MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Carnobacterium sp. WN1359 plasmid pWNCR47

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022602	TACTG	2	10	1704	1713	20 %	40 %	20 %	20 %	554639538
2	NC_022602	AAGAA	2	10	2997	3006	80 %	0 %	20 %	0 %	554639512
3	NC_022602	AACGA	2	10	4689	4698	60 %	0 %	20 %	20 %	554639515
4	NC_022602	AAATC	2	10	5560	5569	60 %	20 %	0 %	20 %	554639515
5	NC_022602	TTTGA	2	10	5748	5757	20 %	60 %	20 %	0 %	554639515
6	NC_022602	AGAAA	2	10	6125	6134	80 %	0 %	20 %	0 %	554639515
7	NC_022602	TTCTC	2	10	7047	7056	0 %	60 %	0 %	40 %	554639540
8	NC_022602	TCAAA	2	10	9665	9674	60 %	20 %	0 %	20 %	554639542
9	NC_022602	AAAGA	2	10	9684	9693	80 %	0 %	20 %	0 %	554639542
10	NC_022602	CGCTT	2	10	9821	9830	0 %	40 %	20 %	40 %	554639542
11	NC_022602	CGAAC	2	10	11270	11279	40 %	0 %	20 %	40 %	554639517
12	NC_022602	TCTTG	2	10	12400	12409	0 %	60 %	20 %	20 %	554639544
13	NC_022602	GGCGT	2	10	14459	14468	0 %	20 %	60 %	20 %	554639518
14	NC_022602	AGTTG	2	10	14610	14619	20 %	40 %	40 %	0 %	554639519
15	NC_022602	TAAAT	2	10	16374	16383	60 %	40 %	0 %	0 %	554639546
16	NC_022602	AGAAA	2	10	17020	17029	80 %	0 %	20 %	0 %	554639547
17	NC_022602	TTTGT	2	10	18321	18330	0 %	80 %	20 %	0 %	554639547
18	NC_022602	AGAAA	2	10	18612	18621	80 %	0 %	20 %	0 %	554639547
19	NC_022602	AACTA	2	10	19930	19939	60 %	20 %	0 %	20 %	554639520
20	NC_022602	CACTT	2	10	21895	21904	20 %	40 %	0 %	40 %	554639521
21	NC_022602	CATAA	2	10	22081	22090	60 %	20 %	0 %	20 %	554639521
22	NC_022602	CGTTG	2	10	22389	22398	0 %	40 %	40 %	20 %	554639521
23	NC_022602	TTGAT	2	10	25448	25457	20 %	60 %	20 %	0 %	554639523
24	NC_022602	TTTGA	2	10	26184	26193	20 %	60 %	20 %	0 %	554639523
25	NC_022602	AAATT	2	10	27322	27331	60 %	40 %	0 %	0 %	554639551
26	NC_022602	ATTTA	2	10	28363	28372	40 %	60 %	0 %	0 %	554639551
27	NC_022602	TTTAT	2	10	28835	28844	20 %	80 %	0 %	0 %	554639551
28	NC_022602	TTGAA	2	10	29158	29167	40 %	40 %	20 %	0 %	554639551
29	NC_022602	AGTAA	2	10	29223	29232	60 %	20 %	20 %	0 %	554639551
30	NC_022602	ATTGT	2	10	29370	29379	20 %	60 %	20 %	0 %	554639551
31	NC_022602	ATAGC	2	10	29947	29956	40 %	20 %	20 %	20 %	554639551
32	NC_022602	TTTGA	2	10	30192	30201	20 %	60 %	20 %	0 %	554639551
33	NC_022602	CATGA	2	10	33897	33906	40 %	20 %	20 %	20 %	554639526
34	NC_022602	GTGAA	2	10	36059	36068	40 %	20 %	40 %	0 %	554639527
35	NC_022602	TAAAA	2	10	37398	37407	80 %	20 %	0 %	0 %	554639553
36	NC_022602	AGATG	2	10	39388	39397	40 %	20 %	40 %	0 %	554639529
37	NC_022602	TAATT	2	10	39922	39931	40 %	60 %	0 %	0 %	554639530
38	NC_022602	ATTCT	2	10	41014	41023	20 %	60 %	0 %	20 %	554639554
39	NC_022602	TTAAA	2	10	42662	42671	60 %	40 %	0 %	0 %	554639533
40	NC_022602	GAAAA	2	10	42712	42721	80 %	0 %	20 %	0 %	554639533
41	NC_022602	GAAAA	2	10	44230	44239	80 %	0 %	20 %	0 %	554639557
42	NC_022602	TAAAT	2	10	45312	45321	60 %	40 %	0 %	0 %	554639557

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.