MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Carnobacterium sp. WN1359 plasmid pWNCR64

Total Repeats: 227

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022603	TGTC	2	8	561	568	0 %	50 %	25 %	25 %	554640011
2	NC_022603	TTTA	2	8	593	600	25 %	75 %	0 %	0 %	554640011
3	NC_022603	AAAG	2	8	687	694	75 %	0 %	25 %	0 %	554640011
4	NC_022603	TTAA	2	8	826	833	50 %	50 %	0 %	0 %	554640011
5	NC_022603	AGAT	2	8	880	887	50 %	25 %	25 %	0 %	554640012
6	NC_022603	GGAG	2	8	929	936	25 %	0 %	75 %	0 %	554640012
7	NC_022603	CAGT	2	8	1026	1033	25 %	25 %	25 %	25 %	554640012
8	NC_022603	AAAG	2	8	1049	1056	75 %	0 %	25 %	0 %	554640012
9	NC_022603	GAAA	2	8	1100	1107	75 %	0 %	25 %	0 %	554640012
10	NC_022603	GAAG	2	8	1416	1423	50 %	0 %	50 %	0 %	554640012
11	NC_022603	ATTT	2	8	1953	1960	25 %	75 %	0 %	0 %	554639961
12	NC_022603	TTGA	2	8	2445	2452	25 %	50 %	25 %	0 %	554639962
13	NC_022603	ATCA	2	8	2658	2665	50 %	25 %	0 %	25 %	554639962
14	NC_022603	AGGG	2	8	2959	2966	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022603	GAAA	2	8	2984	2991	75 %	0 %	25 %	0 %	554639963
16	NC_022603	ATCA	2	8	3011	3018	50 %	25 %	0 %	25 %	554639963
17	NC_022603	TTTA	2	8	3409	3416	25 %	75 %	0 %	0 %	554639963
18	NC_022603	GAAT	2	8	3861	3868	50 %	25 %	25 %	0 %	554639963
19	NC_022603	AATC	2	8	3933	3940	50 %	25 %	0 %	25 %	554639963
20	NC_022603	GATT	2	8	3990	3997	25 %	50 %	25 %	0 %	554639963
21	NC_022603	GAAA	2	8	4713	4720	75 %	0 %	25 %	0 %	554639963
22	NC_022603	GAAT	2	8	5477	5484	50 %	25 %	25 %	0 %	554640013
23	NC_022603	GAAA	2	8	6297	6304	75 %	0 %	25 %	0 %	554640014
24	NC_022603	TTGG	2	8	6394	6401	0 %	50 %	50 %	0 %	554639964
25	NC_022603	GATC	2	8	6713	6720	25 %	25 %	25 %	25 %	554639964
26	NC_022603	ATGA	2	8	6723	6730	50 %	25 %	25 %	0 %	554639964
27	NC_022603	CCTT	2	8	6861	6868	0 %	50 %	0 %	50 %	554639964
28	NC_022603	AAAC	2	8	7085	7092	75 %	0 %	0 %	25 %	554639964
29	NC_022603	AATG	2	8	7402	7409	50 %	25 %	25 %	0 %	554639964
30	NC_022603	CAAA	2	8	7508	7515	75 %	0 %	0 %	25 %	554640015
31	NC_022603	CAAG	2	8	7579	7586	50 %	0 %	25 %	25 %	554640015
32	NC_022603	TATC	2	8	7801	7808	25 %	50 %	0 %	25 %	554640015
33	NC_022603	CAAC	2	8	7968	7975	50 %	0 %	0 %	50 %	554640015
34	NC_022603	AGGG	2	8	7987	7994	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022603	AAAC	2	8	8202	8209	75 %	0 %	0 %	25 %	554640016
36	NC_022603	ATCA	2	8	9200	9207	50 %	25 %	0 %	25 %	554639965
37	NC_022603	GAAA	2	8	9582	9589	75 %	0 %	25 %	0 %	554639965
38	NC_022603	AAGG	2	8	9974	9981	50 %	0 %	50 %	0 %	554639965
39	NC_022603	GTTA	2	8	10650	10657	25 %	50 %	25 %	0 %	554640018
40	NC_022603	TTTA	2	8	10938	10945	25 %	75 %	0 %	0 %	554640018
41	NC_022603	TATC	2	8	10983	10990	25 %	50 %	0 %	25 %	554640018
42	NC_022603	TAAA	2	8	11468	11475	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022603	AACG	2	8	11861	11868	50 %	0 %	25 %	25 %	554639966
44	NC_022603	CAAC	2	8	12054	12061	50 %	0 %	0 %	50 %	554639966
45	NC_022603	GATA	2	8	12128	12135	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022603	AAGA	2	8	12355	12362	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022603	AAAT	2	8	12590	12597	75 %	25 %	0 %	0 %	554639967
48	NC_022603	TTAT	2	8	12598	12605	25 %	75 %	0 %	0 %	554639967
