MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Carnobacterium sp. WN1359 plasmid pWNCR64

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022603	AGGG	2	8	2959	2966	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022603	AGGG	2	8	7987	7994	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022603	TAAA	2	8	11468	11475	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022603	GATA	2	8	12128	12135	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022603	AAGA	2	8	12355	12362	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022603	TAAG	2	8	18845	18852	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022603	TTTG	2	8	18959	18966	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022603	AATT	2	8	18983	18990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022603	CTTT	2	8	19936	19943	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_022603	AAGT	2	8	19948	19955	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022603	TAAA	2	8	19956	19963	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022603	ATAG	2	8	20286	20293	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022603	TAAG	2	8	21897	21904	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022603	TAAA	2	8	23087	23094	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022603	AATT	2	8	31276	31283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022603	TATT	2	8	32926	32933	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022603	TTCT	2	8	33638	33645	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_022603	TTAT	2	8	33665	33672	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022603	TATT	2	8	34992	34999	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022603	ATTA	2	8	35033	35040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022603	TAAA	2	8	35120	35127	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022603	CTTA	2	8	40312	40319	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_022603	ATAA	2	8	43169	43176	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022603	TTTA	2	8	44718	44725	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022603	AATG	2	8	44818	44825	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022603	ATAC	2	8	44852	44859	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_022603	TAAA	2	8	47433	47440	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022603	ACAT	2	8	47839	47846	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_022603	TATT	2	8	48868	48875	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022603	ATTT	2	8	49708	49715	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022603	TAAT	2	8	49835	49842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022603	ATAA	2	8	50758	50765	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022603	TTTA	2	8	50783	50790	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022603	ATAA	2	8	50800	50807	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022603	TGCA	2	8	50860	50867	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_022603	TTCT	2	8	50977	50984	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_022603	TTTG	2	8	51008	51015	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022603	AAAG	2	8	51163	51170	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022603	AAAC	2	8	51178	51185	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_022603	ACAT	2	8	51793	51800	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_022603	TTCA	2	8	52789	52796	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_022603	GTCA	2	8	54698	54705	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_022603	ATTA	2	8	54706	54713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022603	AATT	2	8	56822	56829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022603	AATT	2	8	60770	60777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022603	AACA	2	8	60883	60890	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_022603	ATTA	2	8	61674	61681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022603	ATAA	2	8	62304	62311	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022603	AAAT	2	8	62408	62415	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022603	GTTC	2	8	63351	63358	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_022603	AGAA	2	8	63376	63383	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022603	TTGA	2	8	63519	63526	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022603	AAGA	2	8	63925	63932	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022603	AAAG	2	8	64098	64105	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022603	TGAG	2	8	64222	64229	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022603	TTCC	2	8	64378	64385	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_022603	TATT	2	8	64401	64408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.