MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Carnobacterium sp. WN1359 plasmid pWNCR47

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022602	AATGCA	2	12	199	210	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_022602	AAGAAA	2	12	1394	1405	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022602	TAAAAG	2	12	4045	4056	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	554639514
4	NC_022602	AAAACG	2	12	4742	4753	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	554639515
5	NC_022602	AAATAT	2	12	5717	5728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554639515
6	NC_022602	ACGATA	2	12	9067	9078	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	554639541
7	NC_022602	CTGAAG	2	12	12096	12107	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	554639544
8	NC_022602	TTTAAT	2	12	12181	12192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554639544
9	NC_022602	CTATCT	2	12	16162	16173	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	554639546
10	NC_022602	TAAACA	2	12	18652	18663	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	554639520
11	NC_022602	AAAGAG	2	12	23375	23386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554639550
12	NC_022602	CTTTTT	2	12	23804	23815	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	554639550
13	NC_022602	AATTTT	2	12	24137	24148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022602	TAGAAT	2	12	27565	27576	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	554639551
15	NC_022602	TGAAGA	2	12	27890	27901	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	554639551
16	NC_022602	TTAATA	2	12	29742	29753	50 %	50 %	0 %	0 %	554639551
17	NC_022602	AAATAA	2	12	30905	30916	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	554639551
18	NC_022602	GATTGA	2	12	36094	36105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022602	TTTGGC	2	12	40518	40529	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	554639531
20	NC_022602	GAAGGC	2	12	41546	41557	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	554639532
21	NC_022602	AGAAAA	2	12	43244	43255	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	554639534
22	NC_022602	GATAAA	2	12	45379	45390	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	554639557

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.