49	NC_022603	AAGT	2	8	12930	12937	50 %	25 %	25 %	0 %	554639968
50	NC_022603	AGAA	2	8	14523	14530	75 %	0 %	25 %	0 %	554639968
51	NC_022603	ATTA	2	8	14538	14545	50 %	50 %	0 %	0 %	554639968
52	NC_022603	ATCG	2	8	14875	14882	25 %	25 %	25 %	25 %	554639968
53	NC_022603	GATT	2	8	15377	15384	25 %	50 %	25 %	0 %	554639969
54	NC_022603	TTAT	2	8	15552	15559	25 %	75 %	0 %	0 %	554639969
55	NC_022603	GATT	2	8	15579	15586	25 %	50 %	25 %	0 %	554639969
56	NC_022603	AAGA	2	8	15784	15791	75 %	0 %	25 %	0 %	554639970
57	NC_022603	ATGA	2	8	16071	16078	50 %	25 %	25 %	0 %	554639971
58	NC_022603	TTAT	2	8	16565	16572	25 %	75 %	0 %	0 %	554639971
59	NC_022603	CAAT	2	8	17466	17473	50 %	25 %	0 %	25 %	554639971
60	NC_022603	TTTA	2	8	18635	18642	25 %	75 %	0 %	0 %	554639972
61	NC_022603	TAAG	2	8	18845	18852	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022603	TTTG	2	8	18959	18966	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022603	AATT	2	8	18983	18990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022603	ATAA	2	8	19276	19283	75 %	25 %	0 %	0 %	554639973
65	NC_022603	CAAT	2	8	19289	19296	50 %	25 %	0 %	25 %	554639973
66	NC_022603	GAAA	2	8	19322	19329	75 %	0 %	25 %	0 %	554639973
67	NC_022603	CAAG	2	8	19418	19425	50 %	0 %	25 %	25 %	554639973
68	NC_022603	CTTT	2	8	19936	19943	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_022603	AAGT	2	8	19948	19955	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022603	TAAA	2	8	19956	19963	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022603	ATAG	2	8	20286	20293	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022603	AATT	2	8	20812	20819	50 %	50 %	0 %	0 %	554639975
73	NC_022603	TGGT	2	8	20943	20950	0 %	50 %	50 %	0 %	554639975
74	NC_022603	AAAT	2	8	21093	21100	75 %	25 %	0 %	0 %	554639975
75	NC_022603	AACA	2	8	21374	21381	75 %	0 %	0 %	25 %	554639975
76	NC_022603	TAAG	2	8	21897	21904	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022603	GAAT	2	8	21956	21963	50 %	25 %	25 %	0 %	554639976
78	NC_022603	ATCC	2	8	22710	22717	25 %	25 %	0 %	50 %	554639976
79	NC_022603	TCAA	2	8	22960	22967	50 %	25 %	0 %	25 %	554639977
80	NC_022603	AGAA	2	8	23011	23018	75 %	0 %	25 %	0 %	554639977
81	NC_022603	GAAA	3	12	23055	23066	75 %	0 %	25 %	0 %	554639977
82	NC_022603	TAAA	2	8	23087	23094	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022603	CTTG	2	8	23395	23402	0 %	50 %	25 %	25 %	554639978
84	NC_022603	AACA	2	8	23517	23524	75 %	0 %	0 %	25 %	554639978
85	NC_022603	TTCT	2	8	24600	24607	0 %	75 %	0 %	25 %	554639978
86	NC_022603	AACT	2	8	25223	25230	50 %	25 %	0 %	25 %	554639979
87	NC_022603	CTTT	3	12	25579	25590	0 %	75 %	0 %	25 %	554639980
88	NC_022603	AACG	2	8	25898	25905	50 %	0 %	25 %	25 %	554639980
89	NC_022603	AGAA	2	8	26370	26377	75 %	0 %	25 %	0 %	554639980
90	NC_022603	ATCA	2	8	26640	26647	50 %	25 %	0 %	25 %	554639980
91	NC_022603	GTTT	2	8	26683	26690	0 %	75 %	25 %	0 %	554639980
92	NC_022603	TAAT	2	8	26815	26822	50 %	50 %	0 %	0 %	554639980
93	NC_022603	GATA	2	8	27278	27285	50 %	25 %	25 %	0 %	554639981
94	NC_022603	AGAA	2	8	28031	28038	75 %	0 %	25 %	0 %	554639981
95	NC_022603	AATA	2	8	28085	28092	75 %	25 %	0 %	0 %	554639981
96	NC_022603	TAAA	2	8	28165	28172	75 %	25 %	0 %	0 %	554639981
97	NC_022603	CTTC	2	8	28808	28815	0 %	50 %	0 %	50 %	554639982
