MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus Z172

Total Repeats: 1309

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022604	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554642797
2	NC_022604	GTTATC	2	12	7297	7308	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	554642801
3	NC_022604	CAAGCT	2	12	8265	8276	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	554642801
4	NC_022604	GTAATG	2	12	9253	9264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554642801
5	NC_022604	ACAATT	2	12	11250	11261	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	554642803
6	NC_022604	TAGCAT	2	12	11345	11356	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	554642803
7	NC_022604	GCTTTA	2	12	17432	17443	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	554642808
8	NC_022604	TTTGAA	2	12	18253	18264	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	554642808
9	NC_022604	TAAAGG	2	12	20300	20311	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	554642810
10	NC_022604	TTGAAG	2	12	20497	20508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554642810
11	NC_022604	TGATTG	2	12	21701	21712	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	554642811
12	NC_022604	AAGGAA	2	12	22470	22481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554642812
13	NC_022604	TGAATT	2	12	25385	25396	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	554642813
14	NC_022604	CGTATT	2	12	26466	26477	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	554642814
15	NC_022604	ATTTCA	2	12	27869	27880	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	554642815
16	NC_022604	GTTCTG	2	12	29168	29179	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	554642816
17	NC_022604	ATCAGC	2	12	31183	31194	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	554642818
18	NC_022604	AAAAGA	2	12	33824	33835	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	554642820
19	NC_022604	TTTTGA	2	12	34612	34623	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	554642821
20	NC_022604	TAAACA	2	12	35032	35043	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	554642822
21	NC_022604	TGGTAG	2	12	35698	35709	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	554642822
22	NC_022604	ATGCCT	2	12	38353	38364	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	554642824
23	NC_022604	TGAAGA	2	12	38541	38552	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	554642824
24	NC_022604	GAACAA	2	12	43999	44010	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	554642831
25	NC_022604	TCTCAT	2	12	44822	44833	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	554642833
26	NC_022604	ATGTTA	2	12	45791	45802	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	554642834
27	NC_022604	ATTTTT	2	12	46429	46440	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	554642835
28	NC_022604	CCATGC	2	12	47591	47602	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	554642835
29	NC_022604	AGAAAA	2	12	48413	48424	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	554642837
30	NC_022604	GAAAAT	2	12	54011	54022	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	554642844
31	NC_022604	TGAATT	2	12	55149	55160	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	554642846
32	NC_022604	GTCTAA	2	12	57943	57954	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	554642849
33	NC_022604	GTTTAA	2	12	58834	58845	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	554642850
34	NC_022604	GTTTAA	2	12	66759	66770	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	554642858
35	NC_022604	GAACAG	2	12	70160	70171	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	554642860
36	NC_022604	TAAAGC	2	12	71004	71015	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	554642861
37	NC_022604	GTTTAA	2	12	72008	72019	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	554642862
38	NC_022604	AATGAA	2	12	75169	75180	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	554642866
39	NC_022604	ACAACT	2	12	77234	77245	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	554642867
40	NC_022604	TTCATC	2	12	85317	85328	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	554642876
41	NC_022604	TTTTCT	2	12	88696	88707	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	554642879
42	NC_022604	AATTAA	2	12	88886	88897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554642879
43	NC_022604	GGCATG	2	12	89517	89528	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	554642880
44	NC_022604	TAAAAA	2	12	90679	90690	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	554642880
45	NC_022604	TTCTTT	2	12	99000	99011	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	554642888
46	NC_022604	TTAAAC	2	12	99425	99436	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	554642889
47	NC_022604	GTAAAA	2	12	100679	100690	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	554642890
48	NC_022604	TTAAAA	2	12	100769	100780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554642890
49	NC_022604	GGGCTT	2	12	105955	105966	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	554642895
50	NC_022604	ACCCTT	2	12	111378	111389	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	554642902
51	NC_022604	TTTAGC	2	12	113286	113297	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	554642904
52	NC_022604	AAATAA	2	12	113337	113348	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	554642904
53	NC_022604	AAAAGA	2	12	115515	115526	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	554642905
54	NC_022604	TACAAG	2	12	118263	118274	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	554642907
55	NC_022604	GTAGAA	2	12	122184	122195	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	554642910
56	NC_022604	AACCAC	2	12	123019	123030	50 %	0 %	0 %	50 %	554642910
57	NC_022604	AACCGA	2	12	126334	126345	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	554642913
58	NC_022604	CATTAC	2	12	128035	128046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554642914
59	NC_022604	CTTTTA	2	12	128104	128115	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	554642914
60	NC_022604	TATCAT	2	12	129606	129617	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	554642915
61	NC_022604	TTTATT	2	12	130014	130025	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	554642916
62	NC_022604	TATTTG	2	12	130100	130111	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	554642916
63	NC_022604	TAAATA	2	12	131533	131544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554642916
64	NC_022604	TTTTTC	2	12	133131	133142	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	554642917
65	NC_022604	TTTGAA	2	12	137238	137249	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	554642921
66	NC_022604	TACCAT	2	12	140674	140685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554642924
67	NC_022604	TGAAGA	2	12	147030	147041	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	554642928
68	NC_022604	TTTCAT	2	12	147711	147722	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	554642929
