATAATT	2	12	307329	307340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022604	AATTAT	2	12	314751	314762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022604	AACGAT	2	12	317455	317466	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_022604	TAACTT	2	12	325830	325841	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_022604	TAAAAT	2	12	373466	373477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022604	ATATGA	2	12	373510	373521	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022604	TTCATT	2	12	377965	377976	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_022604	TTGTAA	2	12	383268	383279	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022604	AATGTA	2	12	421131	421142	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022604	AATTTG	2	12	421238	421249	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022604	TAAAGA	2	12	423211	423222	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022604	TTTTAT	2	12	469236	469247	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022604	TTGAAA	2	12	476078	476089	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022604	TGTATA	2	12	491474	491485	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022604	TTTTTA	2	12	500407	500418	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022604	AAAATG	2	12	505840	505851	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022604	ACGTTG	2	12	526287	526298	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_022604	AAAATA	2	12	527011	527022	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022604	TATGGT	2	12	535149	535160	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022604	TTATAA	2	12	546506	546517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022604	AAATTT	2	12	553265	553276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022604	TTATAA	2	12	608393	608404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022604	GTTATA	2	12	609064	609075	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022604	CTTAAA	2	12	617496	617507	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_022604	ACATGT	2	12	627466	627477	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_022604	GACTCA	2	12	645337	645348	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_022604	GACTCA	2	12	645355	645366	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_022604	GATTCA	2	12	645373	645384	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_022604	TCAGAT	2	12	645394	645405	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_022604	TCAGAT	2	12	645448	645459	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_022604	TCAGAC	2	12	645466	645477	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_022604	TCAGAT	2	12	645484	645495	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_022604	TCAGAT	2	12	645502	645513	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_022604	TCAGAT	2	12	645538	645549	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_022604	GACTCA	2	12	645643	645654	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_022604	GATTCA	2	12	645661	645672	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_022604	GACTCA	2	12	645679	645690	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_022604	TCAGAC	2	12	645700	645711	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_022604	GACTCA	2	12	645715	645726	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_022604	AAAGCA	2	12	645784	645795	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_022604	TTTTAC	2	12	655764	655775	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_022604	ATTGCG	2	12	657961	657972	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_022604	AATGAT	2	12	661879	661890	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022604	TAGATG	2	12	661952	661963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022604	TTTTAC	2	12	672629	672640	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_022604	TAAAAT	2	12	678605	678616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022604	TTTTAA	2	12	690711	690722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022604	CATTAT	2	12	707022	707033	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_022604	CATCAA	2	12	717420	717431	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_022604	TAATTT	2	12	721660	721671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022604	TGAATA	2	12	738138	738149	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022604	GGATTC	2	12	749489	749500	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_022604	AAATAT	2	12	752281	752292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022604	TTAAAA	2	12	764284	764295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022604	TAGTTA	2	12	768719	768730	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022604	TTTTTA	2	12	786994	787005	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022604	TGAAAA	2	12	795236	795247	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022604	AATGAT	2	12	824006	824017	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022604	ACAAAA	2	12	864137	864148	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_022604	TAAAAA	2	12	883279	883290	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022604	TATCAA	2	12	889761	889772	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_022604	GTAAAA	2	12	893008	893019	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022604	TTTTGA	2	12	894866	894877	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022604	TCATTT	2	12	900859	900870	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_022604	TAATTA	2	12	912924	912935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022604	AAATTA	2	12	925533	925544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022604	AAGCAC	2	12	934264	934275	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_022604	TAAAAT	2	12	941940	941951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022604	TTTAAT	2	12	1014550	1014561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022604	GTAAAA	2	12	1015264	1015275	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022604	ACAATA	2	12	1033277	1033288	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_022604	AACGGA	2	12	1047799	1047810	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_022604	AAAAGC	2	12	1052398	1052409	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_022604	CATTTA	2	12	1077719	1077730	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_022604	ATCATA	2	12	1079614	1079625	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_022604	TCAAAA	2	12	1086122	1086133	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_022604	ATTGCA	2	12	1087201	1087212	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_022604	TTTTCT	2	12	1099929	1099940	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_022604	TTTATA	2	12	1135942	1135953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022604	GAATTA	2	12	1142515	1142526	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022604	AAAATA	2	12	1154385	1154396	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022604	GTAAAT	2	12	1186934	1186945	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022604	ATTTTT	2	12	1201682	1201693	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022604	ATAATT	2	12	1202479	1202490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022604	TAATGA	2	12	1215518	1215529	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022604	GTAAAA	2	12	1228508	1228519	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022604	ATTTAT	2	12	1236030	1236041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022604	ATTATA	2	12	1239948	1239959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022604	AAATTT	2	12	1240757	1240768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022604	AAGTAA	2	12	1262460	1262471	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022604	TCGTTT	2	12	1265587	1265598	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_022604	TTAATT	2	12	1276302	1276313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022604	AATTAA	2	12	1279038	1279049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022604	GAAATT	2	12	1323940	1323951	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022604	AATGAT	2	12	1336715	1336726	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022604	TTTCAT	2	12	1366998	1367009	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_022604	TATATT	2	12	1371657	1371668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022604	CATATT	2	12	1396726	1396737	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_022604	ATGTAT	2	12	1397347	1397358	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022604	AAAGAA	2	12	1397579	1397590	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022604	TTTTAC	2	12	1400236	1400247	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_022604	GTAAAA	2	12	1403058	1403069	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022604	TTAAAG	2	12	1405496	1405507	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022604	ATTAAA	2	12	1434103	1434114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022604	ATATAA	2	12	1442085	1442096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022604	AAAATA	2	12	1456153	1456164	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022604	GTTTTA	2	12	1471900	1471911	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022604	TTACAA	2	12	1475186	1475197	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_022604	TAAAAT	2	12	1487324	1487335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022604	TATCTT	2	12	1510160	1510171	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_022604	TTGATT	2	12	1510223	1510234	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022604	ATTCTA	2	12	1517563	1517574	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_022604	AATAAA	2	12	1521157	1521168	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022604	TATTCT	2	12	1568583	1568594	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_022604	TACTTG	2	12	1578830	1578841	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_022604	AAAAAT	2	12	1578846	1578857	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022604	TTAATC	2	12	1592353	1592364	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_022604	TATGAT	2	12	1632268	1632279	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_022604	AATTTA	2	12	1765695	1765706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_022604	ATTTTC	2	12	1771730	1771741	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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157	NC_022604	TAAAAA	2	12	1811231	1811242	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_022604	TATCAA	2	12	1871658	1871669	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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248	NC_022604	TCATTT	2	12	2843464	2843475	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
249	NC_022604	GTAAAT	2	12	2858815	2858826	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
250	NC_022604	TAGTAT	2	12	2868781	2868792	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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252	NC_022604	TTAATT	2	12	2877784	2877795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_022604	ATTGTT	2	12	2878198	2878209	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
254	NC_022604	ATAATT	2	12	2934015	2934026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_022604	ATTTTA	2	12	2953177	2953188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_022604	CTATTT	2	12	2953725	2953736	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
257	NC_022604	ATTCGA	2	12	2958057	2958068	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
258	NC_022604	GATTTT	2	12	2974977	2974988	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
259	NC_022604	ATATAA	2	12	2981224	2981235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.