98	NC_022603	ATCC	2	8	29595	29602	25 %	25 %	0 %	50 %	554639983
99	NC_022603	ATTT	2	8	29742	29749	25 %	75 %	0 %	0 %	554639983
100	NC_022603	TTCA	2	8	29889	29896	25 %	50 %	0 %	25 %	554639983
101	NC_022603	GATT	2	8	30023	30030	25 %	50 %	25 %	0 %	554639983
102	NC_022603	TCAT	2	8	30142	30149	25 %	50 %	0 %	25 %	554639983
103	NC_022603	TTTC	2	8	30392	30399	0 %	75 %	0 %	25 %	554639983
104	NC_022603	AATT	2	8	31276	31283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022603	AATT	2	8	31676	31683	50 %	50 %	0 %	0 %	554639984
106	NC_022603	TTTC	2	8	31934	31941	0 %	75 %	0 %	25 %	554639984
107	NC_022603	ATTT	2	8	32036	32043	25 %	75 %	0 %	0 %	554639984
108	NC_022603	AATT	2	8	32439	32446	50 %	50 %	0 %	0 %	554639984
109	NC_022603	TAGT	2	8	32452	32459	25 %	50 %	25 %	0 %	554639984
110	NC_022603	TATT	2	8	32926	32933	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022603	TAGA	2	8	33392	33399	50 %	25 %	25 %	0 %	554639985
112	NC_022603	TTCT	2	8	33638	33645	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_022603	TTAT	2	8	33665	33672	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022603	ATTT	2	8	33947	33954	25 %	75 %	0 %	0 %	554639986
115	NC_022603	AAAG	2	8	34002	34009	75 %	0 %	25 %	0 %	554639986
116	NC_022603	AATA	2	8	34141	34148	75 %	25 %	0 %	0 %	554639986
117	NC_022603	AAGA	2	8	34513	34520	75 %	0 %	25 %	0 %	554639986
118	NC_022603	TAAG	2	8	34832	34839	50 %	25 %	25 %	0 %	554639986
119	NC_022603	TATT	2	8	34992	34999	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022603	ATTA	2	8	35033	35040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022603	TAAA	2	8	35120	35127	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022603	AAGT	2	8	35167	35174	50 %	25 %	25 %	0 %	554639987
123	NC_022603	ATTG	2	8	35278	35285	25 %	50 %	25 %	0 %	554639987
124	NC_022603	GTTA	2	8	35530	35537	25 %	50 %	25 %	0 %	554639987
125	NC_022603	AGCA	2	8	36274	36281	50 %	0 %	25 %	25 %	554639987
126	NC_022603	TAAT	2	8	36462	36469	50 %	50 %	0 %	0 %	554639987
127	NC_022603	CTTT	2	8	36527	36534	0 %	75 %	0 %	25 %	554639988
128	NC_022603	ATTG	2	8	36909	36916	25 %	50 %	25 %	0 %	554639988
129	NC_022603	ATGG	2	8	37496	37503	25 %	25 %	50 %	0 %	554639988
130	NC_022603	AAAT	2	8	37627	37634	75 %	25 %	0 %	0 %	554639988
131	NC_022603	ATTT	2	8	38021	38028	25 %	75 %	0 %	0 %	554639989
132	NC_022603	TTTA	2	8	38847	38854	25 %	75 %	0 %	0 %	554639989
133	NC_022603	AAAG	2	8	39064	39071	75 %	0 %	25 %	0 %	554639989
134	NC_022603	TATT	2	8	39294	39301	25 %	75 %	0 %	0 %	554639989
135	NC_022603	TAAA	2	8	39843	39850	75 %	25 %	0 %	0 %	554639990
136	NC_022603	ATTG	2	8	39916	39923	25 %	50 %	25 %	0 %	554639990
137	NC_022603	CTTA	2	8	40312	40319	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_022603	GTAT	2	8	41039	41046	25 %	50 %	25 %	0 %	554639991
139	NC_022603	ATTC	2	8	41113	41120	25 %	50 %	0 %	25 %	554639991
140	NC_022603	TTTA	2	8	41174	41181	25 %	75 %	0 %	0 %	554639991
141	NC_022603	GCAG	2	8	41360	41367	25 %	0 %	50 %	25 %	554639991
142	NC_022603	ATTA	2	8	41963	41970	50 %	50 %	0 %	0 %	554639992
143	NC_022603	CAGT	2	8	42114	42121	25 %	25 %	25 %	25 %	554639992
144	NC_022603	AGAA	2	8	42390	42397	75 %	0 %	25 %	0 %	554639992
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.