69	NC_022604	TGTTTA	2	12	151929	151940	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	554642933
70	NC_022604	TCGAAA	2	12	153427	153438	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	554642935
71	NC_022604	CTATTG	2	12	156013	156024	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	554642937
72	NC_022604	CATATG	2	12	157216	157227	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	554642938
73	NC_022604	CAGATT	2	12	162710	162721	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	554642943
74	NC_022604	AGATAT	2	12	170109	170120	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	554642950
75	NC_022604	GATATG	2	12	179391	179402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554642957
76	NC_022604	TAATGA	2	12	182367	182378	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	554642959
77	NC_022604	ATTTGA	2	12	183297	183308	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	554642960
78	NC_022604	TATAAA	2	12	183828	183839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554642961
79	NC_022604	GATTTT	2	12	187990	188001	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	554642965
80	NC_022604	ACAAAG	2	12	192510	192521	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	554642969
81	NC_022604	TGTAAT	2	12	193534	193545	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	554642970
82	NC_022604	AAAGAT	2	12	194523	194534	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	554642972
83	NC_022604	CAATAT	2	12	196995	197006	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	554642973
84	NC_022604	AATTAG	2	12	199724	199735	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	554642977
85	NC_022604	TTGGTA	2	12	200851	200862	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	554642978
86	NC_022604	GCGATT	2	12	200871	200882	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	554642978
87	NC_022604	AAATTT	2	12	200969	200980	50 %	50 %	0 %	0 %	554642978
88	NC_022604	TTTGGA	2	12	203524	203535	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	554642981
89	NC_022604	ACCTGC	2	12	203859	203870	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	554642981
90	NC_022604	AAGATA	2	12	204005	204016	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	554642981
91	NC_022604	CTATTA	2	12	208790	208801	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	554642983
92	NC_022604	TATGAT	2	12	210324	210335	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	554642983
93	NC_022604	TTGAAA	2	12	210776	210787	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	554642983
94	NC_022604	AGCAAC	2	12	216727	216738	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	554642987
95	NC_022604	CACCTT	2	12	218779	218790	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	554642989
96	NC_022604	GTAAAT	2	12	223022	223033	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	554642992
97	NC_022604	ATTTTA	2	12	224616	224627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554642994
98	NC_022604	TATCTT	2	12	229230	229241	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	554642997
99	NC_022604	ATTTGG	2	12	230243	230254	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	554642998
100	NC_022604	GAGTTT	2	12	233587	233598	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	554642999
101	NC_022604	CCCTGA	2	12	236096	236107	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	554643001
102	NC_022604	TCCTGA	2	12	236915	236926	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	554643001
103	NC_022604	TCAATT	2	12	239066	239077	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	554643003
104	NC_022604	AATATG	2	12	240366	240377	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	554643004
105	NC_022604	AAGGAC	2	12	240690	240701	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	554643004
106	NC_022604	AGGACA	2	12	244996	245007	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	554643007
107	NC_022604	ACATTT	2	12	245332	245343	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	554643007
108	NC_022604	TTCTTG	2	12	250260	250271	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	554643011
109	NC_022604	AGCCAT	2	12	274331	274342	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	554643029
110	NC_022604	TGGTAT	2	12	290869	290880	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	554643043
111	NC_022604	TATAGA	2	12	294223	294234	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	554643047
112	NC_022604	ACGATG	2	12	301394	301405	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	554643053
113	NC_022604	AGAATC	2	12	308957	308968	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	554643058
114	NC_022604	GCAATT	2	12	312833	312844	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	554643062
115	NC_022604	CAATTG	2	12	313395	313406	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	554643062
116	NC_022604	ATAAAG	2	12	316109	316120	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	554643065
117	NC_022604	GACATT	2	12	317808	317819	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	554643066
118	NC_022604	GATTTC	2	12	319627	319638	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	554643068
119	NC_022604	TTCATA	2	12	320197	320208	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	554643069
120	NC_022604	GATTAT	2	12	324604	324615	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	554643073
121	NC_022604	ATGGTG	2	12	324737	324748	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	554643073
122	NC_022604	CAGCAA	2	12	325124	325135	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	554643073
123	NC_022604	TAATGG	2	12	326332	326343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554643074
124	NC_022604	TCTTCA	2	12	330703	330714	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	554643078
125	NC_022604	TTATCT	2	12	330799	330810	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	554643078
126	NC_022604	CTAAAG	2	12	331906	331917	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	554643079
127	NC_022604	ATAAGT	2	12	332264	332275	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	554643079
128	NC_022604	GAAAAA	2	12	333060	333071	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	554643081
129	NC_022604	TAATTA	2	12	336552	336563	50 %	50 %	0 %	0 %	554643083
130	NC_022604	ACAAGA	2	12	337392	337403	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	554643084
131	NC_022604	AGGACA	2	12	337770	337781	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	554643084
132	NC_022604	ATTATC	2	12	339080	339091	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	554643085
133	NC_022604	TAAATT	2	12	340620	340631	50 %	50 %	0 %	0 %	554643085
134	NC_022604	TGAAGA	2	12	340881	340892	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	554643085
135	NC_022604	GATCAA	2	12	341588	341599	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	554643085
136	NC_022604	AATATA	2	12	345784	345795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554643090
