MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Carnobacterium sp. WN1359 plasmid pWNCR64

Total Repeats: 154

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022603	TTC	2	6	20	25	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_022603	GTA	2	6	108	113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022603	AAG	2	6	1568	1573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022603	AAG	2	6	1919	1924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022603	AGG	2	6	4947	4952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022603	AAT	2	6	11435	11440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022603	ATT	2	6	12151	12156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022603	ATT	2	6	12161	12166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022603	TAA	2	6	12306	12311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022603	GGT	2	6	15634	15639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022603	AGA	2	6	15684	15689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022603	ATT	2	6	16029	16034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022603	TAT	2	6	16046	16051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022603	AGG	2	6	16057	16062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022603	CTA	2	6	18278	18283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_022603	TAC	2	6	18297	18302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_022603	TTG	2	6	18333	18338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022603	TTC	2	6	18357	18362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_022603	ATT	2	6	18393	18398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022603	ATT	2	6	18424	18429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022603	TCT	2	6	18902	18907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_022603	TAA	2	6	19010	19015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022603	ATC	2	6	19930	19935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_022603	AGT	2	6	19970	19975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022603	GTG	2	6	20098	20103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022603	AAT	2	6	20180	20185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022603	AGA	2	6	20324	20329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022603	AGA	2	6	20341	20346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022603	AAT	2	6	20397	20402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022603	AAG	2	6	21941	21946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022603	ATT	2	6	23096	23101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022603	TGA	2	6	23102	23107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022603	TTA	2	6	23120	23125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022603	ATT	2	6	23132	23137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022603	TGA	2	6	23226	23231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022603	TCT	2	6	23248	23253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_022603	AAT	2	6	23277	23282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022603	GTA	2	6	23329	23334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022603	ATG	2	6	26972	26977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022603	ATT	2	6	27008	27013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022603	ATT	2	6	27065	27070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022603	GAT	2	6	27171	27176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022603	TCC	2	6	30831	30836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_022603	AAT	2	6	30932	30937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022603	TAT	2	6	31022	31027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022603	TTA	2	6	31147	31152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022603	AAT	2	6	31198	31203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022603	CTT	2	6	31222	31227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_022603	ATT	2	6	31270	31275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022603	AGA	2	6	31287	31292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022603	TTA	2	6	33844	33849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022603	ATA	2	6	33853	33858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022603	TTA	2	6	34925	34930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022603	ACA	2	6	34981	34986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_022603	TAT	2	6	35106	35111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022603	AGA	2	6	40255	40260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022603	TAG	2	6	40320	40325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022603	GGA	2	6	40564	40569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022603	CTC	2	6	42713	42718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_022603	GAA	2	6	42758	42763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022603	ATT	2	6	42779	42784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022603	ATT	2	6	42842	42847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022603	TAA	2	6	43075	43080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022603	AAT	2	6	43094	43099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022603	CCT	2	6	44604	44609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_022603	ATT	2	6	44701	44706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022603	GAA	2	6	44917	44922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022603	AAG	2	6	44932	44937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022603	CCT	2	6	45672	45677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_022603	AAT	2	6	45732	45737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022603	ATT	2	6	46173	46178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022603	TGT	2	6	47070	47075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022603	CTA	2	6	47223	47228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_022603	GTA	2	6	47395	47400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022603	TAA	2	6	47421	47426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022603	TAT	2	6	47498	47503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022603	TAG	2	6	47529	47534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022603	CGC	2	6	47603	47608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_022603	TGG	2	6	47691	47696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022603	ACA	3	9	47782	47790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_022603	CGA	2	6	47792	47797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_022603	CAC	2	6	47919	47924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_022603	GGA	2	6	47999	48004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022603	ATA	2	6	48037	48042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022603	TAA	2	6	48083	48088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022603	ATT	2	6	48101	48106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022603	ACA	2	6	48114	48119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_022603	TAA	2	6	48140	48145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022603	AGG	2	6	48183	48188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022603	GGA	2	6	48904	48909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022603	CCA	2	6	49766	49771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_022603	TGG	2	6	49797	49802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022603	ATA	2	6	49846	49851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022603	TAA	3	9	50702	50710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022603	CTA	2	6	50749	50754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_022603	TTA	2	6	50834	50839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022603	GAA	2	6	50921	50926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022603	ATT	2	6	51039	51044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022603	TGA	2	6	51095	51100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022603	AGG	2	6	51153	51158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022603	AGG	2	6	51195	51200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022603	TGA	2	6	51872	51877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022603	GCA	2	6	51989	51994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_022603	AAC	2	6	52719	52724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_022603	AAG	2	6	54092	54097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022603	TAC	2	6	54144	54149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_022603	CTG	2	6	54183	54188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_022603	GAA	2	6	54485	54490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022603	AAG	2	6	56642	56647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022603	AGA	2	6	56692	56697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022603	TAA	3	9	56853	56861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022603	GTT	2	6	57663	57668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022603	TAT	2	6	57677	57682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022603	CTT	2	6	57778	57783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_022603	TCT	2	6	57787	57792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_022603	CGA	2	6	57884	57889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_022603	AAT	2	6	60341	60346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022603	GAT	2	6	60520	60525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022603	ACC	2	6	60752	60757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_022603	GGT	2	6	60833	60838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022603	TCC	2	6	62257	62262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_022603	ATT	2	6	62370	62375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022603	TAC	2	6	62377	62382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_022603	ATT	2	6	62541	62546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022603	TTG	2	6	62848	62853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022603	TGG	2	6	62863	62868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022603	ATG	2	6	62986	62991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022603	AAG	2	6	62992	62997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022603	CAA	2	6	63078	63083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_022603	ATT	2	6	63112	63117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022603	GAA	2	6	63177	63182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022603	AGC	2	6	63184	63189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_022603	AGC	2	6	63290	63295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_022603	GAA	2	6	63324	63329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022603	AAG	2	6	63441	63446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022603	AGA	2	6	63497	63502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022603	TAG	2	6	63541	63546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022603	TAT	2	6	63597	63602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022603	AGA	2	6	63689	63694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022603	ACT	2	6	63704	63709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_022603	CAA	2	6	63723	63728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_022603	GTT	2	6	63753	63758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022603	GAA	2	6	63789	63794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022603	AGT	2	6	63818	63823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022603	ATG	2	6	63967	63972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022603	CTT	2	6	63994	63999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_022603	ATT	2	6	64054	64059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022603	AGA	2	6	64127	64132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022603	CAA	2	6	64184	64189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_022603	TCT	2	6	64209	64214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_022603	CAA	2	6	64365	64370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_022603	TTG	2	6	64392	64397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_022603	CAG	2	6	64416	64421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_022603	GAA	2	6	64452	64457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.