137	NC_022604	TTTTTA	2	12	346984	346995	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	554643092
138	NC_022604	TGTTTT	2	12	347485	347496	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	554643093
139	NC_022604	CTGAAT	2	12	352242	352253	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	554643101
140	NC_022604	GAAAAA	2	12	356437	356448	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	554643104
141	NC_022604	TTTATT	2	12	357022	357033	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	554643105
142	NC_022604	ACGAAT	2	12	357500	357511	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	554643105
143	NC_022604	GAAACA	2	12	359105	359116	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	554643106
144	NC_022604	CAGGTG	2	12	359292	359303	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	554643106
145	NC_022604	AAAATT	2	12	359670	359681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554643107
146	NC_022604	AATGAC	2	12	375098	375109	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	554643121
147	NC_022604	AAAATG	2	12	376579	376590	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	554643122
148	NC_022604	AATAAG	2	12	379535	379546	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	554643125
149	NC_022604	TGCAAT	2	12	381097	381108	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	554643127
150	NC_022604	AATTTT	2	12	384540	384551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554643130
151	NC_022604	GATGCT	2	12	395315	395326	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	554643142
152	NC_022604	TTTATT	2	12	396080	396091	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	554643142
153	NC_022604	TTTAAA	2	12	396260	396271	50 %	50 %	0 %	0 %	554643142
154	NC_022604	ATTAAA	2	12	398950	398961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554643147
155	NC_022604	AGGACA	2	12	402665	402676	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	554643151
156	NC_022604	GCAAAA	2	12	409526	409537	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	554643155
157	NC_022604	GAAGAC	2	12	415533	415544	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	554643162
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170	NC_022604	AATCAC	2	12	457442	457453	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	554643205
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173	NC_022604	TAAGTC	2	12	466659	466670	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	554643214
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176	NC_022604	ATGAAA	2	12	475357	475368	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	554643223
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180	NC_022604	CATTAG	2	12	483466	483477	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	554643231
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183	NC_022604	GAAAAT	2	12	488146	488157	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	554643234
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188	NC_022604	TTTTGA	2	12	498354	498365	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	554643246
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222	NC_022604	AGCACA	2	12	575499	575510	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	554643311
223	NC_022604	AGGAGA	2	12	575825	575836	50 %	0 %	50 %	0 %	554643311
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227	NC_022604	AATCAT	2	12	586328	586339	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	554643315
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229	NC_022604	CAGGTA	2	12	587708	587719	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	554643316
230	NC_022604	AAAGTT	2	12	590801	590812	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	554643320
231	NC_022604	AAAATG	2	12	591540	591551	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	554643321
232	NC_022604	AATGTT	2	12	597071	597082	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	554643324
233	NC_022604	AAAAAG	2	12	602862	602873	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	554643329
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235	NC_022604	CATTTA	2	12	605951	605962	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	554643334
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333	NC_022604	CATTGC	2	12	752756	752767	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	554643471
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344	NC_022604	TAAATG	2	12	768477	768488	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	554643490
345	NC_022604	TTGATA	2	12	773098	773109	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	554643494
346	NC_022604	TGAACA	2	12	775515	775526	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	554643497
347	NC_022604	AGCAAC	2	12	784032	784043	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	554643505
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349	NC_022604	TAATAT	2	12	792406	792417	50 %	50 %	0 %	0 %	554643511
350	NC_022604	ATATCA	2	12	793745	793756	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	554643512
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440	NC_022604	TTGCAC	2	12	986270	986281	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	554643705
441	NC_022604	ATACAG	2	12	986342	986353	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	554643705
442	NC_022604	CGACTA	2	12	986600	986611	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	554643705
443	NC_022604	TGAAAG	2	12	990602	990613	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	554643709
444	NC_022604	CAATTT	2	12	991516	991527	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	554643709
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448	NC_022604	AATTAT	2	12	996393	996404	50 %	50 %	0 %	0 %	554643713
449	NC_022604	ATTTAG	2	12	998044	998055	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	554643715
450	NC_022604	ATTCAA	2	12	998209	998220	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	554643715
451	NC_022604	AGATAT	2	12	999204	999215	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	554643717
452	NC_022604	GATGCA	2	12	1000491	1000502	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	554643718
453	NC_022604	GAAGGT	2	12	1000770	1000781	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	554643718
454	NC_022604	AGTATT	2	12	1001159	1001170	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	554643718
455	NC_022604	TCAGGT	2	12	1004001	1004012	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	554643722
456	NC_022604	CGTAAA	2	12	1005181	1005192	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	554643723
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458	NC_022604	TATTGG	2	12	1008424	1008435	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	554643725
459	NC_022604	CAGATC	2	12	1009191	1009202	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	554643725
460	NC_022604	ATTTTT	2	12	1011952	1011963	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	554643728
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